Genômica e estrutura populacional da macaúba [Acrocomia aculeata (Jacq.) Lodd. ex Mart.], visando subsidiar à domesticação da espécie

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Díaz Hernández, Brenda Gabriela, 1983-
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640627
Resumo: Orientador: Maria Imaculada Zucchi, Jorge Maurício Costa Mondego
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spelling Genômica e estrutura populacional da macaúba [Acrocomia aculeata (Jacq.) Lodd. ex Mart.], visando subsidiar à domesticação da espécieGenomics and population structure of Macaúba [Acrocomia aculeata (Jacq.) Lodd. ex Mart.], aimed the species domesticationÓleos vegetaisGenotipagem por sequenciamentoPolimorfismo de nucleotídeo únicoRepetições de microssatélitesVegetable oilsGenotyping by sequencingPolymorphism single nucleotideMicrosatellite repeatsOrientador: Maria Imaculada Zucchi, Jorge Maurício Costa MondegoTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: Acrocomia (Arecaceae) é um gênero neotropical ao qual são atribuídas oito espécies com ampla distribuição na América. A. aculeata é a espécie mais importante devido ao seu alto potencial em fornecer óleo com a mesma capacidade de produção do dendê, mas que pode ser cultivado em áreas com déficit hídrico, característica que tem motivado seu interesse econômico e aumento do plantio comercial. Considerada uma espécie com grau de domesticação incipiente, cultivares comerciais ainda não estão disponíveis e os desafios quanto à consolidação da cadeia produtiva dessa espécie merecem a atenção da comunidade científica. Neste contexto, tendo em vista a importância da domesticação e melhoramento genético de A. aculeata e outras espécies do gênero, os objetivos deste projeto foram: a) analisar e compreender o conteúdo e a estruturação da diversidade genômica de macaúba por SNPs, visando elucidar as relações genéticas entre as espécies do gênero Acrocomia e A. aculeata de diferentes países americanos; b) elucidar o status taxonômico entre A. aculeata e A. totai e identificar a ocorrência de possíveis híbridos interespecíficos, utilizando marcadores de repetição de sequência simples (SSR) e, c) analisar o sistema de cruzamento e a diversidade genética de progênies de polinização aberta (OPP) de A. aculeata para prever sua vulnerabilidade genética. Nossos resultados mostraram-se parcialmente congruentes com a atual classificação taxonômica baseada em caracteres morfológicos, recuperando a separação das espécies A. aculeata, A. totai, A. crispa e A. intumescens como grupos taxonômicos distintos. A. aculeata apresentou uma subestrutura acentuada em seu interior, apresentando dois grupos genéticos, correspondendo a uma divisão norte*sul. Com base na utilização de SNPs e marcadores microssatélites, foi corroborada uma diferenciação genética entre A. aculeata e A. totai como espécies diferentes, sendo que A. totai possui o maior nível de diversidade. Os resultados também mostraram que não houve perda significativa na diversidade genética das OPPs derivadas de uma seleção artificial em populações naturais. Em conclusão, nossos resultados evidenciaram a aplicabilidade dos marcadores SNPs e SSR como referência para futuros estudos sobre o gênero Acrocomia, além de fornecer uma visão mais global da diversidade genômica de A. aculeata e outras espécies de Acrocomia, informações que serão úteis para definir estratégias de conservação e reprodução nos diferentes países onde a espécie ocorreAbstract: Acrocomia (Arecaceae) is a neotropical genus that is attributed eight species with a wide distribution in America. A. aculeata is the most important species because its potential to supply oil with the same production capacity as oil palm, but which can be grown in areas with water deficit, characteristic that has motivated its commercial interest and increased commercial planting. Considered a species with a certain degree of incipient domestication, commercial cultivars are not yet available, and the challenges regarding the consolidation of the productive chain of this species deserve the attention of the scientific community. In this context, in view of the importance of domestication and genetic improvement of A. aculeata and other species of the genus, the objectives of this research project were a) to analyze and understand the content and structuring of A. aculeata genomic diversity by SNPs, with the objective of elucidating the genetic relationships between species Acrocomia and A. aculeata from different American countries; b) to elucidate the taxonomic status between A. aculeata and A. totai and identify the occurrence of natural interspecific hybrids, using simple sequence repeat markers (SSR) and c) to analyze the mating system and genetic diversity of open-pollinated progenies (OPP) of A. aculeata to predict their genetic vulnerability. Our results showed partially congruent with the current taxonomic classification based on morphological characters, recovering the separation of the species A. aculeata, A. totai, A. crispa and A. intumescens as distinct taxonomic groups. A. aculeata showed an accentuated substructure within, showing two genetic groups, corresponding to a north¿south split. Based on both using SNPs and microsatellites markers, was corroborated as a genetic differentiation between A. aculeata and A. totai as different species, and that A. totai has the highest level of diversity. The results also showed that there was no significant loss in the genetic diversity of OPPs derived from an artificial selection in natural populations. In conclusion, our results evidenced the applicability of SNPs and SSR markers as a reference for future studies on the Acrocomia genus, as well as provide a more global view of the genomic diversity of A. aculeata and another species of the genus, information that will be useful to define strategies for conservation and breeding in the different countries where the species occurDoutoradoGenética Vegetal e MelhoramentoDoutora em Genética e Biologia MolecularCAPES001FAPESP2017/22987-2[s.n.]Zucchi, Maria Imaculada, 1971-Mondego, Jorge Mauricio Costa, 1976-Souza, Anete Pereira deSolferini, Vera NisakaMotoike, Sérgio YoshimitsuCordeiro, Erick Mauricio GoesUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). 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