The campos rupestres of Espinhaço: mountain range: genetic diversity of endemic species

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Leonardo Ferreira da
Data de Publicação: 2020
Outros Autores: Melo Júnior , Afrânio Farias de, Oliveira , Dario Alves de, Menezes, Elytania Veiga de, Royo, Vanessa de Andrade, Brandão, Murilo Malveira
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Revista Cerrados (Montes Claros. Online)
Texto Completo: https://www.periodicos.unimontes.br/index.php/cerrados/article/view/1254
Resumo: The objective of the study was to characterize the diversity and genetic structure of 82 individuals of P. adamantinum, divided into 02 populations of 41 individuals. We used 08 ISSR primers that amplified 135 loci, with 108 (80%) polymorphic loci between the populations and a mean of 16.9 loci per primer. The mean value of PIC was 0.375. The mean values ​​of the Shannon index (I) and the genetic diversity of Nei (He) were 0.491 and 0.341, respectively. The genetic diversity ratio index (GST = 0.047) showed that the variability between and within the populations contributed with 4.7% and 95.3% of the total heterozygosity (HT), respectively. The observed gene flow was high (Nm = 10,213), which contrasts the effects of genetic drift. The occurrence of low spatial genetic structuration (EGE) (Sp = 0.058) and positive coancestry in both populations (Fij = 0.0161; P < 0.123 in POP01 and Fij = 0.018; P < 0, 057 in POP02), both evaluated up to the second distance class. Even with the presence of factors favorable to inbreeding, P. adamantinum presented high levels of genetic diversity. The high recorded gene flow was responsible for mitigating the effects of mating of related individuals.
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spelling The campos rupestres of Espinhaço: mountain range: genetic diversity of endemic speciesCerrado Rupestre del Espinhaço: diversidad genética de especie endémicaCerrado rupestre do Espinhaço: diversidade genética de espécie endêmicaISSR. Fluxo Gênico. Cerrado. Espécie Endêmica. Estrutura Espacial.ISSR. Gene Flow. Cerrado. Endemic Specie. Spatial Structure.ISSR. Flujo de genes. Cerrado. Especies endêmicas. Estructura espacial.The objective of the study was to characterize the diversity and genetic structure of 82 individuals of P. adamantinum, divided into 02 populations of 41 individuals. We used 08 ISSR primers that amplified 135 loci, with 108 (80%) polymorphic loci between the populations and a mean of 16.9 loci per primer. The mean value of PIC was 0.375. The mean values ​​of the Shannon index (I) and the genetic diversity of Nei (He) were 0.491 and 0.341, respectively. The genetic diversity ratio index (GST = 0.047) showed that the variability between and within the populations contributed with 4.7% and 95.3% of the total heterozygosity (HT), respectively. The observed gene flow was high (Nm = 10,213), which contrasts the effects of genetic drift. The occurrence of low spatial genetic structuration (EGE) (Sp = 0.058) and positive coancestry in both populations (Fij = 0.0161; P < 0.123 in POP01 and Fij = 0.018; P < 0, 057 in POP02), both evaluated up to the second distance class. Even with the presence of factors favorable to inbreeding, P. adamantinum presented high levels of genetic diversity. The high recorded gene flow was responsible for mitigating the effects of mating of related individuals.El objetivo del estudio fue caracterizar la diversidad y la estructura genética de 82 individuos de P. adamantinum, una especie típica del Cerrado brasileño, en la región central de Minas Gerais, dividida en 02 poblaciones de 41 individuos. Se utilizaron 08 cebadores ISSR que amplificaron 135 loci, con 108 (80%) loci polimórficos entre poblaciones y un promedio de 16.9 loci por cebador. El valor medio de PIC fue 0.375. Los valores medios del índice de Shannon (I) y la diversidad genética de Nei (He) fueron 0.491 y 0.341, respectivamente. El índice de la proporción de diversidad genética (GST = 0.047) demostró que la variabilidad entre y dentro de las poblaciones contribuyó con 4.7% y 95.3% de la heterocigosidad total (HT), respectivamente. El flujo de genes observado fue alto (Nm = 10.213), lo que se opone a los efectos de la deriva genética. Se observó la ocurrencia de baja estructura genética espacial (EGE) (Sp = 0.058) y coancestria positivo en ambas poblaciones (Fij = 0.016; P <0.123 en POP01 y Fij = 0.018; P <0.057 en POP02), ambos evaluados hasta el segundo clase de distancia. Incluso con la presencia de factores favorables a la endogamia, P. adamantinum mostró altas tasas de diversidad genética. El alto flujo de genes registrado fue responsable de mitigar los efectos del apareamiento de individuos relacionados.O objetivo do trabalho foi de caracterizar a diversidade e a estrutura genética de 82 indivíduos de P. adamantinum, espécie de campos rupestres e de altitude do Cerrado brasileiro, na região central de Minas Gerais, divididos em 02 populações de 41 indivíduos. Foram utilizados 08 primers ISSR que amplificaram 135 locos, com 108 (80%) locos polimórficos entre as populações e média de 16,9 locos por primer. O valor médio de PIC foi de 0,375. Os valores médios do índice de Shannon (I) e da diversidade genética de Nei (He) foram de 0,491 e 0,341, respectivamente. O índice da proporção da diversidade genética (GST = 0,047) demonstrou que a variabilidade entre e dentro das populações contribuiu com 4,7% e 95,3% da heterozigosidade total (HT), respectivamente. O fluxo gênico observado foi alto (Nm = 10,213), o que contrapõe os efeitos da deriva genética. Foi observada a ocorrência de baixa estruturação genética espacial (EGE) (Sp= 0,058) e coancestria positiva nas duas populações (Fij = 0,016; P < 0,123 em POP01 e Fij = 0,018; P < 0,057 em POP02), ambas avaliadas até a segunda classe de distância. Mesmo com a presença de fatores favoráveis à endogamia, P. adamantinum apresentou altos índices de diversidade genética. O elevado fluxo gênico registrado pode terr amenizado os efeitos do acasalamento de indivíduos aparentados.Editora Unimontes2020-06-30info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionArtigoapplication/pdfhttps://www.periodicos.unimontes.br/index.php/cerrados/article/view/125410.46551/rc24482692202003Revista Cerrados; v. 18 n. 01 (2020): Revista Cerrados; 300-3302448-26921678-8346reponame:Revista Cerrados (Montes Claros. Online)instname:Universidade Estadual de Montes Claros (UNIMONTES)instacron:UNIMONTESporhttps://www.periodicos.unimontes.br/index.php/cerrados/article/view/1254/2746https://www.periodicos.unimontes.br/index.php/cerrados/article/view/1254/4046Copyright (c) 2020 Revista Cerradoshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.pt_BRinfo:eu-repo/semantics/openAccessSilva, Leonardo Ferreira da Melo Júnior , Afrânio Farias de Oliveira , Dario Alves de Menezes, Elytania Veiga de Royo, Vanessa de Andrade Brandão, Murilo Malveira 2021-04-29T01:59:07Zoai:ojs2.periodicos.unimontes.br:article/1254Revistahttps://www.periodicos.unimontes.br/index.php/cerradosPUBhttps://www.periodicos.unimontes.br/index.php/cerrados/oairevista.cerrados@unimontes.br||portal.periodicos@unimontes.br.2448-26921678-8346opendoar:2021-04-29T01:59:07Revista Cerrados (Montes Claros. Online) - Universidade Estadual de Montes Claros (UNIMONTES)false
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