Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Palacios, Juan Fernando Riasco
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UnB
Texto Completo: http://repositorio.unb.br/handle/10482/50274
Resumo: Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2023.
id UNB_6e865e9786012a561d26c24f347be756
oai_identifier_str oai:repositorio.unb.br:10482/50274
network_acronym_str UNB
network_name_str Repositório Institucional da UnB
repository_id_str
spelling Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2Anticorpos monoclonaisSARS-CoV-2Citometria de fluxoTese (doutorado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2023.O vírus SARS-CoV-2 é o agente etiológico responsável da COVID-19 e que produziu a pandemia global que tomou conta do mundo em 2020. Para SARS-CoV-2, a proteína spike na superfície do vírus é o alvo principal da maioria das vacinas atuais. A proteína spike é responsável pela capacidade do vírus de entrar nas células humanas e, portanto, é um componente crucial do mecanismo infeccioso do vírus. Ao provocar uma resposta imune contra epítopos específicos na proteína spike, as vacinas visam impedir que o vírus infecte as células e se espalhe pelo corpo. Compreender os epítopos específicos visados pelas vacinas é fundamental para desenvolver e melhorar as vacinas e para entender por que algumas variantes do SARS-CoV-2 podem ser menos suscetíveis às vacinas atuais. Dentro deste contexto o desenvolvimento de anticorpos monoclonais para o COVID-19 e foi elaborado o projeto “Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2” dentro do macroprojeto “Anticorpos na terapia da COVID-19: estudo clínico de fase IIa, com plasma de convalescentes e geração de anticorpos monoclonais humanos”, em colaboração com a Fundação Hemocentro, o Hospital Universitário de Brasília (HUB) e o Hospital Regional da Asa Norte (HRAN). Nele, anticorpos foram selecionados pelo método de Phage Display a partir de RNA extraído de plasma de pacientes convalescentes. Foram produzidos e purificados anticorpos no formato scFv, e após análise de resultados foram selecionados 6 anticorpos distintos com sequências únicas, e caracterizados como classe 1 e clonótipos 2. Estes também são conhecidos como clonótipos públicos IGHV3-53/3-66 com características de neutralização específicas, seligando a múltiplos locais vulneráveis do vírus na sua região RBD. Assim, os achados obtidos viabilizaram destacar a importância das mutações somáticas na capacidade de ligação e neutralização dos anticorpos. Este dado foi confirmado com a identificação dos epítopos destes anticorpos, processo que permitiu conhecer o local de ligação no RBD, especificamente em sua região RBS, e hipotetizar a possível forma de ligação dos mesmos a partir de estudos de alinhamento de sequências das regiões determinantes de complementaridade (CDRs) com anticorpos com alta percentagem de identidade e com estruturas descritas. A partir do conseguido aqui, os próximos passos implicaram continuar desenvolvendo uma estratégia combinatória que envolva a especificidade e funcionalidade dos anticorpos, e a geração de anticorpos específicos contra o SARS-CoV-2 no formato IGG1.The SARS-CoV-2 virus is the etiological agent responsible for COVID-19 and which produced the global pandemic that took over the world in 2020. For SARS-CoV-2, the spike protein on the surface of the virus is the main target of most current vaccines. The spike protein is responsible for the virus's ability to enter human cells and is therefore a crucial component of the virus's infectious mechanism. By eliciting an immune response against specific epitopes on the spike protein, vaccines aim to prevent the virus from infecting cells and spreading throughout the body. Understanding the specific epitopes targeted by vaccines is critical to developing and improving vaccines and to understanding why some variants of SARS-CoV-2 may be less susceptible to current vaccines. Within this context, the development of monoclonal antibodies for COVID-19 and the project “Characterization and classification of epitopes of monoclonal antibodies selected by Phage Display with anti-SARS-CoV-2 neutralizing potential” was elaborated within the macroproject “Antibodies in the therapy of COVID-19: Phase IIa clinical study, with plasma from convalescents and generation of human monoclonal antibodies”, in collaboration with the Hemocentro Foundation, the University Hospital of Brasília (HUB) and the Regional Hospital of Asa Norte (HRAN). In it antibodies were selected by the Phage Display method from RNA extracted from the plasma of convalescent patients. Antibodies were produced and purified in the scFv format, and after analyzing the results, 06 different antibodies with unique sequences were selected, and characterized as class 1 and clonotypes 2. These are also known as public IGHV3- 53/3-66 clonotypes with specific neutralizing characteristics, binding to multiple vulnerable sites of the virus in its RBD region. Thus, the findings made it possible to highlight the importance of somatic mutations in the ability to bind and neutralize antibodies. This data was confirmed with the identification of the epitopes of these antibodies, a process that made it possible to know the binding site in the RBD, specifically in the RBS region, and to hypothesize the possible way of binding them based on studies of alignment of sequences with antibodies with a high percentage of identity and with described structures. Based on what was achieved here, the next steps would involve continuing to develop a combinatorial strategy that involves the specificity and functionality of antibodies, and the generation of specific antibodies against SARS-CoV-2 in the IGG1 format.El virus SARS-CoV-2 es el agente etiológico responsable del COVID-19 y que produjo la pandemia mundial que se apoderó del mundo en el año 2020. Para el SARS-CoV-2, la proteína espiga en la superficie del virus es el objetivo principal de la mayoría de las vacunas actuales. La proteína espiga es responsable de la capacidad del virus para ingresar a las células humanas y, por lo tanto, es un componente crucial del mecanismo infeccioso del virus. Al provocar una respuesta inmune contra epítopos específicos en la proteína de punta, las vacunas tienen como objetivo evitar que el virus infecte las células y se propague por todo el cuerpo. Comprender los epítopos específicos a los que se dirigen las vacunas es fundamental para desarrollar y mejorar las vacunas y para comprender por qué algunas variantes del SARS-CoV-2 pueden ser menos susceptibles a las vacunas actuales. En este contexto, dentro del macroproyecto “Anticuerpos en la terapia”, se elaboró el desarrollo de anticuerpos monoclonales para COVID-19 y el proyecto “Caracterización y clasificación de epítopos de anticuerpos monoclonales seleccionados por Phage Display con potencial neutralizante anti-SARSCoV-2”. de COVID-19: Estudio clínico Fase IIa, con plasma de convalecientes y generación de anticuerpos monoclonales humanos”, en colaboración con la Fundación Hemocentro, el Hospital Universitario de Brasilia (HUB) y el Hospital Regional de Asa Norte (HRAN). En él se seleccionaron anticuerpos por el método Phage Display a partir de ARN extraído del plasma de pacientes convalecientes. Los anticuerpos se produjeron y purificaron en formato scFv y, después del análisis de los resultados, se seleccionaron 06 anticuerpos distintos con secuencias únicas y se caracterizaron como clonotipos de clase 1 y 2. Estos también se conocen como clonotipos públicos IGHV3-53/3-66 con neutralización específica características, uniéndose a múltiples sitios vulnerables del virus en su región RBD. Así, los hallazgos permitieron resaltar la importancia de las mutaciones somáticas en la capacidad de unión y neutralización de anticuerpos. Este dato se confirmó con la identificación de los epítopos de estos anticuerpos, proceso que permitió conocer el sitio de unión en el RBD, específicamente en su región RBS, e hipotetizar la posible forma de unión a partir de estudios de alineamiento de secuencias de las regiones que determinan la complementariedad (CDRs) con anticuerpos con un alto porcentaje de identidad y con estructuras descritas. Con base en lo que se logró aquí, los próximos pasos implicaría continuar desarrollando una estrategia combinatoria que involucren la especificidad y funcionalidad de los anticuerpos, y la generación de anticuerpos específicos contra el SARS-CoV-2 en el formato IGG1.Faculdade de Medicina (FMD)Programa de Pós-Graduação em Patologia MolecularNicola, André MoraesPalacios, Juan Fernando Riasco2024-09-02T21:18:07Z2024-09-02T21:18:07Z2024-09-022023-07-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfPALACIOS, Juan Fernando Riasco. Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2. 2023. 104 f., il. Tese (Doutorado em Patologia Molecular) — Universidade de Brasília, Brasília, Brasília, 2023.http://repositorio.unb.br/handle/10482/50274porA concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.unb.br, www.ibict.br, www.ndltd.org sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra supracitada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2024-09-02T21:23:51Zoai:repositorio.unb.br:10482/50274Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2024-09-02T21:23:51Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2
title Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2
spellingShingle Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2
Palacios, Juan Fernando Riasco
Anticorpos monoclonais
SARS-CoV-2
Citometria de fluxo
title_short Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2
title_full Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2
title_fullStr Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2
title_full_unstemmed Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2
title_sort Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2
author Palacios, Juan Fernando Riasco
author_facet Palacios, Juan Fernando Riasco
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Nicola, André Moraes
dc.contributor.author.fl_str_mv Palacios, Juan Fernando Riasco
dc.subject.por.fl_str_mv Anticorpos monoclonais
SARS-CoV-2
Citometria de fluxo
topic Anticorpos monoclonais
SARS-CoV-2
Citometria de fluxo
description Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Patologia Molecular, 2023.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-07-28
2024-09-02T21:18:07Z
2024-09-02T21:18:07Z
2024-09-02
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv PALACIOS, Juan Fernando Riasco. Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2. 2023. 104 f., il. Tese (Doutorado em Patologia Molecular) — Universidade de Brasília, Brasília, Brasília, 2023.
http://repositorio.unb.br/handle/10482/50274
identifier_str_mv PALACIOS, Juan Fernando Riasco. Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2. 2023. 104 f., il. Tese (Doutorado em Patologia Molecular) — Universidade de Brasília, Brasília, Brasília, 2023.
url http://repositorio.unb.br/handle/10482/50274
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UnB
instname:Universidade de Brasília (UnB)
instacron:UNB
instname_str Universidade de Brasília (UnB)
instacron_str UNB
institution UNB
reponame_str Repositório Institucional da UnB
collection Repositório Institucional da UnB
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)
repository.mail.fl_str_mv repositorio@unb.br
_version_ 1814508256946552832

Registros relacionados