Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Mesquita, Felipe de Araújo
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UnB
Texto Completo: http://repositorio2.unb.br/jspui/handle/10482/48299
Resumo: Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2023.
id UNB_bdccf7d817878017adfc2c947ed30441
oai_identifier_str oai:repositorio.unb.br:10482/48299
network_acronym_str UNB
network_name_str Repositório Institucional da UnB
repository_id_str
spelling Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporosMetabólitos especializadosBioinformáticaBacillus (Bacteria)Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2023.Metabólitos secundários ou especializados são moléculas não essenciais ao crescimento celular, porém, desempenham grande importância adaptativa para os organismos produtores, como bactérias, fungos e plantas. Bactérias isoladas de solos são conhecidas por sintetizarem uma ampla diversidade de metabólitos especializados com diferentes propriedades físico-químicas. Espécies de Bacillus e gêneros relacionados, coletivamente designadas bactérias aeróbias formadoras de endósporos (Bafes), são promissoras para a busca desses compostos. Porém, relatos sobre a síntese de terpenos por Bafes são deveras escassos na literatura cientifica. O objetivo deste estudo foi analisar, in silico, o potencial genômico para produção de terpenos em dez linhagens de Bafes isoladas do solo do Distrito Federal (linhagens SDF). Utilizando técnicas e ferramentas de Bioinformática, foi possível detectar prováveis biosyntethtic gene clusters (BGC) envolvidos na síntese de metabólitos especializados nestas linhagens. Adicionalmente, foi realizada a reconstrução in silico das respectivas redes metabólicas para detectar a presença das enzimas da via metil-eritrotol fosfato (MEP) responsáveis pela síntese de terpeno em procariotos. Os resultados obtidos apontaram que parte das linhagens SDF sondadas possui o aparato genético completo para produção dos terpenos esqualeno, hopanóide e licopeno. Em complemento, análises filogenéticas baseadas em sequências de aminoácidos de terpeno sintases detectadas, revelaram que estes catalisadores são conservados evolutivamente, sugerindo que o potencial de produção de terpenos é amplamente distribuído em Bafes. Além de terpenos, os resultados obtidos também revelaram que as linhagens SDF são fontes promissoras de policetídeos e peptídeos não ribossomais. Portanto, estas bactérias são boas candidatas para prospecção de novos bioprodutos, notadamente antimicrobianos.Secondary or specialized metabolites are non-essential molecules for cell growth. However, they play an important adaptive role for the producing organisms, such as bacteria, fungi, and plants. Bacteria isolated from soils are known for synthesizing a wide range of specialized metabolites with different physicochemical properties. Bacillus species and from related genera, collectively quoted as aerobic endospore-forming bacteria (AEFB), are promising for searching these compounds. Nevertheless, reports on the synthesis of terpenes by AEFB are very scarce in the scientific literature. This study aimed to analyse the genomic potential for terpene production in ten AEFB strains isolated from soil in the Federal District (SDF strains). Using Bioinformatics techniques and tools, it was possible to detect probable biosynthetic gene clusters (BGC) involved in the syntheses of specialized metabolites in these strains. Additionally, in silico reconstruction of the respective metabolic networks was carried out to detect the presence of enzymes in the methylerythrotol phosphate (MEP) pathway, responsible for terpene synthesis in prokaryotes. The results indicate that part of the probed SDF strains has the complete genetic apparatus to produce the terpenes squalene, hopanoid, and lycopene. Phylogenetic analyses based on amino acid sequences of the detected terpene synthases revealed that these catalysts are well conserved, indicating that the potential for terpene production is widely distributed among AEFB. In addition to terpenes, the results showed that AEFB are promising sources of polyketides and non-ribosomal peptides. Therefore, these bacteria are good candidates for prospecting new bioproducts, notably antimicrobials.Instituto de Ciências Biológicas (IB)Departamento de Biologia Celular (IB CEL)Programa de Pós-Graduação em Biologia MicrobianaDe-Souza, Marlene TeixeiraSilva, Waldeyr Mendes Cordeiro daMesquita, Felipe de Araújo2024-06-17T19:10:58Z2024-06-17T19:10:58Z2024-06-172023-06-28info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfMESQUITA, Felipe de Araújo. Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos. 2023. 88 f., il. Dissertação (Mestrado em Biologia Microbiana) — Universidade de Brasília, Brasília, 2023.http://repositorio2.unb.br/jspui/handle/10482/48299porA concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.unb.br, www.ibict.br, www.ndltd.org sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra supracitada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2024-06-17T19:10:58Zoai:repositorio.unb.br:10482/48299Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2024-06-17T19:10:58Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos
title Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos
spellingShingle Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos
Mesquita, Felipe de Araújo
Metabólitos especializados
Bioinformática
Bacillus (Bacteria)
title_short Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos
title_full Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos
title_fullStr Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos
title_full_unstemmed Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos
title_sort Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos
author Mesquita, Felipe de Araújo
author_facet Mesquita, Felipe de Araújo
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv De-Souza, Marlene Teixeira
Silva, Waldeyr Mendes Cordeiro da
dc.contributor.author.fl_str_mv Mesquita, Felipe de Araújo
dc.subject.por.fl_str_mv Metabólitos especializados
Bioinformática
Bacillus (Bacteria)
topic Metabólitos especializados
Bioinformática
Bacillus (Bacteria)
description Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2023.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-06-28
2024-06-17T19:10:58Z
2024-06-17T19:10:58Z
2024-06-17
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv MESQUITA, Felipe de Araújo. Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos. 2023. 88 f., il. Dissertação (Mestrado em Biologia Microbiana) — Universidade de Brasília, Brasília, 2023.
http://repositorio2.unb.br/jspui/handle/10482/48299
identifier_str_mv MESQUITA, Felipe de Araújo. Análise in silico do potencial genômico para produção de terpenos em bactérias aeróbias formadoras de endósporos. 2023. 88 f., il. Dissertação (Mestrado em Biologia Microbiana) — Universidade de Brasília, Brasília, 2023.
url http://repositorio2.unb.br/jspui/handle/10482/48299
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UnB
instname:Universidade de Brasília (UnB)
instacron:UNB
instname_str Universidade de Brasília (UnB)
instacron_str UNB
institution UNB
reponame_str Repositório Institucional da UnB
collection Repositório Institucional da UnB
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)
repository.mail.fl_str_mv repositorio@unb.br
_version_ 1814508407508434944

Registros relacionados