Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2021 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
Texto Completo: | https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640969 |
Resumo: | Orientador: Rogerio Custodio |
id |
UNICAMP-30_f447e06d80abc0aa132938d56efd38a6 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai::1162083 |
network_acronym_str |
UNICAMP-30 |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
repository_id_str |
|
spelling |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônicaDevelopment of an alternative for calculating pKa for monoprotic carboxylic acids based on electronic structure methodsPrevisão de pKaÁcidos carboxílicosMétodo direto (Química)pKa predictionCarboxylic acidsDirect method (Chemistry)Orientador: Rogerio CustodioDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de QuímicaResumo: Uma nova metodologia para cálculo de pKa foi desenvolvida, baseando-se no que se denomina método direto em solução aquosa. A partir de um ajuste seletivo da energia livre do próton solvatado, utilizando como referência moléculas com a propriedade experimental bem definida, pode-se determinar um valor aproximado para utilizando moléculas de água explícita ou não e um modelo de campo de reação: SMD ("Solvation Model Density"). O conjunto de treinamento selecionado tem papel importante na previsão e a seleção de moléculas quimicamente diversificadas contribui para uma melhor estimativa do valor do pKa. Considerando o modelo de solvatação SMD, diferentes níveis de cálculos foram averiguados: os semiempíricos (AM1 e PM6), funcionais de densidade (M06-2X, LSDA, dentre outros) além do efeito das funções de bases aug-cc-pVDZ e aug-cc-pVTZ e o método composto G4CEP. Para um conjunto de 22 ácidos carboxílicos monopróticos os resultados apresentaram erros menores do que uma unidade de pKa. Em especial, o método G4CEP apresentou um erro absoluto (EAM) de 0,63 sem moléculas de água explícitas e incluindo moléculas de água obtêm-se um EAM mínimo de 0,50. Métodos menos custosos foram muito eficientes na previsão de pKa como os níveis semiempíricos sem água explicita, AM1 e PM6, com um EAM de 0,73 e 0,57, respectivamente, e o nível LSDA/aug-cc-pVTZ contendo ou não moléculas explícitas, com EAM mínimo de 0,39 e 0,46. A efetividade para prever o pKa para moléculas diferentes também é observada quando incluem-se 22 moléculas complexas no conjunto de dados, com destaque para o nível LSDA/aug-cc-pVTZ com 2 moléculas explicitas de água que produziu um EAM de 0,48 unidades de pKa.Abstract: A new methodology for calculating pKa was developed, based on what is called a direct method in aqueous solution. From a selective adjustment of the free energy of the solvated proton, using molecules with a well-defined experimental property as a reference, an approximate value for Gaq(H+) can be determined using or not explicit water molecules and a reaction field model: SMD ("Solvation Model Density"). The selected training set plays an important role in the prediction and the selection of chemically diverse molecules contributes to a better estimate of the pKa value. Considering the SMD solvation model, different levels of calculations were investigated: semi-empirical (AM1 and PM6), density functional (M06-2X, LSDA, among others) in addition to the effect of the aug-cc-pVDZ and aug- cc-pVTZ and the composite method G4CEP. For a set of 22 monoprotic carboxylic acids, the results showed errors less than one pKa unit. In particular, the G4CEP method presented an absolute error (MAE) of 0,63 without explicit water molecules and including water molecules a minimum MAE of 0,50 is obtained. Less costly methods were very efficient in predicting pKa as the semiempirical levels without explicit water, AM1 and PM6, with an MAE of 0,73 and 0,57, respectively, and the LSDA/aug-cc-pVTZ level containing or not molecules explicit, with a minimum MEA of 0,39 and 0,46. The effectiveness for predicting pKa for different molecules is also observed when 22 complex molecules are included in the data set, with emphasis on the LSDA/aug-cc-pVTZ level with 2 explicit water molecules that produced an MAE of 0,48 pKa units.MestradoFísico-QuímicaMestre em QuímicaCAPES88887.339180/2019-00[s.n.]Custodio, Rogério, 1958-San Miguel Barrera, Miguel AngelHomem-de-Mello, PaulaUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de QuímicaPrograma de Pós-Graduação em QuímicaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASDutra, Felipe Ribeiro, 1996-20212021-03-08T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf1 recurso online ( 78 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640969DUTRA, Felipe Ribeiro. Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica . 2021. 1 recurso online ( 78 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640969. Acesso em: 3 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1162083Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2021-04-07T10:16:45Zoai::1162083Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2021-04-07T10:16:45Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica Development of an alternative for calculating pKa for monoprotic carboxylic acids based on electronic structure methods |
title |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica |
spellingShingle |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica Dutra, Felipe Ribeiro, 1996- Previsão de pKa Ácidos carboxílicos Método direto (Química) pKa prediction Carboxylic acids Direct method (Chemistry) |
title_short |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica |
title_full |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica |
title_fullStr |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica |
title_full_unstemmed |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica |
title_sort |
Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica |
author |
Dutra, Felipe Ribeiro, 1996- |
author_facet |
Dutra, Felipe Ribeiro, 1996- |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Custodio, Rogério, 1958- San Miguel Barrera, Miguel Angel Homem-de-Mello, Paula Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Química Programa de Pós-Graduação em Química UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Dutra, Felipe Ribeiro, 1996- |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Previsão de pKa Ácidos carboxílicos Método direto (Química) pKa prediction Carboxylic acids Direct method (Chemistry) |
topic |
Previsão de pKa Ácidos carboxílicos Método direto (Química) pKa prediction Carboxylic acids Direct method (Chemistry) |
description |
Orientador: Rogerio Custodio |
publishDate |
2021 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2021 2021-03-08T00:00:00Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640969 DUTRA, Felipe Ribeiro. Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica . 2021. 1 recurso online ( 78 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640969. Acesso em: 3 set. 2024. |
url |
https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640969 |
identifier_str_mv |
DUTRA, Felipe Ribeiro. Desenvolvimento de uma alternativa para cálculo de pKa para ácidos carboxílicos monopróticos baseado em métodos de estrutura eletrônica . 2021. 1 recurso online ( 78 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1640969. Acesso em: 3 set. 2024. |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1162083 Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDF |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf 1 recurso online ( 78 p.) : il., digital, arquivo PDF. |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
[s.n.] |
publisher.none.fl_str_mv |
[s.n.] |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) instacron:UNICAMP |
instname_str |
Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
instacron_str |
UNICAMP |
institution |
UNICAMP |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
repository.mail.fl_str_mv |
sbubd@unicamp.br |
_version_ |
1809189171549437952 |