Descrição metodológica do uso de marcadores moleculares associado a informações de pedigree na predição do valor genético de animais por simulação utilizando a metodologia BLUP

• Autor(a) principal: Reis, Ândrea Plotzki
• Data de Publicação: 2012
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNIPAMPA
• Texto Completo: http://dspace.unipampa.edu.br:8080/jspui/handle/riu/2857
• topic: CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS; Seleção tradicional; Seleção genômica; BLUP; Modelo misto; Tradicional selection; Genomic selection; Mixed model

O presente trabalho teve por objetivo comparar estimativas de valores genéticos dos animais por meio de pedigree tradicional e o mesmo, porém associado a marcadores moleculares, verificando a similaridade genotípica e frequência gênica, além de descrever os passos para realizar essa análise. Foram gerados arquivos de pedigree tradicional (“pedigree.txt”) e de animais genotipados (“marcadores.txt”) com marcadores do tipo SNP para análises do BLUP tradicional e marcador, respectivamente, juntamente com um arquivo de fenótipos (“fenotipo.txt”) que também foi gerado. Para a seleção tradicional foi montada a matriz de parentesco, onde apresenta o valor genético médio dos animais, baseada no pedigree. Na seleção genômica obteve-se a matriz genômica, que apresentou o valor genético genômico dos animais, baseado nos marcadores moleculares do tipo SNP. Quando comparadas, a seleção genômica foi superior em 13% sobre a seleção tradicional, apresentando correlações de 0,95 e 0,83, respectivamente, com o valor genético verdadeiro. Os resultados deste estudo revelam um grande potencial da seleção genômica em aumentar a eficiência do melhoramento genético, uma vez que as predições genômicas aumentam a acurácia de seleção comparado com a seleção tradicional.