Análise do gene NR5A1 e aplicação da técnica de sequenciamento do exoma para identificar variantes patogênicas em indivíduos com distúrbio da diferenciação do sexo ovariotesticular 46,XX
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Data de Publicação: | 2021 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
Texto Completo: | https://hdl.handle.net/20.500.12733/2275 |
Resumo: | Orientadores: Andréa Trevas Maciel Guerra, Mara Sanches Guaragna |
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Análise do gene NR5A1 e aplicação da técnica de sequenciamento do exoma para identificar variantes patogênicas em indivíduos com distúrbio da diferenciação do sexo ovariotesticular 46,XXAnalysis of NR5A1 gene and application of exome sequencing to identify pathogenic variants in individuals with 46,XX ovotesticular disorder of sex developmentTranstornos ovotesticulares do desenvolvimento sexualExomaFator esteroidogênico 1Ovotesticular disorder of sex developmentExomeSteroidogenic factor 1Orientadores: Andréa Trevas Maciel Guerra, Mara Sanches GuaragnaTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências MédicasResumo: Introdução: O distúrbio da diferenciação sexual ovariotesticular (DDS-OT) é uma afecção rara definida pela presença de tecido ovariano e testicular no mesmo indivíduo. Nos pacientes com DDS-OT 46,XX e ausência do gene SRY acredita-se que a diferenciação de tecido testicular ocorra por mutação em um dos genes envolvidos na diferenciação gonadal, como descrito recentemente em relação ao gene NR5A1. Com o avanço das tecnologias de sequenciamento de alto rendimento, tal como a abordagem de sequenciamento de exoma, é possível a investigação do genoma humano em busca de variantes patogênicas e/ou genes candidatos, o que auxilia no estudo de condições geneticamente heterogêneas e com etiologia indefinida, como é o caso dos DDS-OT 46,XX. Objetivos: Investigar a origem do DDS-OT 46,XX SRY-negativo em pacientes de um único serviço com essa condição, em busca de variantes patogênicas do gene NR5A1 ou de variantes raras que permitam identificar novos genes envolvidos na origem dessa afecção. Método: Foi realizado sequenciamento do gene NR5A1 em sete pacientes com DDS-OT 46,XX SRY-negativo e, posteriormente, sequenciamento de exoma em dois pacientes que apresentam recorrência familiar de DDS 46,XX (famílias 1 e 2). Resultados e Discussão: O sequenciamento do NR5A1 não detectou variantes patogênicas nem potencialmente patogênicas. O estudo do exoma também não detectou variantes patogênicas ou provavelmente patogênicas. Na família 1 foram encontradas variantes de significado incerto em HHAT e USP44; na família 2, foram encontradas variantes de significado incerto em CBX2, CCN2, POU6F2 e INSRR. Desses, destacam-se HHAT, pelo resultado de estudos em animais, e principalmente CBX2, que tem papel bem estabelecido no processo de diferenciação gonadal e já foi associado a casos de DDS. Conclusões: Variantes patogênicas no NR5A1 não são causa de DDS-OT 46,XX SRY-negativo em nossa amostra, e o estudo do exoma não permitiu que se chegasse a um diagnóstico etiológico. Apesar disso, as variantes encontradas podem ter contribuído para o fenótipo de forma oligogênica. A etiologia dessa condição permanece indefinida, exigindo reanálise futura dos dados obtidos e o emprego de novas abordagens genômicasAbstract: Introduction: Ovotesticular Disorder of Sex Development (OT-DSD) is a rare condition defined by the presence of ovarian and testicular tissue in the same individual. In patients with 46,XX OT-DSD and absence of the SRY gene, it is believed that testicular tissue differentiation occurs by variants in one of the genes involved in gonadal differentiation, such as NR5A1. With the advancement of high-throughput sequencing technologies, such as the exome sequencing approach, it is possible to investigate the human genome in search for pathogenic variants and/or candidate genes, which aids in the study of genetically heterogeneous conditions and those with undefined etiology, such as 46,XX OT-DSD. Objectives: To investigate the origin of SRY-negative 46,XX OT-DSD in patients from a single service, searching for pathogenic variants in NR5A1 or rare variants that allow the identification of new genes involved in the origin of this condition. Methods: NR5A1 gene sequencing was performed in seven patients with SRY-negative 46,XX OT-DSD, followed by exome sequencing of two patients that presented familial recurrence of 46,XX DSD (families 1 and 2). Results and Discussion: NR5A1 sequencing did not detect pathogenic or probably pathogenic variants. The study of the exome also did not detect pathogenic or probably pathogenic variants. In family 1, variants of uncertain significance were found in HHAT and USP44,; in family 2, variants of uncertain significance were found in CBX2, CCN2, POU6F2 and INSRR. Of these, HHAT stands out, due to the results of studies in animals, and especially CBX2, which has a well-established role in the process of gonadal differentiation and has already been associated with cases of DSD. Conclusion: Pathogenic variants in NR5A1 are not the cause of SRY-negative 46,XX OT-DSD in our sample, and the study of the exome did not allow us to reach an etiological diagnosis. Nevertheless, the variants found may have contributed to the phenotype in an oligogenic way. The etiology of this condition remains undefined, requiring future reanalysis of the data obtained and the use of new genomic approachesDoutoradoSaúde da Criança e do AdolescenteDoutora em CiênciasCAPES001FAPESP2019/26382-3[s.n.]Maciel-Guerra, Andrea Trevas, 1960-Guaragna, Mara Sanches, 1971-Marques-de-Faria, Antonia PaulaVieira, Tarsis Antonio PaivaCastro, Ângela Maria SpínolaPetroli, Reginaldo JoséUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências MédicasPrograma de Pós-Graduação em Saúde da Criança e do AdolescenteUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASBarros, Beatriz Amstalden, 1986-20212021-10-08T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf1 recurso online (86 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/2275BARROS, Beatriz Amstalden. Análise do gene NR5A1 e aplicação da técnica de sequenciamento do exoma para identificar variantes patogênicas em indivíduos com distúrbio da diferenciação do sexo ovariotesticular 46,XX. 2021. 1 recurso online (86 p.) Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/2275. Acesso em: 3 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1234592Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2021-12-21T09:57:56Zoai::1234592Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2021-12-21T09:57:56Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false |
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