Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Nascimento, Suzana Fortolan Baptista do [UNESP]
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/134122
Resumo: Mutualistic associations affect all living organisms. A useful biological model for studies of mutualism are Attini ants, whose nutrition depends on the association with basidiomycete fungi. These fungi produce depolymerases that act on degrading plant material, producing simple sugars that are essential for the survival of ants. Biochemical studies suggest that may be metabolic pathways, starting with steps catalyzed by fungal enzymes and ending with steps catalyzed by enzymes of the ants. Genomic studies indicate that the ants may not be able to synthesize some amino acids that would be supplied by the fungi, thus characterizing nutritional mutualistic dependence. To assess the extent of this metabolic dependence, in this thesis we aimed to annotate the transcriptome of Attine ant Atta sexdens rubropilosa in search of metabolic pathways. The presence and expression of genes from transcriptomics data of next generation sequencing were evaluated
id UNSP_03b518b88a2d76a55258bc318a84f1bf
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/134122
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)AntsFormigaMutualismoFungosMetabolismoExpressão gênicaMutualistic associations affect all living organisms. A useful biological model for studies of mutualism are Attini ants, whose nutrition depends on the association with basidiomycete fungi. These fungi produce depolymerases that act on degrading plant material, producing simple sugars that are essential for the survival of ants. Biochemical studies suggest that may be metabolic pathways, starting with steps catalyzed by fungal enzymes and ending with steps catalyzed by enzymes of the ants. Genomic studies indicate that the ants may not be able to synthesize some amino acids that would be supplied by the fungi, thus characterizing nutritional mutualistic dependence. To assess the extent of this metabolic dependence, in this thesis we aimed to annotate the transcriptome of Attine ant Atta sexdens rubropilosa in search of metabolic pathways. The presence and expression of genes from transcriptomics data of next generation sequencing were evaluatedAs associações de mutualismo afetam a vida de todos os organismos vivos. Um modelo biológico muito útil para estudos sobre o mutualismo são as formigas da tribo Attini, cuja nutrição depende da associação com fungos basidiomicetos. Estes fungos produzem despolimerases que degradam a matéria vegetal, gerando açúcares simples que são essenciais para a sobrevivência das formigas. Estudos bioquímicos sugerem que pode haver vias metabólicas mutualistas, iniciando com passos catalisados por enzimas fúngicas e terminando com passos catalisados por enzimas das formigas. Estudos genômicos indicam que as formigas podem não ser capazes de sintetizar alguns aminoácidos, que seriam supridos pelos fungos. Estudos em microbiologia sugerem que as formigas utilizam antibióticos microbianos para proteção contra eventuais entomopatógenos. Desta forma, caracteriza-se uma dependência nutricional e de metabólitos microbianos pelas formigas. Para avaliar a extensão desta dependência, na presente dissertação de mestrado nós anotamos o transcriptoma da formiga Attini Atta sexdens rubropilosa em busca das vias metabólicas com elementos mais expressos. Foram avaliadas a presença e expressão de genes a partir de dados de transcriptômica de nova...Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Bacci Junior, Mauricio [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Nascimento, Suzana Fortolan Baptista do [UNESP]2016-02-05T18:29:49Z2016-02-05T18:29:49Z2015-02-24info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis70 f. : il., tabs.application/pdfNASCIMENTO, Suzana Fortolan Baptista do. Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae). 2015. 70 f. Dissertação - (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências de Rio Claro, 2015.http://hdl.handle.net/11449/134122000856041000856041.pdf33004137046P43776345573864268Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporinfo:eu-repo/semantics/openAccess2024-01-23T07:10:28Zoai:repositorio.unesp.br:11449/134122Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T23:47:18.356724Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)
title Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)
spellingShingle Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)
Nascimento, Suzana Fortolan Baptista do [UNESP]
Ants
Formiga
Mutualismo
Fungos
Metabolismo
Expressão gênica
title_short Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)
title_full Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)
title_fullStr Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)
title_full_unstemmed Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)
title_sort Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae)
author Nascimento, Suzana Fortolan Baptista do [UNESP]
author_facet Nascimento, Suzana Fortolan Baptista do [UNESP]
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Bacci Junior, Mauricio [UNESP]
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Nascimento, Suzana Fortolan Baptista do [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Ants
Formiga
Mutualismo
Fungos
Metabolismo
Expressão gênica
topic Ants
Formiga
Mutualismo
Fungos
Metabolismo
Expressão gênica
description Mutualistic associations affect all living organisms. A useful biological model for studies of mutualism are Attini ants, whose nutrition depends on the association with basidiomycete fungi. These fungi produce depolymerases that act on degrading plant material, producing simple sugars that are essential for the survival of ants. Biochemical studies suggest that may be metabolic pathways, starting with steps catalyzed by fungal enzymes and ending with steps catalyzed by enzymes of the ants. Genomic studies indicate that the ants may not be able to synthesize some amino acids that would be supplied by the fungi, thus characterizing nutritional mutualistic dependence. To assess the extent of this metabolic dependence, in this thesis we aimed to annotate the transcriptome of Attine ant Atta sexdens rubropilosa in search of metabolic pathways. The presence and expression of genes from transcriptomics data of next generation sequencing were evaluated
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-02-24
2016-02-05T18:29:49Z
2016-02-05T18:29:49Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv NASCIMENTO, Suzana Fortolan Baptista do. Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae). 2015. 70 f. Dissertação - (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências de Rio Claro, 2015.
http://hdl.handle.net/11449/134122
000856041
000856041.pdf
33004137046P4
3776345573864268
identifier_str_mv NASCIMENTO, Suzana Fortolan Baptista do. Caracterização transcriptômica de vias metabólicas na formiga Attini Atta sexdens rubropilosa Forel, 1908 (Hymenoptera, Formicidae). 2015. 70 f. Dissertação - (mestrado) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências de Rio Claro, 2015.
000856041
000856041.pdf
33004137046P4
3776345573864268
url http://hdl.handle.net/11449/134122
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 70 f. : il., tabs.
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv Aleph
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808129551880945664