Determinação do perfil metabolômico de Linfoma Não Hodgkin para identificação de marcadores tumorais

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Duarte, Gustavo Henrique Bueno, 1989-
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640853
Resumo: Orientadores: Marcos Nogueira Eberlin, Ana Valeria Colnaghi Simionato
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spelling Determinação do perfil metabolômico de Linfoma Não Hodgkin para identificação de marcadores tumoraisDetermination of metabolomic profile of Non-Hodgkin's Lymphoma for identification of tumor markersMetabolômicaEspectrometria de massaCG-EMCromatografia líquida acoplada à espectometria de massas (LC-MS/MS)LinfomaMetabolomicsMass spectrometryGas chromatography-Mass SpectrometryLiquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS)LymphomaOrientadores: Marcos Nogueira Eberlin, Ana Valeria Colnaghi SimionatoTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de QuímicaResumo: O Linfoma não-Hodgkin (NHL) é um câncer do sistema linfático onde os tecidos linfoides e hematopoiéticos são infiltrados por neoplasias malignas de linfócitos B e T. A doença pode variar de um linfoma folicular mais indolente para linfomas de Burkitt ou linfoma difuso de grandes células B mais agressivos. O diagnóstico e a classificação do NHL são realizados por citometria de fluxo em amostras de sangue e um conjunto de técnicas aplicadas às biópsias de tecidos (morfologia, imuno-histoquímica e genômica), representando um procedimento complexo, demorado, caro e altamente dependente de habilidades pessoais. Métodos eficazes e menos invasivos para a triagem de NHL são altamente necessários. Este trabalho aborda a aplicação da abordagem metabolômica global por cromatografia gasosa acoplada à espectrometria de massas (GC-MS) e cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massas (LC-MS) para investigar as alterações metabólicas em amostras de urina e soro de pacientes com NHL difuso de grandes células B em comparação com o grupo controle composto por voluntários saudáveis. As análises uni e multivariada dos dados revelaram os metabólitos endógenos estatisticamente significativos importantes para a diferenciação entre os grupos estudados, incluindo aminoácidos e seus metabólitos, açúcares, pequenos ácidos orgânicos e vitaminas. No geral, os resultados mostram a viabilidade do uso da análise de urina por GC-MS e LC-MS e soro por LC-MS como ferramenta de triagem para o diagnóstico alternativo de NHL e destacam as diferentes vias metabólicas envolvidas com os metabólitos alterados. Nesse trabalho também é abordado o desenvolvimento e aplicação uma ferramenta computacional de compatibilização de formato de arquivo de bibliotecas de metabolômica provenientes do banco de dados MassBank para o software Progenesis® QI, que foi o software utilizado para o processamento de dados e identificação de metabólitos para o estudo por LC-MS. Diferentes bibliotecas oriundas do MassBank foram testadas em diferentes conjuntos de dados provenientes de repositório de dados de experimentos de metabolômica. Os resultados mostram que é mandatório a realização de conversão de formato de arquivo da biblioteca para que o Progenesis® QI seja capaz de acessar as informações de perfil de fragmentação de compostos contidos nas bibliotecasAbstract: Non-Hodgkin's lymphoma (NHL) is a cancer of the lymphatic system where the lymphoid and hematopoietic tissues are infiltrated by malignant neoplasms of B and T lymphocytes. The disease can range from a more indolent follicular lymphoma to Burkitt's lymphoma or more aggressive diffuse large B cells lymphoma. The diagnosis and classification of NHL are performed by flow cytometry in blood samples and a set of techniques applied to tissue biopsies (morphology, immunohistochemistry and genomics), representing a complex, time-consuming, expensive and highly skill-dependent procedure. Effective and less invasive methods for NHL screening are highly needed. This work addresses the application of an global metabolomic approach by gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS) and liquid chromatography coupled to mass spectrometry (LC-MS) to investigate the metabolic changes in urine and serum samples from patients with diffuse large B-cell NHL in comparison with the control group composed of healthy volunteers. Univariate and multivariate analyzes of the data revealed the endogenous metabolites statistically significant for differentiation between the studied groups, including amino acids and their metabolites, sugars, small organic acids and vitamins. In general, the results show the feasibility of using urine analysis by GC-MS and LC-MS and serum by LC-MS as a screening tool for the alternative diagnosis of NHL and highlight the different metabolic pathways involved with the altered metabolites. This work also discusses the development and application of a computational tool to match the file format of metabolomics libraries from the MassBank database to the Progenesis® QI software, which was the software used for data processing and identification of metabolites for the study by LC-MS. Different libraries from MassBank were tested on different data sets from the data repository of metabolomics experiments. The results show that the conversion of the library's file format is mandatory so that Progenesis® QI is able to access the fragmentation profile information of compounds contained in the librariesDoutoradoQuímica AnalíticaDoutor em CiênciasCNPQ141543/2017-5FAPESP2016/07014-5[s.n.]Eberlin, Marcos Nogueira, 1959-Sawaya, Alexandra Christine Helena FranklandHantao, Leandro WangAugusti, RodineiMeurer, Eduardo CesarUniversidade Estadual de Campinas. Instituto de QuímicaPrograma de Pós-Graduação em QuímicaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASDuarte, Gustavo Henrique Bueno, 1989-20212021-01-28T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf1 recurso online (213 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640853DUARTE, Gustavo Henrique Bueno. Determinação do perfil metabolômico de Linfoma Não Hodgkin para identificação de marcadores tumorais. 2021. 1 recurso online (213 p.) Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640853. 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