Identificação e caracterização molecular de Herpesvirus obtidos de morcegos
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
Texto Completo: | https://hdl.handle.net/20.500.12733/1635483 |
Resumo: | Orientador: Clarice Weis Arns |
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Identificação e caracterização molecular de Herpesvirus obtidos de morcegosIdentification and molecular characterization of Herpesvirus obtained of batsMorcegoSaúde únicaHerpesviridaeChiropteraOne HealthHerpesviridaeOrientador: Clarice Weis ArnsDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências MédicasResumo: Os morcegos destacam-se como importantes agentes transmissores de patógenos infecciosos. Características destes animais, como capacidade de voar, elevada difusão geográfica, diversidade de espécies, além de boa mobilidade espacial e interação com outras populações animais, aproximam o contato entre humanos e morcegos e podem promover a transmissão de patógenos, incluindo vírus. Neste contexto, os herpesvírus são amplamente disseminados em humanos e outros animais. Os vírus desta família podem causar desde lesões em mucosas até quadros mais graves, como encefalites, meningites ou infecções disseminadas. Informações relacionadas à distribuição dos vírus da família Herpesviridae em morcegos ainda são pouco caracterizadas. O objetivo deste estudo foi identificar herpesvírus em amostras de suabe oral e anal de morcegos de várias espécies, de dois municípios diferentes e fazer a caracterização molecular destas amostras, buscando-se identificar relações com estirpes circulantes na natureza. Foram analisadas 320 amostras de populações de morcegos dos municípios de Campinas e Rio Claro no estado de São Paulo, por Pan-herpesvírus PCR (Reação em Cadeia da Polimerase). Foram utilizados primers degenerados direcionados para amplificar uma região conservada do gene da DNA Polimerase de herpesvírus. Foi utilizado um formato de nested-PCR capaz de amplificar fragmentos de 21 espécies de herpesvírus (13 vírus animais e oito vírus humanos), das subfamílias Alphaherpesvirinae, Betaherpesvirinae e Gammaherpesvirinae. As amostras identificadas como positivas na PCR foram submetidas à técnica de sequenciamento Sanger, seguido de análise filogenética pelos métodos de Maximum Likelihood e Neighbor-Joining. No total, 69 sequências foram compatíveis com herpesvírus, após o sequenciamento. A maioria das amostras positivas eram provenientes de suabes orais. Algumas amostras apresentaram relação filogenética com herpesvírus da subfamília GammaherpesvirinaeAbstract: Bats stand out as important agents transmitting pathogens. Characteristics of these animals, such as high geographical diffusion, species diversity, good spatial mobility and interaction with other populations, become closer the contact between humans and bats, and can promote the transmission of infectious pathogens, including viruses. Herpesviruses are widely disseminated in humans and other animals. The viruses of this family can cause from mucosal lesions to more serious conditions, such as encephalitis, meningitis or disseminated infections. Information related to the distribution of Herpesviridae viruses in bats is still poorly characterized. This study aims to identify herpesvirus in oral and anal swab samples of various species of bats from two different municipalities and to characterize these samples in order to identify relationships with circulating strains in nature. A total of 320 samples from bat populations of the municipalities of Campinas and Rio Claro in the São Paulo state were analyzed by Pan-herpesvirus PCR (Polymerase Chain Reaction). Degenerate primers targeted to amplify a conserved region of the DNA Polymerase herpesvirus gene were used. A nested-PCR format capable of amplifying fragments of 21 herpesvirus species (13 animal and eight human viruses), from the subfamilies Alphaherpesvirinae, Betaherpesvirinae and Gammaherpesvirinae was used. Samples identified as positive in the PCR were submitted to the Sanger sequencing technique, followed by phylogenetic analysis by the Maximum Likelihood and Neighbor-Joining methods. In total, 69 sequences were compatible with herpesvirus after sequencing. Most of the positive samples came from oral swabs. Some samples showed a phylogenetic relationship with herpesvirus of the subfamily GammaherpesvirinaeMestradoClínica MédicaMestra em CiênciasCAPES4570/2018[s.n.]Arns, Clarice Weis, 1956-Costa, Sandra Cecília BotelhoOrsi, Maria AngelaUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências MédicasPrograma de Pós-Graduação em Clínica MédicaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASCuccato, Ligia Pinho, 1990-20182018-11-23T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf1 recurso online (57 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1635483CUCCATO, Ligia Pinho. Identificação e caracterização molecular de Herpesvirus obtidos de morcegos. 2018. 1 recurso online (57 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1635483. Acesso em: 3 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1080404Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2019-03-15T16:34:29Zoai::1080404Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2019-03-15T16:34:29Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false |
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