Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Almeida, Keyla Caroline de
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UnB
Texto Completo: http://repositorio.unb.br/handle/10482/16435
Resumo: Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2013.
id UNB_54396579bd269ffb1dffc6af8bdaedbf
oai_identifier_str oai:repositorio.unb.br:10482/16435
network_acronym_str UNB
network_name_str Repositório Institucional da UnB
repository_id_str
spelling Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina IEscherichia coliDoenças transmissíveisTese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2013.As Infecções Relacionadas à Assistência à Saúde (IRaS) e o aparecimento de cepas multirresistentes representam um grave problema de saúde pública, sendo notória a necessidade de melhor compreender os mecanismos de resistência bacteriana e assim, elaborar antibióticos mais eficazes. Portanto, o objetivo deste trabalho consistiu em identificar, através de técnicas proteômicas e transcriptômicas, genes e proteínas diferencialmente expressos em linhagens de E. coli ATCC 8739 resistentes à magainina I. Para isso foi realizada a caracterização bioquímica através de microdiluição, VITEK®, MicroScan® e MALDI-TOF MS. Em seguida, foram analisadas a transcrição gênica e a expressão protéica por RNA-seq, nanoUPLC-MSE e 2-DE, respectivamente. Os resultados demonstram que as linhagens resistentes podem ser discriminadas por análises no MALDI-TOF MS e que a resistência à magainina I parece ser bastante específica. Utilizando técnicas proteômicas, foram identificadas 10 proteínas superexpressas dentre as quais, as porinas OmpW, OmpF, OmpC e OmpC fragmento 1b e as proteínas OppA, ZraP e MalM, que participam do transporte pela membrana e transdução de sinal. Por outro lado as proteínas GlpB, GlpA, GdpD, que participam do metabolismo de fosfolipídeos, e o regulador transcricional kdgR, DPS, DnaK, relacionado ao processamento de informação genética, estavam subexpressas. Observou-se também 60 proteínas exclusivas na linhagem resistente, que participam principalmente do metabolismo e processamento de informação genética e ambiental. A fim de aumentar a amplitude da análise, técnicas transcriptômicas também foram aplicadas ao mesmo modelo de estudo observando-se 80 genes com expressões diferenciais, principalmente correlacionados com o metabolismo. Dentre esses, a linhagem resistente versus susceptível com magainina I apresentou 5 genes diferenciais, estando 3 deles superexpressos (pspA, secM, xdhB) e 2 subexpressos (cdp, hldD). Os resultados sugerem que a bactéria foi capaz de desenvolver mecanismos de adaptação em resposta à presença de magainina, provavelmente regulando uma complexa rede de múltiplos genes. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACTHealthcare Associated Infections (HAIs) and emergence of multidrug-resistant bacteria represent a serious public heath problem, requesting a better understanding of bacterial resistance’s mechanisms in order to develop more effective antibiotics. Therefore, work aims to identify, through proteomics and transcripomics tools, genes and proteins differentially expressed in E. coli ATCC 8739 magainin I resistant strains. Biochemical characterization was performed by broth microdilution, VITEK, MicroScan and MALDI – TOF MS. Then, gene and proteins expression were analyzed by RNA –seq, nanoUPLC – MS and 2-DE. Results demonstrated that the resistant strains could be discriminated by MALDI- TOF MS analysis and resistance to magainin I seems to be quite specific. By using proteomic tools, ten proteins were upregulated, such OmpW, OmpF, OmpC e OmpC 1b fragment and fifteen proteins, sush GlpB, GlpA, GdpD, transcriptional factor regulator kdgR, DPS and DnaK, were downregulated in resistant strains. The upregulated proteins have been associated to membrance transport and sinal transduction and dowregulated proteins seem to participate in phospholipid metabolism and genetic information processing. It were also observed the presence of 60 unique proteins in the resistant strains that participate in bacterial metabolism, genetic and environmental information processing. In order to increase the knowledge of bacterial resistance, transcriptomic analysis was realized by using the same magainin I-resistant E. coli model being 80 genes identified, with differential expression in resistant strain being mainly related to metabolism. Among these, the comparison between resistant versus susceptible group cultured with magainin I showed five differential expressed genes, being three of them overexpressed (pspA, secM, xdhB) and the others subexpressed (cdp, hldD.) These data suggest that the bacterium was able to develop a adaptation mechanism in response to magainin, probably regulating a complex net formed by multiple genes.Faculdade de Medicina (FM)Programa de Pós-Graduação em Patologia MolecularFranco, Octávio LuizDias, Simoni CamposAlmeida, Keyla Caroline de2014-10-09T14:17:06Z2014-10-09T14:17:06Z2014-10-092013-12-16info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfALMEIDA, Keyla Caroline de. Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I. 2013. 170 f., ca 100 f., il. Tese (Doutorado em Patologia Molecular)—Universidade de Brasília, Brasília, 2013.http://repositorio.unb.br/handle/10482/16435A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2024-09-19T15:41:55Zoai:repositorio.unb.br:10482/16435Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2024-09-19T15:41:55Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I
title Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I
spellingShingle Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I
Almeida, Keyla Caroline de
Escherichia coli
Doenças transmissíveis
title_short Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I
title_full Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I
title_fullStr Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I
title_full_unstemmed Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I
title_sort Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I
author Almeida, Keyla Caroline de
author_facet Almeida, Keyla Caroline de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Franco, Octávio Luiz
Dias, Simoni Campos
dc.contributor.author.fl_str_mv Almeida, Keyla Caroline de
dc.subject.por.fl_str_mv Escherichia coli
Doenças transmissíveis
topic Escherichia coli
Doenças transmissíveis
description Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2013.
publishDate 2013
dc.date.none.fl_str_mv 2013-12-16
2014-10-09T14:17:06Z
2014-10-09T14:17:06Z
2014-10-09
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv ALMEIDA, Keyla Caroline de. Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I. 2013. 170 f., ca 100 f., il. Tese (Doutorado em Patologia Molecular)—Universidade de Brasília, Brasília, 2013.
http://repositorio.unb.br/handle/10482/16435
identifier_str_mv ALMEIDA, Keyla Caroline de. Análise proteômica e transcriptômica comparativa de E. coli resistente e susceptível ao peptídeo antimicrobiano magainina I. 2013. 170 f., ca 100 f., il. Tese (Doutorado em Patologia Molecular)—Universidade de Brasília, Brasília, 2013.
url http://repositorio.unb.br/handle/10482/16435
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UnB
instname:Universidade de Brasília (UnB)
instacron:UNB
instname_str Universidade de Brasília (UnB)
instacron_str UNB
institution UNB
reponame_str Repositório Institucional da UnB
collection Repositório Institucional da UnB
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)
repository.mail.fl_str_mv repositorio@unb.br
_version_ 1814508193697497088

Registros relacionados