Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2007 |
Outros Autores: | , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452007000300029 http://hdl.handle.net/11449/3349 |
Resumo: | O gênero Fusarium é responsável por doenças em diversas plantas economicamente importantes. Entre estas doenças, destaca-se a malformação da mangueira, causada pelo fungo Fusarium subglutinans. O objetivo deste trabalho foi desenvolver oligonucleotídeos iniciadores para reação em cadeia da polimerase (PCR), específicos para o fungo F. subglutinans da mangueira. A amplificação de DNA de oito Fusarium spp. de diferentes hospedeiros, usando o oligonucleotídeo randômico UBC-41 (TTAACCGGGG), produziu um fragmento de aproximadamente 1.300 pb somente para o fungo da mangueira. Tendo em vista que padrões de bandeamento por RAPD não são considerados confiáveis devido à baixa reprodutibilidade dos resultados, o fragmento diferencial foi eluído do gel de agarose, purificado, clonado e seqüenciado. As seqüências nucleotídicas foram utilizadas para identificar e sintetizar quatro pares de oligonucleotídeos específicos, denominados Fs 5, Fs 13, Fs 14 e Fs 15. DNAs de Fusarium spp. de outros hospedeiros (alho, amendoim, cana-de-açúcar, ciclâmen, ervilha, melão e trigo), da planta de mangueira cv. Tommy Atkins sadia e de outros cinco isolados de F. subglutinans de mangueira sintomática, foram submetidos à amplificação com os pares de oligonucleotídeos. Fragmentos amplificados foram visualizados somente para F. subglutinans de mangueira, demonstrando assim a especificidade dos oligonucleotídeos SCAR desenhados. |
id |
UNSP_02af17d02d2f78830923e8c15220a74d |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unesp.br:11449/3349 |
network_acronym_str |
UNSP |
network_name_str |
Repositório Institucional da UNESP |
repository_id_str |
2946 |
spelling |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueiraUse of molecular marker SCAR in the identification of Fusarium subglutinans,causal agent of mango malformationprimersMangifera indicaMolecular markersRAPD-PCRoligonucleotídeos iniciadoresMangifera indicaMarcadores molecularesRAPD-PCRO gênero Fusarium é responsável por doenças em diversas plantas economicamente importantes. Entre estas doenças, destaca-se a malformação da mangueira, causada pelo fungo Fusarium subglutinans. O objetivo deste trabalho foi desenvolver oligonucleotídeos iniciadores para reação em cadeia da polimerase (PCR), específicos para o fungo F. subglutinans da mangueira. A amplificação de DNA de oito Fusarium spp. de diferentes hospedeiros, usando o oligonucleotídeo randômico UBC-41 (TTAACCGGGG), produziu um fragmento de aproximadamente 1.300 pb somente para o fungo da mangueira. Tendo em vista que padrões de bandeamento por RAPD não são considerados confiáveis devido à baixa reprodutibilidade dos resultados, o fragmento diferencial foi eluído do gel de agarose, purificado, clonado e seqüenciado. As seqüências nucleotídicas foram utilizadas para identificar e sintetizar quatro pares de oligonucleotídeos específicos, denominados Fs 5, Fs 13, Fs 14 e Fs 15. DNAs de Fusarium spp. de outros hospedeiros (alho, amendoim, cana-de-açúcar, ciclâmen, ervilha, melão e trigo), da planta de mangueira cv. Tommy Atkins sadia e de outros cinco isolados de F. subglutinans de mangueira sintomática, foram submetidos à amplificação com os pares de oligonucleotídeos. Fragmentos amplificados foram visualizados somente para F. subglutinans de mangueira, demonstrando assim a especificidade dos oligonucleotídeos SCAR desenhados.The Fusarium genus is responsible for serious diseases in many economically important crops. Among these diseases it is distinguished the mango flower malformation, caused by the fungus Fusarium subglutinans. The objective of this work was to develop specific oligonucleotide primers for the polymerase chain reaction (PCR) targeting the mango flower malformation by fungus F. subglutinans. The DNA amplification of eight Fusarium spp. collected from different hosts making the use of a random oligonucleotide primer UBC-41 generated a fragment of approximately 1300 pb in size, specifically for the mango flower malformation fungus (Fusarium subglutinans). Since standard RAPD banding patterns are not considered reliable because of their low results of reproducibility, the distinctive fragment was eluted off the agarose gel, purified, cloned and then sequenced. The nucleotide sequences were used to identify and also to synthesize four pairs of specific oligonucleotide named herein Fs 5, Fs 13, Fs 14 and Fs 15. Other Fusarium spp. DNAs sampled from other hosts (garlic, peanut, sugarcane, cyclamen, pea, melon and wheat), from a healthy mango tree cv. Tommy Atkins and other six isolates from symptomatic mango plants were submitted to PCR amplification with these pairs of oligonucleotide. Only fragments from the mango tree fungus Fusarium subglutinans were visualized, showing this way the SCAR oligonucleotide specificity.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Universidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de Produção VegetalUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de TecnologiaUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de Produção VegetalUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de TecnologiaSociedade Brasileira de FruticulturaUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Zaccaro, Ronaldo Posella [UNESP]Carareto-Alves, Lucia Maria [UNESP]Travensolo, Regiane Fátima [UNESP]Wickert, Ester [UNESP]Lemos, Eliana Gertrudes Macedo [UNESP]2014-05-20T13:16:32Z2014-05-20T13:16:32Z2007-01-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article563-570application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452007000300029Revista Brasileira de Fruticultura. Sociedade Brasileira de Fruticultura, v. 29, n. 3, p. 563-570, 2007.0100-2945http://hdl.handle.net/11449/334910.1590/S0100-29452007000300029S0100-29452007000300029S0100-29452007000300029.pdfSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporRevista Brasileira de Fruticultura0.4750,410info:eu-repo/semantics/openAccess2024-06-07T15:31:46Zoai:repositorio.unesp.br:11449/3349Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T16:35:51.820854Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira Use of molecular marker SCAR in the identification of Fusarium subglutinans,causal agent of mango malformation |
title |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira |
spellingShingle |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira Zaccaro, Ronaldo Posella [UNESP] primers Mangifera indica Molecular markers RAPD-PCR oligonucleotídeos iniciadores Mangifera indica Marcadores moleculares RAPD-PCR |
title_short |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira |
title_full |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira |
title_fullStr |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira |
title_full_unstemmed |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira |
title_sort |
Utilização de marcador molecular SCAR na identificação de Fusarium subglutinans, agente causal da malformação da mangueira |
author |
Zaccaro, Ronaldo Posella [UNESP] |
author_facet |
Zaccaro, Ronaldo Posella [UNESP] Carareto-Alves, Lucia Maria [UNESP] Travensolo, Regiane Fátima [UNESP] Wickert, Ester [UNESP] Lemos, Eliana Gertrudes Macedo [UNESP] |
author_role |
author |
author2 |
Carareto-Alves, Lucia Maria [UNESP] Travensolo, Regiane Fátima [UNESP] Wickert, Ester [UNESP] Lemos, Eliana Gertrudes Macedo [UNESP] |
author2_role |
author author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Universidade Estadual Paulista (Unesp) |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Zaccaro, Ronaldo Posella [UNESP] Carareto-Alves, Lucia Maria [UNESP] Travensolo, Regiane Fátima [UNESP] Wickert, Ester [UNESP] Lemos, Eliana Gertrudes Macedo [UNESP] |
dc.subject.por.fl_str_mv |
primers Mangifera indica Molecular markers RAPD-PCR oligonucleotídeos iniciadores Mangifera indica Marcadores moleculares RAPD-PCR |
topic |
primers Mangifera indica Molecular markers RAPD-PCR oligonucleotídeos iniciadores Mangifera indica Marcadores moleculares RAPD-PCR |
description |
O gênero Fusarium é responsável por doenças em diversas plantas economicamente importantes. Entre estas doenças, destaca-se a malformação da mangueira, causada pelo fungo Fusarium subglutinans. O objetivo deste trabalho foi desenvolver oligonucleotídeos iniciadores para reação em cadeia da polimerase (PCR), específicos para o fungo F. subglutinans da mangueira. A amplificação de DNA de oito Fusarium spp. de diferentes hospedeiros, usando o oligonucleotídeo randômico UBC-41 (TTAACCGGGG), produziu um fragmento de aproximadamente 1.300 pb somente para o fungo da mangueira. Tendo em vista que padrões de bandeamento por RAPD não são considerados confiáveis devido à baixa reprodutibilidade dos resultados, o fragmento diferencial foi eluído do gel de agarose, purificado, clonado e seqüenciado. As seqüências nucleotídicas foram utilizadas para identificar e sintetizar quatro pares de oligonucleotídeos específicos, denominados Fs 5, Fs 13, Fs 14 e Fs 15. DNAs de Fusarium spp. de outros hospedeiros (alho, amendoim, cana-de-açúcar, ciclâmen, ervilha, melão e trigo), da planta de mangueira cv. Tommy Atkins sadia e de outros cinco isolados de F. subglutinans de mangueira sintomática, foram submetidos à amplificação com os pares de oligonucleotídeos. Fragmentos amplificados foram visualizados somente para F. subglutinans de mangueira, demonstrando assim a especificidade dos oligonucleotídeos SCAR desenhados. |
publishDate |
2007 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2007-01-01 2014-05-20T13:16:32Z 2014-05-20T13:16:32Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452007000300029 Revista Brasileira de Fruticultura. Sociedade Brasileira de Fruticultura, v. 29, n. 3, p. 563-570, 2007. 0100-2945 http://hdl.handle.net/11449/3349 10.1590/S0100-29452007000300029 S0100-29452007000300029 S0100-29452007000300029.pdf |
url |
http://dx.doi.org/10.1590/S0100-29452007000300029 http://hdl.handle.net/11449/3349 |
identifier_str_mv |
Revista Brasileira de Fruticultura. Sociedade Brasileira de Fruticultura, v. 29, n. 3, p. 563-570, 2007. 0100-2945 10.1590/S0100-29452007000300029 S0100-29452007000300029 S0100-29452007000300029.pdf |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.none.fl_str_mv |
Revista Brasileira de Fruticultura 0.475 0,410 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
563-570 application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Sociedade Brasileira de Fruticultura |
publisher.none.fl_str_mv |
Sociedade Brasileira de Fruticultura |
dc.source.none.fl_str_mv |
SciELO reponame:Repositório Institucional da UNESP instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP) instacron:UNESP |
instname_str |
Universidade Estadual Paulista (UNESP) |
instacron_str |
UNESP |
institution |
UNESP |
reponame_str |
Repositório Institucional da UNESP |
collection |
Repositório Institucional da UNESP |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1808128223637143552 |