Estudos de interação in silico da tirosinase humana e componentes do extrato de Schinus terebinthifolius
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
Texto Completo: | https://hdl.handle.net/20.500.12733/5219 |
Resumo: | Orientador: Rodrigo Antonio Cormanich |
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Estudos de interação in silico da tirosinase humana e componentes do extrato de Schinus terebinthifoliusIn silico interactions of the components from the Schinus terebinthifolius extract with human tyrosinaseProdutos naturaisMonofenol mono-oxigenaseMelaninaDocking molecularDinâmica molecularNatural productsTyrosinaseMelaninMolecular dockingMolecular dynamicsOrientador: Rodrigo Antonio CormanichDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de QuímicaResumo: A tirosinase é uma enzima chave na melanogênese, uma via biossintética para a formação do pigmento melanina na pele humana, a inibição desta enzima é importante como base de formulações utilizadas para o tratamento de manchas e hiperpigmentação da pele. Fontes botânicas de inibidor para uso cosmético são altamente desejáveis por sua compatibilidade com a pele e diminuição dos efeitos colaterais. Estudos anteriores relataram a atividade anti-tirosinase do extrato de Schinus terebinthifolius, e neste contexto, avaliamos a interação dos componentes deste extrato com a tirosinase humana, utilizando ferramentas computacionais. Como a estrutura cristalina da tirosinase humana não está disponível no Protein Data Bank, a modelagem de homologia em três softwares (SWISS MODELL, Schrödinger e Modeller) foi usada para prever a estrutura da tirosinase humana. A qualidade estereoquímica foi avaliada usando gráficos de Ramachandran e Z-score. Várias abordagens in silico, como docking molecular, MM-GBSA dinâmica molecular (MD), MM-PBSA, MIA-QSAR e predição da permeabilidade da pele, foram empregadas para rastrear os compostos responsáveis pela regulação negativa da atividade enzimática e propor moléculas similares e mais potentes. Após realizados os cálculos e análises dos resultados temos que, o composto que apresentou maior potencial para aplicação cosmética foi a luteolina 17. Na proposta de molecular similares mais potentes, pode ser interessante estudar os derivados de 1,2,3,4,6-penta-O-galoil-glucose 22, que apresentaram menor energia livre de ligação (49, 50, 47 e 29) para aplicação na indústria alimentícia buscando evitar as perdas decorrentes do escurecimento de frutas. Em ambos os casos seriam necessários teste in vitro e in vivo para confirmar o potencial de ação das moléculasAbstract: Tyrosinase is a key enzyme in melanogenesis, a biosynthetic pathway for the formation of the pigment melanin in human skin, the inhibition of this enzyme is important as a base of formulations used for the treatment of skin blemishes and hyperpigmentation. Botanical sources of inhibitors for cosmetic use are highly desirable for their skin compatibility and lessening of side effects. Previous studies had reported the anti-tyrosinase activity of extract of Schinus terebinthifolius; in this context, we evaluated the interaction of the components with human tyrosinase using computational tools. Since the crystal structure of human tyrosinase is not available in Protein Data Bank, homology modeling in three software (SWISS MODELL, Schrödinger and Modeller) was used to predict the structure of human tyrosinase. The stereochemical quality was evaluated by using Ramachandran plots and Z-score. Multiple in silico approaches such as molecular docking, MM-GBSA, molecular dynamic (MD), MM-PBSA, MIA-QSAR and skin permeability prediction were employed to screen the compounds responsible for the down-regulation of enzyme activity and to propose related and more potent molecules. After performing the calculations and analyzing the results, the compound that presented the most significant potential for cosmetic application was luteolin 17. Searching for more potent molecular analogues, it may be interesting to study the derivatives of 1,2,3,4,6- penta-O-galloyl-glucose 22, which showed lower binding free energy (49, 50, 47 and 29) for application in the food industry, in order to avoid losses, resulting from fruit browning. In both cases, in vitro and in vivo tests would be necessary to confirm the potential of the moleculesMestradoQuímica OrgânicaMestra em QuímicaCNPQ131577/2020-4[s.n.]Cormanich, Rodrigo Antonio, 1986-Kawano, Daniel FábioCunha, Elaine Fontes Ferreira daUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de QuímicaPrograma de Pós-Graduação em QuímicaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASBezerra, Julia Nogueira, 1996-20222022-05-11T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf1 recurso online (106 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/5219BEZERRA, Julia Nogueira. Estudos de interação in silico da tirosinase humana e componentes do extrato de Schinus terebinthifolius. 2022. 1 recurso online (106 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/5219. Acesso em: 3 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1246823Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2022-08-08T11:21:35Zoai::1246823Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2022-08-08T11:21:35Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false |
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