Análise da afinidade molecular do medicamento Atazanavir frente à proteína-chave 3CLPRO do SARS-CoV-2
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Data de Publicação: | 2020 |
Outros Autores: | , , |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UnB |
Texto Completo: | https://repositorio.unb.br/handle/10482/39927 |
Resumo: | Em Wuhan, China, ocorreu um surto de pneumonia decorrente de infecções por SARSCoV-2, que até o dia 28 de junho de 2020 já infectou cerca de 10.012.244 pessoas, levando 499.342 a óbito. Diante disso, ainda não existe tratamento para essa doença. Assim, este estudo teve como objetivo elucidar a melhor orientação de ajuste de encaixe e afinidade molecular do medicamento atazanavir frente à proteína-chave 3CLpro do SARS-CoV-2. O acoplamento foi realizado pelo software Autodock Tools. A proteína 3CLpro foi considerada rígida e o atazanavir flexível. O algoritmo genético lamarckiano com busca global e pseudo-Solis e Wets com busca local foram adotados para este estudo. Foi elucidado forte afinidade do atazanavir ao se ligar à proteína 3CLpro, apresentando energia livre de ligação de -6,47 Kcal.mol-1 e constante de inibição de 18,2 µM. Mostrando possuir potencial biológico, sendo necessária análise in vitro para elucidar sua ação inibitória frente a células do SARS-CoV-2. |
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Análise da afinidade molecular do medicamento Atazanavir frente à proteína-chave 3CLPRO do SARS-CoV-2Analysis of the molecular affinity of the drug Atazanavir against the key protein 3CLPRO of SARS-CoV-2SARS-CoV-2Covid-19CoronavírusAcoplamento molecularEpidemiasEm Wuhan, China, ocorreu um surto de pneumonia decorrente de infecções por SARSCoV-2, que até o dia 28 de junho de 2020 já infectou cerca de 10.012.244 pessoas, levando 499.342 a óbito. Diante disso, ainda não existe tratamento para essa doença. Assim, este estudo teve como objetivo elucidar a melhor orientação de ajuste de encaixe e afinidade molecular do medicamento atazanavir frente à proteína-chave 3CLpro do SARS-CoV-2. O acoplamento foi realizado pelo software Autodock Tools. A proteína 3CLpro foi considerada rígida e o atazanavir flexível. O algoritmo genético lamarckiano com busca global e pseudo-Solis e Wets com busca local foram adotados para este estudo. Foi elucidado forte afinidade do atazanavir ao se ligar à proteína 3CLpro, apresentando energia livre de ligação de -6,47 Kcal.mol-1 e constante de inibição de 18,2 µM. Mostrando possuir potencial biológico, sendo necessária análise in vitro para elucidar sua ação inibitória frente a células do SARS-CoV-2.In Wuhan, China, there was an outbreak of pneumonia due to SARS-CoV2 infections, which by June 28, 2020 had already infected about 10,012,244 people, leading to 499,342 deaths. Therefore, there is still no treatment for this disease. Thus, this study aimed to elucidate the best fit adjustment and molecular affinity orientation of the drug atazanavir against the key protein 3CLpro from SARS-CoV-2. The coupling was performed using the Autodock Tools software. The 3CLpro protein was considered rigid and atazanavir flexible. The Lamarckian genetic algorithm with global search and pseudo-Solis and Wets with local search were adopted for this study. A strong affinity of atazanavir when binding to the 3CLpro protein was elucidated, presenting a free binding energy of -6.47 Kcal.mol-1 and an inhibition constant of 18.2 µM. Showing to have biological potential, being necessary an in vitro analysis to elucidate its inhibitory action against SARS-CoV-2 cells.Instituto de Ciências Biológicas (IB)Departamento de Genética e Morfologia (IB GEM)Editora Inovar2021-01-19T19:31:51Z2021-01-19T19:31:51Z2020Parte de livro ou capítulo de livroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfARAÚJO, Joabe Lima et al. Análise da afinidade molecular do medicamento Atazanavir frente à proteína-chave 3CLPRO do SARS-CoV-2. In: OLIVEIRA, Guilherme Antônio Lopes de; SOUZA, Liliane Pereira de (org.). A sociedade em tempos de Covid-19. Campo Grande: Editora Inovar, 2020. p. 34-39. DOI: 10.36926/editorainovar-978-65-86212-48-8. Disponível em: https://www.editorainovar.com.br/livros-academicos/. Acesso em: 19 jan. 2021.https://repositorio.unb.br/handle/10482/3992710.36926/editorainovar-978-65-86212-48-8Copyright © dos autores e autoras. Todos os direitos garantidos. Este é um livro publicado em acesso aberto, que permite uso, distribuição e reprodução em qualquer meio, sem restrições desde que sem fins comerciais e que o trabalho original dos autores e autoras seja corretamente citado.info:eu-repo/semantics/openAccessAraújo, Joabe LimaSousa, Alice de OliveiraSousa, Lucas Aires deSantos, Gardênia Taveiraporreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2023-06-12T10:30:30Zoai:repositorio.unb.br:10482/39927Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2023-06-12T10:30:30Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false |
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Em Wuhan, China, ocorreu um surto de pneumonia decorrente de infecções por SARSCoV-2, que até o dia 28 de junho de 2020 já infectou cerca de 10.012.244 pessoas, levando 499.342 a óbito. Diante disso, ainda não existe tratamento para essa doença. Assim, este estudo teve como objetivo elucidar a melhor orientação de ajuste de encaixe e afinidade molecular do medicamento atazanavir frente à proteína-chave 3CLpro do SARS-CoV-2. O acoplamento foi realizado pelo software Autodock Tools. A proteína 3CLpro foi considerada rígida e o atazanavir flexível. O algoritmo genético lamarckiano com busca global e pseudo-Solis e Wets com busca local foram adotados para este estudo. Foi elucidado forte afinidade do atazanavir ao se ligar à proteína 3CLpro, apresentando energia livre de ligação de -6,47 Kcal.mol-1 e constante de inibição de 18,2 µM. Mostrando possuir potencial biológico, sendo necessária análise in vitro para elucidar sua ação inibitória frente a células do SARS-CoV-2. |
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