Associação de polimorfismos do gene da enzima Triptofano Hidroxilase 2 (TPH2) com a depressão
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNIPAMPA |
Texto Completo: | http://dspace.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/552 |
Resumo: | Estudos de associação gene-doença demonstram uma relação entre Triptofano Hidroxilase 2 (TPH2) e a depressão em diferentes populações. Entretanto, alguns estudos não demonstram essa relação. Sendo a TPH2 uma enzima limitante da taxa na via sintética para a serotonina do cérebro, vários estudos relatam os polimorfismos da enzima TPH2. Dois grandes projetos, o HapMap e o 1000 genomas, organizam a maioria dos polimorfismos a partir do estudo de várias populações disponibilizando estes dados. Este trabalho tem como objetivo desenvolver um método de estudo para obtenção de possíveis marcadores de predisposição a doença a partir da correlação entre os dados epidemiológicos e as frequências populacionais de polimorfismos. Este estudo está baseado na hipótese de que se numa população existe maior frequência de uma determinada patologia determinada geneticamente, então as variantes envolvidas deveriam estar em maior frequência e vice-versa. O modelo usado foi o envolvimento de variantes do gene TPH2 na predisposição à depressão. Os dados obtidos com correlação positiva em um dos genótipos homozigotos e também no alelo deste homozigoto sugeriram a presença de 10 polimorfismos (14,49% do total) possivelmente envolvidos no desenvolvimento do processo depressivo. Estes dados foram comparados com dados da literatura envolvendo estudos do tipo caso controle. Nestes trabalhos foram estudados 20 dos 69 polimorfismos descritos para o gene TPH2. Com exceção de um único polimorfismo, todos os dados obtidos com a nossa estratégia apresentaram-se iguais aos dados da literatura, inclusive quanto ao alelo que determinaria a predisposição à depressão, quando demonstrada associação. Portanto, propomos esta estratégia como uma forma alternativa de se realizar estudos do tipo Genome-Wide Association sem a necessidade de estudos caso-controle, apenas usando dados epidemiológicos da doença, diminuindo o tempo e custo destes estudos. |
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Reis, Samara Marques dosDelgado Cañedo, AndrésRosa, Letícia MadeiraRosa, Letícia Madeira2016-09-27T19:12:07Z2016-09-27T19:12:07Z2015-01-23http://dspace.unipampa.edu.br/jspui/handle/riu/552Estudos de associação gene-doença demonstram uma relação entre Triptofano Hidroxilase 2 (TPH2) e a depressão em diferentes populações. Entretanto, alguns estudos não demonstram essa relação. Sendo a TPH2 uma enzima limitante da taxa na via sintética para a serotonina do cérebro, vários estudos relatam os polimorfismos da enzima TPH2. Dois grandes projetos, o HapMap e o 1000 genomas, organizam a maioria dos polimorfismos a partir do estudo de várias populações disponibilizando estes dados. Este trabalho tem como objetivo desenvolver um método de estudo para obtenção de possíveis marcadores de predisposição a doença a partir da correlação entre os dados epidemiológicos e as frequências populacionais de polimorfismos. Este estudo está baseado na hipótese de que se numa população existe maior frequência de uma determinada patologia determinada geneticamente, então as variantes envolvidas deveriam estar em maior frequência e vice-versa. O modelo usado foi o envolvimento de variantes do gene TPH2 na predisposição à depressão. Os dados obtidos com correlação positiva em um dos genótipos homozigotos e também no alelo deste homozigoto sugeriram a presença de 10 polimorfismos (14,49% do total) possivelmente envolvidos no desenvolvimento do processo depressivo. Estes dados foram comparados com dados da literatura envolvendo estudos do tipo caso controle. Nestes trabalhos foram estudados 20 dos 69 polimorfismos descritos para o gene TPH2. Com exceção de um único polimorfismo, todos os dados obtidos com a nossa estratégia apresentaram-se iguais aos dados da literatura, inclusive quanto ao alelo que determinaria a predisposição à depressão, quando demonstrada associação. Portanto, propomos esta estratégia como uma forma alternativa de se realizar estudos do tipo Genome-Wide Association sem a necessidade de estudos caso-controle, apenas usando dados epidemiológicos da doença, diminuindo o tempo e custo destes estudos.Disease-gene association studies reported a relation between the Tryptophan Hydroxylase 2 (TPH2) and depression in different populations. However, some studies do not demonstrate this relationship. Being TPH2 a limiting enzyme in the rate of synthetic route of serotonin in the brain, many studies reported the polymorphisms of the TPH2 enzyme. Two huge projects, HapMap and 1000 genomes, organized the major part of these polymorphisms from the study of several populations becoming these data available. This work is aimed to develop a system to obtain possible predisposition markers of a disease from the correlation between epidemiological data and population frequencies of polymorphism. This study is based in the hypothesis that if in a population there is more frequency of a certain kind of pathology genetically determined, the variables involved should be more frequent and vice-versa. The model used was the involvement of variables of the TPH2 gene in the predisposition of depression. The data obtained with positive correlation in one of homozygous genotypes and in the allele of this homozygous suggested the presence of 10 polymorphisms (total 14,49%) possibly related to the development of depression. These data were compared to the literature involving case-control studies. In this work were studied 20 from 69 polymorphisms described to the TPH2 gene. With the exception of only one polymorphism, all the data obtained through the strategy proposed in here was similar to the literature, including the allele that is determinant to the predisposition of depression, when it is demonstrated the association. Therefore, we have proposed this strategy as an alternative to realize this kind of Genome-Wide Association studies without the necessity of a case control study, only using the epidemiological data from the disease, decreasing the time and the cost of this study.Universidade Federal do PampaCampus São GabrielAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRAPolimorfismoTriptofano Hidroxilase 2DepressãoPolymorphsTryptophan Hydroxylase 2DepressionAssociação de polimorfismos do gene da enzima Triptofano Hidroxilase 2 (TPH2) com a depressãoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisporreponame:Repositório Institucional da UNIPAMPAinstname:Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)instacron:UNIPAMPAORIGINALAssociação de Polimorfismo do gene da enzima Triptofano Hidroxilase 2 (TPH2) com a depressão..pdfAssociação de Polimorfismo do gene da enzima Triptofano Hidroxilase 2 (TPH2) com a depressão..pdfapplication/pdf1543228https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/552/1/Associa%c3%a7%c3%a3o%20de%20Polimorfismo%20do%20gene%20da%20enzima%20Triptofano%20Hidroxilase%202%20%28TPH2%29%20com%20a%20depress%c3%a3o..pdf4b03823b496140a9ce4a04dd2f7ed966MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81232https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/552/2/license_rdf66e71c371cc565284e70f40736c94386MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/552/3/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53TEXTAssociação de Polimorfismo do gene da enzima Triptofano Hidroxilase 2 (TPH2) com a depressão..pdf.txtAssociação de Polimorfismo do gene da enzima Triptofano Hidroxilase 2 (TPH2) com a depressão..pdf.txtExtracted texttext/plain75559https://repositorio.unipampa.edu.br/jspui/bitstream/riu/552/4/Associa%c3%a7%c3%a3o%20de%20Polimorfismo%20do%20gene%20da%20enzima%20Triptofano%20Hidroxilase%202%20%28TPH2%29%20com%20a%20depress%c3%a3o..pdf.txt0eaeec9d576adc4a7c25934f52f0ebe6MD54riu/5522021-03-26 13:53:37.485oai:repositorio.unipampa.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://dspace.unipampa.edu.br:8080/oai/requestsisbi@unipampa.edu.bropendoar:2021-03-26T16:53:37Repositório Institucional da UNIPAMPA - Universidade Federal do Pampa (UNIPAMPA)false |
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