Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Rincones, Johana, 1977-
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602777
Resumo: Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira
id UNICAMP-30_ea8a4b9066cfaaecf6e157bf63420061
oai_identifier_str oai::368649
network_acronym_str UNICAMP-30
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository_id_str
spelling Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosaWitches' broom disease of cocoa : genome organization, genetic variability and anlysis of the identity and expression of pathogenicity genes of the fungal pathogen Crinipellis perniciosaVassoura-de-bruxa (Fitopatologia)CacauCariótiposFungos fitopatogênicosExpressão gênicaWitches' broom diseaseCacaoKaryotypesPhytopathogenic fungiGene expressionOrientador: Gonçalo Amarante Guimarães PereiraTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: A Vassoura-de-Bruxa do cacaueiro constitui um patosistema complexo e até o momento não foi estabelecido um plano de controle efetivo na região produtora da Bahia. O objetivo principal deste trabalho foi aprimorar os conhecimentos sobre a interação C. perniciosa-Cacaueiro com informações referentes à: 1) tamanho e organização do genoma através da obtenção do cariótipo molecular do fungo; 2) variabilidade genética deste fitopatógeno a nível cromossômico na região produtora da Bahia; e 3) expressão gênica do fungo em presença de extratos do hospedeiro. O cariótipo molecular foi estabelecido por eletroforese em gel de campo pulsado. Esta mesma metodologia foi utilizada em combinação com análise tipo microsatélites para um estudo de variabilidade a nível cromossômico de 38 isolados provenientes de três biótipos e diferentes regiões geográficas. Para análise da expressão gênica foram seqüenciadas quatro bibliotecas de cDNA do fungo sob diferentes condições de cultivo e em diferentes estágios do desenvolvimento, incluindo uma biblioteca subtrativa obtida por SSH. Como resultados, apresentamos o cariótipo molecular de C. perniciosa e a existência de polimorfismos cromossômicos. A análise dos 38 isolados permitiu observar que o cariótipo do biótipo-C é estável ao longo do tempo e sua variabilidade na região da Bahia é baixa, mostrando assim a fragilidade do programa de melhoramento genético do cacaueiro na Bahia, onde os clones resistentes selecionados no campo foram desafiados contra apenas dois genótipos do patógeno. Com relação à análise da expressão do fungo, obtivemos 1427 unigenes e sua análise por similaridade com as bases de dados permitiu a identificação de diversos mecanismos pelos quais o fungo poderia estar manipulando o metabolismo da planta para seu benefício e em detrimento da produção de cacau. Assim, consideramos que a partir deste trabalho foi possível obter uma maior compreensão dos mecanismos utilizados por C. perniciosa no desenvolvimento da Vassoura-de-Bruxa em cacaueiro e estudos mais aprofundados, baseados nos resultados aqui obtidos, deverão auxiliar no desenvolvimento de estratégias de controle para esta importante doençaAbstract: Witches' broom disease of cocoa is a complex pathosystem that has evaded an efficient control program in the cacao-producing region of Bahia, Brazil. The main goal of this work was to acquire a better understanding of the C. perniciosa-Cacao interaction by providing new data regarding: 1) the size and organization of the fungal genome through molecular karyotyping; 2) the genetic variability of this phytopathogen at the chromosomal level in the cacao-producing region of Bahia; and 3) the gene expression of the fungus in the presence of host extracts. The molecular karyotype was obtained through pulsed-field gel electrophoresis. This same technique was applied in combination with microsatellite PCR analysis of 38 isolates from different biotypes and geographic regions in order to study the chromosomal-level genetic variability of this pathogen. For the gene expression analysis, four cDNA libraries of the fungus grown under different culture conditions and developmental stages, including a subtractive library using SSH, were sequenced and searched for similarities in the public databases. As results, we present the molecular karyotype of C. perniciosa and the existence of chromosome-length polymorphism. The analysis of the 38 isolates showed that the karyotype of the C-biotype is very stable in time and that the variability of the pathogen in Bahia is very low, thus indicating the fragility of the current cacao-breeding program in Bahia, where the resistant cacao clones selected in the field were challenged against only two different genotypes of the pathogen. With regards to the gene expression analysis, we obtained 1427 unigenes and the similarity searches allowed the identification of various mechanisms through which the fungus might be manipulating the metabolism of the plant for its own benefit and in detriment of cocoa production. Therefore, we consider that this work allowed us to acquire a better understanding of the molecular mechanisms used by C. perniciosa during witches' broom development in cacao and more detailed studies, based on the results presented here, might aid in the development of novel control strategies for this important diseaseDoutoradoBioquímicaDoutor em Biologia Funcional e Molecular[s.n.]Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães, 1964-Filipe, Maria Sueli SoaresRossi, Nilce Maria MartinezMenossi, MarceloVincentz, Michel Georges AlbertNovello, Jose CamilloUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de BiologiaPrograma de Pós-Graduação em Biologia Funcional e MolecularUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASRincones, Johana, 1977-2006info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf149p. : il.(Broch.)https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602777RINCONES, Johana. Vassoura-de-bruxa: organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa. 2006. 149p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602777. Acesso em: 2 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/368649porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2017-02-18T04:33:04Zoai::368649Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2017-02-18T04:33:04Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
dc.title.none.fl_str_mv Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa
Witches' broom disease of cocoa : genome organization, genetic variability and anlysis of the identity and expression of pathogenicity genes of the fungal pathogen Crinipellis perniciosa
title Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa
spellingShingle Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa
Rincones, Johana, 1977-
Vassoura-de-bruxa (Fitopatologia)
Cacau
Cariótipos
Fungos fitopatogênicos
Expressão gênica
Witches' broom disease
Cacao
Karyotypes
Phytopathogenic fungi
Gene expression
title_short Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa
title_full Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa
title_fullStr Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa
title_full_unstemmed Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa
title_sort Vassoura-de-bruxa : organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa
author Rincones, Johana, 1977-
author_facet Rincones, Johana, 1977-
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães, 1964-
Filipe, Maria Sueli Soares
Rossi, Nilce Maria Martinez
Menossi, Marcelo
Vincentz, Michel Georges Albert
Novello, Jose Camillo
Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia
Programa de Pós-Graduação em Biologia Funcional e Molecular
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
dc.contributor.author.fl_str_mv Rincones, Johana, 1977-
dc.subject.por.fl_str_mv Vassoura-de-bruxa (Fitopatologia)
Cacau
Cariótipos
Fungos fitopatogênicos
Expressão gênica
Witches' broom disease
Cacao
Karyotypes
Phytopathogenic fungi
Gene expression
topic Vassoura-de-bruxa (Fitopatologia)
Cacau
Cariótipos
Fungos fitopatogênicos
Expressão gênica
Witches' broom disease
Cacao
Karyotypes
Phytopathogenic fungi
Gene expression
description Orientador: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira
publishDate 2006
dc.date.none.fl_str_mv 2006
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv (Broch.)
https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602777
RINCONES, Johana. Vassoura-de-bruxa: organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa. 2006. 149p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602777. Acesso em: 2 set. 2024.
identifier_str_mv (Broch.)
RINCONES, Johana. Vassoura-de-bruxa: organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa. 2006. 149p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602777. Acesso em: 2 set. 2024.
url https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602777
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/368649
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
149p. : il.
dc.publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron:UNICAMP
instname_str Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron_str UNICAMP
institution UNICAMP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.mail.fl_str_mv sbubd@unicamp.br
_version_ 1809188945561387008

Registros relacionados