Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Souza, Jamile Mendes de
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UnB
Texto Completo: https://repositorio.unb.br/handle/10482/43126
Resumo: Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2021.
id UNB_17fab09616e084a692c144b532eb12b4
oai_identifier_str oai:repositorio.unb.br:10482/43126
network_acronym_str UNB
network_name_str Repositório Institucional da UnB
repository_id_str
spelling Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no BrasilEpidemiologiaGado de cortePastagensMineirãoStylomovirusTese (doutorado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2021.No Brasil, as culturas forrageiras representam grandes áreas de pastagens tropicais para alimentação do gado. Estas pastagens podem ser naturais ou plantadas e são compostas por gramíneas e leguminosas forrageiras. O uso de Stylosanthes spp. (leguminosa) têm aumentado no Brasil devido ao seu valor nutricional e por apresentar grande potencial na fixação de nitrogênio. Nos últimos anos, sintomas de mosaico semelhantes àqueles causados por infecções virais foram observados no campo, indicando que esta leguminosa forrageira pode ser suscetível a esses patógenos. Amostras de Stylosanthes guianensis cv. Mineirão apresentando sintomas típicos de vírus foram coletadas e submetidas ao sequenciamento de alto desempenho (HTS). Resultados obtidos pelo sequenciamento nessas amostras sintomáticas de estilosantes oriundas do campo experimental da Embrapa Gado de Corte mostraram a presença de três novos vírus pertencentes à família Potyviridae, os “styloviruses”. Simultaneamente, foi feita a montagem dos contigs e então, desenvolvidas ferramentas de detecção por RT-PCR a partir das sequências consenso obtidas via HTS. Os fragmentos genômicos foram amplificados e sequenciados pelo método Sanger e análises filogenéticas comparativas de nucleotídeos (nt) e aminoácidos (aa) das proteínas virais com base na poliproteína codificada pelos diferentes vírus foram realizadas. Essas análises demonstraram que estes vírus representam novas espécies dentro da família e foram tentativamente nomeados como “Stylosanthes mosaic-associated virus 1” (StyMaV-1), “Stylosanthes mosaic-associated virus 2” (StyMaV-2) e “Stylosanthes yellow mosaic virus” (StyYMV). Baseado no critério taxonômico de demarcação de espécies os vírus StyMaV-1 e StyMaV-2 pertencem a um novo gênero dentro da família Potyviridae (tentativamente denominado “Stylomovirus”) e o StyYMV encontra-se dentro de um gênero já existente (Roymovirus). Análises filogenéticas mostraram que StyMaV-1 e StyMaV-2 estão mais relacionados com o Blackberry virus y (Brambyvirus) e o StyYMV está mais relacionado com o Rose yellow mosaic virus (Roymovirus) de acordo com a identidade das sequências de nt e aa da capa proteica (CP). Além da caracterização molecular e análise filogenética, os resultados alcançados até o presente, demonstraram que os novos vírus caracterizados são transmitidos por mosca branca (MEAM 1) e os vetores construídos permitiram a expressão eficiente de proteínas virais acopladas a marcadores específicos para estudo de interações de proteínas virais e celulares in vivo.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES).In Brazil, forage crops represent large areas of tropical pasture for cattle feeding. These pastures can be natural or planted and are composed of grasses and forage legumes. The use of Stylosanthes spp. (legume) has increased in Brazil because of its nutritional value and of its great potential in the nitrogen fixation. In the last years, virus-like mosaic symptoms were observed in the field, indicating that this forage legume may be susceptible to these pathogens. Samples of Stylosanthes guianensis cv. Mineirão presenting typical virus symptoms were collected and submitted to high performance nucleotide sequencing. Results obtained by sequencing in these symptomatic samples of “estilosantes” from the experimental field of Embrapa Beef Cattle detected the presence of three new viruses belonging to the Potyviridae family, the “styloviruses”. Simultaneously, the contigs were assembled and then RT-PCR detection tools were developed from the HTS consensus sequences. The fragments were amplified and sequenced by the Sanger method and comparative phylogenetic analyzes of nucleotides (nt) and amino acids (aa) of the viral proteins based on the polyprotein were performed. These analyzes have demonstrated that these viruses represent new species within the family and have been tentatively named “Stylosanthes mosaic-associated virus 1” (StyMaV1), “Stylosanthes mosaic-associated virus 2” (StyMaV-2) and “Stylosanthes yellow mosaic virus” (StyYMV). Based on the taxonomic criterion of species demarcation the StyMaV-1 and StyMaV-2 viruses belong to a new genus within the family Potyviridae (tentatively denoted Stylomovirus) and StyYMV is within an existing genus (Roymovirus). Phylogenetic analyzes have shown that StyMaV-1 and StyMaV-2 are more related to the Blackberry Virus Y (Brambyvirus) and StyYMV is more related to the Rose Yellow Mosaic Virus (Roymovirus) according to the identity of the nt and aa sequences of the coat protein (CP). In addition to the the molecular characterization and phylogenital studies, the results obtained so far, demonstrated that the new viruses characterized are transmitted by whitefly (MEAM 1) and the constructed vectors allowed the efficient expression of viral proteins coupled to specific markers for the study of viral and cellular protein interactions in vivo.Resende, Renato de OliveiraSouza, Jamile Mendes de2022-03-25T18:47:45Z2022-03-25T18:47:45Z2022-03-252021-12-10info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfSOUZA, Jamile Mendes de. Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil. 2021. 157 f., il. Tese (Doutorado em Biologia Molecular) — Universidade de Brasília, Brasília, 2021.https://repositorio.unb.br/handle/10482/43126A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições:Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2023-07-08T00:00:57Zoai:repositorio.unb.br:10482/43126Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2023-07-08T00:00:57Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
dc.title.none.fl_str_mv Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil
title Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil
spellingShingle Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil
Souza, Jamile Mendes de
Epidemiologia
Gado de corte
Pastagens
Mineirão
Stylomovirus
title_short Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil
title_full Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil
title_fullStr Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil
title_full_unstemmed Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil
title_sort Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil
author Souza, Jamile Mendes de
author_facet Souza, Jamile Mendes de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Resende, Renato de Oliveira
dc.contributor.author.fl_str_mv Souza, Jamile Mendes de
dc.subject.por.fl_str_mv Epidemiologia
Gado de corte
Pastagens
Mineirão
Stylomovirus
topic Epidemiologia
Gado de corte
Pastagens
Mineirão
Stylomovirus
description Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2021.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-12-10
2022-03-25T18:47:45Z
2022-03-25T18:47:45Z
2022-03-25
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv SOUZA, Jamile Mendes de. Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil. 2021. 157 f., il. Tese (Doutorado em Biologia Molecular) — Universidade de Brasília, Brasília, 2021.
https://repositorio.unb.br/handle/10482/43126
identifier_str_mv SOUZA, Jamile Mendes de. Estudos biológicos e moleculares de vírus da família Potyviridae infectando leguminosas forrageiras no Brasil. 2021. 157 f., il. Tese (Doutorado em Biologia Molecular) — Universidade de Brasília, Brasília, 2021.
url https://repositorio.unb.br/handle/10482/43126
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UnB
instname:Universidade de Brasília (UnB)
instacron:UNB
instname_str Universidade de Brasília (UnB)
instacron_str UNB
institution UNB
reponame_str Repositório Institucional da UnB
collection Repositório Institucional da UnB
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)
repository.mail.fl_str_mv repositorio@unb.br
_version_ 1814508163713466368

Registros relacionados