Diversidade e identificação de fungos fitopatogênicos em frutos não convencionais no Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Rildo Alexandre Fernandes da
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UnB
Texto Completo: http://repositorio2.unb.br/jspui/handle/10482/49151
Resumo: Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2023.
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spelling Diversidade e identificação de fungos fitopatogênicos em frutos não convencionais no BrasilCerradoFilogeniaFungos fitopatogênicosFrutasTese (doutorado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2023.Frutos não convencionais à agricultara brasileira, como Syzygium jambos (Myrtaceae) apesar de possuir significante importância na medicina tradicional, possuem um número raro de estudos focados em doenças que podem afetar esta espécie. Gêneros de fungos das famílias Nectriaceae, Bionectriaceae e Botryosphaeriaceae são frequentemente encontrados como fitopatógenos de plantas, relatados como associados a doenças de importância agrícola e florestal mas raramente associados a plantas nativas ou ao sintomas de podridão de frutos. A identificação desses fungos é desafiadora, especialmente o grupo Calonectria-like (Nectriaceae) por englobar fungos relacionados filogeneticamente e morfologicamente ao gênero Calonectria. Com isso técnicas moleculares foram implementadas para o grupo a partir de 1995 com a submissão sequências depositadas no Genbank, que se tornou um valoroso recurso para os pesquisadores deste grupo. O crescente volume de dados na plataforma dificulta ou impossibilita estudos de diversidade de hospedeiros, localidade e dispersão geográfica, devido à falta de uniformidade dos dados depositados. O presente estudo teve como objetivo fazer uma meta-análise do banco de dados para gêneros de Calonectria-like, além de identificar por análises morfofilogeneticamente os isolados de Calonectria-like, Clonostachys e Neofusicoccum obtidos a partir de frutos nos estados de Distrito Federal, Goiás, Minas Gerais, Paraná, Pernambuco, Santa Catarina e São Paulo. Com a meta-análise revelou disparidades na amostragem de regiões genéticas, com os genes tef (n=5.125) e tub (n=5.287) os mais frequentemente depositados. Observando o “Efeito Matryoshka” por haver uma superrepresentação de isolados, devido a transferência entre laboratórios. Os metadados revelaram uma perda de 21.7% de dados de localidade, 88% para substrato/hospedeiros. No entanto os metadados permitiram identificar que o isolamento geográfico dos gêneros Xenocylindrocladium (América do Sul) e Curvicladiella (Ásia), além de Brasil (n=64) e China (n=51) apresentarem maior diversidade de espécies destes gêneros. Foram obtidos 86 isolados, os quais foram submetidos a análises morfo-filogenéticas, segregando dentro dos gêneros Calonectria (n=15), Clonostachys (n=8), Cylindrocladiella (n=28), Gliocladiopsis (n=18), Gliocephalotrichum (n=2) e Neofusicoccum (n=15). Desse total, sete espécies conhecidas foram documentadas enquanto seis táxons serão propostos como novas espécies. As espécies Cylindrocladiella vitis, Gliocladiopsis hennebertii e Neofusicoccum occulatum e N. umdonicola são relatadas pela primeira vez no Brasil. Enquanto novas combinações de hospedeiros foram registradas para Ch. Pseudocholeuca, Ch. rogersoniana, Cy. infestans, Cy. lageniformis, Cy. peruviana, Gliocephalotrichum simplex, Gliocladiopsis tenuis, N. batangarum, e N. parvum em frutos de Dypsis madagascariensis, Eugenia aggregata, Eugenia involucrata, Euterpe edulis, Spondia mombin, Syzygium jambos e Terminalia catappa. Esse estudo demonstra a necessidade de levantamentos abrangentes sobre a diversidade de espécies fungos em plantas nativas e alerta sobre o risco de transmissão para as plantas de interesse econômico.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES).Non-conventional fruits in Brazilian agriculture, such as Syzygium jambos (Myrtaceae), despite their significant importance in traditional medicine, have scarce studies focused on diseases that can affect this species. Genera of fungi from the families Nectriaceae, Bionectriaceae, and Botryosphaeriaceae are frequently found as plant pathogens, associated with diseases of agricultural and forestry importance but rarely associated with native plants or fruit rot symptoms. The identification of these fungi is challenging, especially the Calonectria-like group (Nectriaceae) that includes phylogenetically and morphologically related fungi to the genus Calonectria. Molecular techniques have been implemented for this group since 1995 with the submission of sequences deposited in the GenBank, which has become a valuable resource for researchers in this field. The increasing volume of data in the platform hinders or prevents studies on host diversity, location, and geographical dispersion due to the lack of data uniformity. This study aimed to perform a meta-analysis of the database for Calonectria-like genera, as well as to identify morpho-phylogenetically the isolates of Calonectria-like, Clonostachys, and Neofusicoccum obtained from fruits in the states of Federal District, Goiás, Minas Gerais, Paraná, Pernambuco, Santa Catarina, and São Paulo. The meta-analysis revealed disparities in the sampling of genetic regions, with the genes tef (n=5,125) and tub (n=5,287) being the most frequently deposited. The "Matryoshka Effect" was observed, indicating an over-representation of isolates due to transfers between laboratories. The metadata revealed a loss of 21.7% of location data and 88% of substrate/host data. However, the metadata allowed for the identification of the geographic isolation of the genera Xenocylindrocladium (South America) and Curvicladiella (Asia), with Brazil (n=64) and China (n=51) presenting a higher species diversity of these genera. A total of 86 isolates were obtained, which were subjected to morpho-phylogenetic analyses, segregating into the genera Calonectria (n=15), Clonostachys (n=8), Cylindrocladiella (n=28), Gliocladiopsis (n=18), Gliocephalotrichum (n=2), and Neofusicoccum (n=15). Among these, seven known species were documented, while six taxa are proposed as new species. The species Cylindrocladiella vitis, Gliocladiopsis hennebertii, Neofusicoccum occulatum, and N. umdonicola are reported for the first time in Brazil. Furthermore, new host combinations were recorded for Ch. pseudocholeuca, Ch. rogersoniana, Cy. infestans, Cy. lageniformis, Cy. peruviana, Gliocephalotrichum simplex, Gliocladiopsis tenuis, N. batangarum, and N. parvum in fruits of Dypsis madagascariensis, Eugenia aggregata, Eugenia involucrata, Euterpe edulis, Spondia mombin, Syzygium jambos, and Terminalia catappa. This study demonstrates the need for comprehensive surveys on the diversity of fungal species in native plants and highlights the risk of transmission to economically important plants.Instituto de Ciências Biológicas (IB)Departamento de Fitopatologia (IB FIT)Programa de Pós-Graduação em FitopatologiaPinho, Danilo BatistaSilva, Rildo Alexandre Fernandes da2024-07-24T13:24:49Z2024-07-24T13:24:49Z2024-07-242023-07-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfSILVA, Rildo Alexandre Fernandes da. Diversidade e identificação de fungos fitopatogênicos em frutos não convencionais no Brasil. 2023. 282 f., il. Tese (Doutorado em Fitopatologia) — Universidade de Brasília, Brasília, 2023.http://repositorio2.unb.br/jspui/handle/10482/49151porA concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2024-07-24T13:24:49Zoai:repositorio.unb.br:10482/49151Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2024-07-24T13:24:49Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
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