Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Almeida, Rodrigo Pinheiro de
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UnB
Texto Completo: http://repositorio.unb.br/handle/10482/22029
http://dx.doi.org/10.26512/2015.06.D.22029
Resumo: Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, Programa de Pós-Graducação em Informática, 2015.
id UNB_ec2576b5b6982178484ddbe4d5d06526
oai_identifier_str oai:repositorio.unb.br:10482/22029
network_acronym_str UNB
network_name_str Repositório Institucional da UnB
repository_id_str
spelling Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafoBanco de dadosGrafosBioinformáticaDissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, Programa de Pós-Graducação em Informática, 2015.Muitos experimentos científicos na bioinformática são executados como workflows computacionais. Algumas vezes para a validação e reconhecimento de um experimento é necessário reexecutá-lo sob as mesmas circustâncias nas quais foi originado. Proveniência de dados diz respeito à origem ou procedência dos dados. Para facilitar o entendimento e análise dos resultados, é interessante ter os dados de proveniência, que detalham e documentam a história e os caminhos dos dados de entrada, do início do experimento até o final. Portanto, neste contexto, a proveniência de dados pode ser aplicada para realizar a rastreabilidade de um experimento. Considerando que uma execução de um workflow pode ser representado por um grafo, como definido no modelo PROV-DM, este documento apresenta uma arquitetura capaz de realizar a proveniência de dados de expe- rimentos científicos na bioinformática de forma automática e armazenamento em bancos de grafo.Many scientific experiments in bioinformatics are executed as computational work- flows. Sometimes for the validation and recognition of an experiment is need rerun under same circumstances in which it was originated. Date provenance concers the origin data. To facilate the understanding and analysis of the results is interesting to have the source data, detailing and documeting the history and the paths of the input data, the beginning of the experiment until the end. Therefore, in this context, the data provenance can be applied to realize an experiment traceability. Whereas an execution of a workflow can be represented by a graph, as defined in PROV-DM model, this document presents an architecture able to perform the data provenance of iscientif experiments in bioinformatics automatically and storage graph database.Holanda, Maristela Terto deAlmeida, Rodrigo Pinheiro de2016-12-21T17:01:19Z2016-12-21T17:01:19Z2016-12-212015-06-26info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfALMEIDA, Rodrigo Pinheiro de.Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo. 2015. vii, 62 f., il. Dissertação (Mestrado em Informática)—Universidade de Brasília, Brasília, 2015.http://repositorio.unb.br/handle/10482/22029http://dx.doi.org/10.26512/2015.06.D.22029A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.bce.unb.br, www.ibict.br, http://hercules.vtls.com/cgi-bin/ndltd/chameleon?lng=pt&skin=ndltd sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNB2023-07-14T18:56:23Zoai:repositorio.unb.br:10482/22029Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.unb.br/oai/requestrepositorio@unb.bropendoar:2023-07-14T18:56:23Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
dc.title.none.fl_str_mv Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo
title Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo
spellingShingle Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo
Almeida, Rodrigo Pinheiro de
Banco de dados
Grafos
Bioinformática
title_short Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo
title_full Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo
title_fullStr Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo
title_full_unstemmed Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo
title_sort Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo
author Almeida, Rodrigo Pinheiro de
author_facet Almeida, Rodrigo Pinheiro de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Holanda, Maristela Terto de
dc.contributor.author.fl_str_mv Almeida, Rodrigo Pinheiro de
dc.subject.por.fl_str_mv Banco de dados
Grafos
Bioinformática
topic Banco de dados
Grafos
Bioinformática
description Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, Programa de Pós-Graducação em Informática, 2015.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-06-26
2016-12-21T17:01:19Z
2016-12-21T17:01:19Z
2016-12-21
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv ALMEIDA, Rodrigo Pinheiro de.Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo. 2015. vii, 62 f., il. Dissertação (Mestrado em Informática)—Universidade de Brasília, Brasília, 2015.
http://repositorio.unb.br/handle/10482/22029
http://dx.doi.org/10.26512/2015.06.D.22029
identifier_str_mv ALMEIDA, Rodrigo Pinheiro de.Gerenciamento de dados de proveniência de workflow de bioinformática com banco de dados baseados em grafo. 2015. vii, 62 f., il. Dissertação (Mestrado em Informática)—Universidade de Brasília, Brasília, 2015.
url http://repositorio.unb.br/handle/10482/22029
http://dx.doi.org/10.26512/2015.06.D.22029
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UnB
instname:Universidade de Brasília (UnB)
instacron:UNB
instname_str Universidade de Brasília (UnB)
instacron_str UNB
institution UNB
reponame_str Repositório Institucional da UnB
collection Repositório Institucional da UnB
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UnB - Universidade de Brasília (UnB)
repository.mail.fl_str_mv repositorio@unb.br
_version_ 1814508320574144512