Comparação entre o microbioma intestinal de peixes sadios e peixes infectados experimentalmente com Streptococcus agalactiae

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Bruna Rafaela dos Santos, 1996-
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1638213
Resumo: Orientadores: Wanderley Dias da Silveira, Renato Pariz Maluta
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spelling Comparação entre o microbioma intestinal de peixes sadios e peixes infectados experimentalmente com Streptococcus agalactiaeComparison between the gut microbiome of healthy fish and fish experimentally infected with Streptococcus agalactiaeStreptococcus agalactiaeTilápia do NiloMicrobiotaStreptococcus agalactiaeNile TilapiaMicrobiotaOrientadores: Wanderley Dias da Silveira, Renato Pariz MalutaDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: O patógeno Streptococcus agalactiae está entre os microorganismos envolvido em doenças em peixes, tanto em pescados de água doce como pescados de água salgada. A septicemia por S. agalactiae é uma das principais doenças que afetam o cultivo da tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus). Neste trabalho, comparamos o microbioma intestinal de animais saudáveis (n = 27) e animais experimentalmente infectados com S. agalactiae (n = 28). Para ambos os grupos, analisaram-se as bactérias aderidas à mucosa (M) e livres nas fezes (F). O microbioma foi estabelecido com 16S rRNA next-generation sequencing (NGS). A média do número de táxons detectados no grupo infectado (M + F) foi menor (45,87 ± 30,13) do que no controle (M + F) (67,70 ± 21,10) (p <0,01). A análise conjunta de mucosa e fezes e a análise isolada apenas de fezes ou apenas de mucosa revelaram OTUs mais associados a amostras de animais infectados quando comparados a animais saudáveis. O número de táxons associados ao grupo infectado variou entre 19 e 61. Quando comparadas as amostras de fezes e mucosas combinadas e somente as amostras fecais o gênero Streptococcus estava mais de 4.000 vezes mais abundante no grupo infectado em comparação ao grupo saudável. No entanto, tal gênero esteve apenas cerca de 500 vezes mais abundante nas amostras de mucosa. O táxon Lactobacillus spp., também associado ao grupo infectado, apresentou abundâncias semelhantes em todas as categorias de amostras, variando entre 249,2 a 524,37. O gênero Pleisomonas apresentou perfil semelhante nas várias categorias de amostras, com abundâncias variando de 9,01 a 12,3 vezes. Os resultados demonstram que a infecção por S. agalactiae reduz a variabilidade da microbiota intestinal. Além disso, alguns microrganismos como Streptococcus, Lactobacillus e Pleisomonas proliferam nessa situaçãoAbstract: The pathogen Streptococcus agalactiae is a microorganism associated to fish disease, both in freshwater and seawater. Septicemia due to S. agalactiae is one of the major diseases affecting Nile tilapia (Oreochromis niloticus) husbandry. In this study, we compared the intestinal microbiome of healthy fish (n = 27) and fish experimentally infected with S. agalactiae (n = 28). For both groups, bacteria attached to the mucosa (M) and free in feces (F) were analyzed. The microbiome was established with 16S rRNA next-generation sequencing (NGS). The average number of taxa detected in the infected group (M + F) was lower (45.87 ± 30.13) than in the control group (M + F) (67.70 ± 21.10) (p <0.01). Combined analysis of mucosa and feces and isolated analysis of feces only or mucosa only revealed OTUs more associated with samples from infected animals when compared to healthy animals. The number of taxa associated with the infected group ranged from 19 to 61. When comparing the fecal and mucosa samples combined and fecal samples only, the genus Streptococcus was more than 4,000 times more abundant in the infected group compared to the healthy group. However, such genus was only about 500 times more abundant in mucosa samples. The taxon Lactobacillus, also associated with the infected group, had similar abundances in all sample categories, ranging from 249.2 to 524.37. The genus Pleisomonas showed a similar profile in the various categories of samples, with abundances ranging from 9.01 to 12.3 times. The results demonstrate that S. agalactiae infection reduces the intestinal microbiota variability. Furthermore, some microorganisms as Streptococcus, Lactobacillus and Pleisomonas proliferate in this situationMestradoMicrobiologiaMestra em Genética e Biologia MolecularFAPESP2017/22288-7[s.n.]Dias da Silveira, Wanderley, 1956-Nakazato, GersonMódena, José Luiz ProençaUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de BiologiaPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASSilva, Bruna Rafaela dos Santos, 1996-20202020-02-07T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf1 recurso online (74 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1638213SILVA, Bruna Rafaela dos Santos. Comparação entre o microbioma intestinal de peixes sadios e peixes infectados experimentalmente com Streptococcus agalactiae. 2020. 1 recurso online (74 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1638213. Acesso em: 3 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1126860Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2020-03-16T10:40:24Zoai::1126860Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2020-03-16T10:40:24Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
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