Uma extensão do ncRNA-Agents : um estudo de caso para o gênero Oryza do reino Plantae

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Andrade, Rafael B
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Monografias da UnB
Texto Completo: http://bdm.unb.br/handle/10483/13887
Resumo: Monografia (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2015.
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spelling Andrade, Rafael BWalter, Maria Emilia Machado TellesANDRADE, Rafael B. Uma extensão do ncRNA-Agents: um estudo de caso para o gênero Oryza do reino Plantae. 2015. xii, 226 f., il. Monografia (Bacharelado em Engenharia da Computação)—Universidade de Brasília, Brasília, 2015.http://bdm.unb.br/handle/10483/13887Monografia (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2015.Neste trabalho, criamos uma nova instância do ncRNA-Agents, um sistema de anotação de RNAs não-codificadores (ncRNAs) baseado em sistemas multiagentes. Nesta versão, o usuário pode anotar ncRNAs de plantas, usando sequências de cDNA dos organismos Oryza barthii, Oryza brachyantha, Oryza glaberrima, Oryza glumaepatula, Oryza longistaminata, Oryza meridionalis, Oryza nivara, Oryza punctata, Oryza rufipogon e Oryza sativa Indica. Além disso, foi incluído o software snoReport para anotar snoRNAs (C/D box e H/ACA box), um tipo específico de ncRNA. Por fim desenvolvemos um estudo de caso para a espécieOryza sativa Japonica.Submitted by Nayara Silva (nayarasilva@bce.unb.br) on 2016-05-16T15:55:41Z No. of bitstreams: 1 2015_RafaelB.Andrade.pdf: 6519948 bytes, checksum: eeaab56d4509efabc2b5e77d858c40f7 (MD5)Approved for entry into archive by Ruthlea Nascimento(ruthlea.nascimento@gmail.com) on 2016-07-28T18:03:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_RafaelB.Andrade.pdf: 6519948 bytes, checksum: eeaab56d4509efabc2b5e77d858c40f7 (MD5)Made available in DSpace on 2016-07-28T18:03:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_RafaelB.Andrade.pdf: 6519948 bytes, checksum: eeaab56d4509efabc2b5e77d858c40f7 (MD5)In this work, we create a new instance of ncRNA-Agents, an annotation system of noncoding RNA’s (ncRNA’s) based on multiagent systems. In this version, the user can annotate plant ncRNAs using the sequences of cDNA of Oryza barthii Oryza brachyantha, Oryza glaberrima, Oryza glumaepatula,Oryza longistaminata, Oryza meridionalis, Oryza nivara, Oryza punctata, Oryza rufipogon and Oryza sativa Indica as reference. Furthermore, the software snoReport was included to annotate snoRNAs (C/D and box H/ACA box), a specific type of order ncRNA. Finally, we developed a case study for the species Oryza sativa Japonica.Uma extensão do ncRNA-Agents : um estudo de caso para o gênero Oryza do reino Plantaeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis2016-07-28T18:03:37Z2016-07-28T18:03:37Z2016-07-28T18:03:37Z2015RNAs não-codificadoresBioinformáticaSistema multiagenteBiologia computacionalinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Biblioteca Digital de Monografias da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNBORIGINAL2015_RafaelB.Andrade.pdf2015_RafaelB.Andrade.pdfapplication/pdf6519948http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/13887/1/2015_RafaelB.Andrade.pdfeeaab56d4509efabc2b5e77d858c40f7MD51CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain46http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/13887/2/license_url6f1da3ff281999354d4abd56d1551468MD52license_textlicense_textapplication/octet-stream0http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/13887/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53license_rdflicense_rdfapplication/octet-stream21889http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/13887/4/license_rdf5f21d45308ffc58e8d263280cb61c64dMD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1847http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/13887/5/license.txtd5e07009b90752814894fce8f754abbeMD5510483/138872016-07-28 15:07:58.856oai:bdm.unb.br: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Biblioteca Digital de Monografiahttps://bdm.unb.br/PUBhttp://bdm.unb.br/oai/requestbdm@bce.unb.br||patricia@bce.unb.bropendoar:115712016-07-28T18:07:58Biblioteca Digital de Monografias da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
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