Primeiro relato de Juncaceicola como fungo endófito associado a Deschampsia antarctica desv.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Andrade, Guilherme Afonso Kessler de
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNIPAMPA
Texto Completo: http://dspace.unipampa.edu.br:8080/jspui/handle/riu/3878
Resumo: Os fungos endófitos já foram relatados em diferentes espécies de plantas e são estudados por possuírem importante potencial biotecnológico, assim, os micólogos buscam novas espécies em locais pouco explorados. Para descrever a diversidade de fungos endófitos em locais remotos este estudo caracterizou filogeneticamente através de técnicas de biologia molecular um fungo endófito isolado de lâminas folhares de Deschampsia antarctica Desv. Foi isolado um fungo obtido a partir de fragmentos de folhas de D. antarctica coletadas na ilha Half Moon, Shetland do Sul na Antártica. A região ITS foi amplificada e sequênciada. Com o resultado do sequenciamento foi realizado alinhamento local utilizando a ferramenta BLAST e comparando com o banco de dados do NCBI. O fungo endófito foi agrupado com os demais fungos do gênero Juncaceicola Tennakoon, Camporesi, Phookamsak e K.D. Hyde (99% de identidade de sequência de nucleotídeos). O isolado utilizado no trabalho mostrou pouca identidade (40%) com as sequências ITS das espécies fúngicas pertencentes ao gênero Juncaceicola que já haviam sido depositadas no GenBank, sugerindo então que este isolado pode ser uma nova espécie descoberta na Antártica. Esta caracterização a nível de gênero, relata a primeira ocorrência de um fungo deste gênero sendo associado as folhas das plantas na Antártica.
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Para descrever a diversidade de fungos endófitos em locais remotos este estudo caracterizou filogeneticamente através de técnicas de biologia molecular um fungo endófito isolado de lâminas folhares de Deschampsia antarctica Desv. Foi isolado um fungo obtido a partir de fragmentos de folhas de D. antarctica coletadas na ilha Half Moon, Shetland do Sul na Antártica. A região ITS foi amplificada e sequênciada. Com o resultado do sequenciamento foi realizado alinhamento local utilizando a ferramenta BLAST e comparando com o banco de dados do NCBI. O fungo endófito foi agrupado com os demais fungos do gênero Juncaceicola Tennakoon, Camporesi, Phookamsak e K.D. Hyde (99% de identidade de sequência de nucleotídeos). O isolado utilizado no trabalho mostrou pouca identidade (40%) com as sequências ITS das espécies fúngicas pertencentes ao gênero Juncaceicola que já haviam sido depositadas no GenBank, sugerindo então que este isolado pode ser uma nova espécie descoberta na Antártica. Esta caracterização a nível de gênero, relata a primeira ocorrência de um fungo deste gênero sendo associado as folhas das plantas na Antártica.Endophyte fungi have been reported in several species of plants and are being used in work because they have a great biotechnological potential, therefore, researchers in the area are searching for new species in places with few explored. In order to contribute to the diversity of endophytic fungi in poorly explored sites, this study aimed to characterize phylogenetically through molecular biology techniques an endophyte fungus associated with the leaves of Deschampsia antarctica Desv. The fungus was obtained from leaf fragments from two sites on Half Moon Island, South Shetland in Antarctica. The ITS region was amplified and sequenced. With the result of the sequencing, a comparison was made using the BLAST tool and the NCBI database, with the endophyte fungus being grouped with the other fungi of the genus Juncaceicola Tennakoon, Camporesi, Phookamsak and K.D. Hyde (99% nucleotide sequence identity). The isolate used in the work showed little identity (40%) with the ITS sequences of the fungal species belonging to the genus Juncaceicola that had already been deposited in GenBank, suggesting that this isolate may be a new species discovered in Antarctica. This characterization at the genus level reports the first occurrence of a fungus of this genus being associated with the leaves of the plants in Antarctica.porUniversidade Federal do PampaUNIPAMPABrasilCampus São GabrielCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASMicologiaFilogeniaTaxonomiaMicodiversidadeAntárticaMycologyTaxonomyMicodiversityAntarcticaPhylogenyPrimeiro relato de Juncaceicola como fungo endófito associado a Deschampsia antarctica desv.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIPAMPAinstname:Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)instacron:UNIPAMPAORIGINALPrimeiro relato de Juncaceicola como fungo endófito associado a Deschampsia antarctica desv..pdfPrimeiro relato de Juncaceicola como fungo endófito associado a Deschampsia antarctica desv..pdfapplication/pdf524288https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/3878/1/Primeiro%20relato%20de%20%20Juncaceicola%20como%20fungo%20end%c3%b3fito%20associado%20a%20Deschampsia%20antarctica%20desv..pdf097d538571164bb4b415c4db9b796a35MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81866https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/3878/2/license.txt43cd690d6a359e86c1fe3d5b7cba0c9bMD52riu/38782020-01-16 10:54:28.373oai:repositorio.unipampa.edu.br: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ório InstitucionalPUBhttp://dspace.unipampa.edu.br:8080/oai/requestsisbi@unipampa.edu.bropendoar:2020-01-16T13:54:28Repositório Institucional da UNIPAMPA - Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)false
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