Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sakakibara, Raquel Toshie
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/239420
Resumo: O conceito de DOHaD (Origens do Desenvolvimento da Saúde e da Doença) busca compreender a correlação entre a ocorrência de doenças metabólicas durante a vida adulta com injúrias sofridas durante o desenvolvimento intrauterino. Um dos modelos experimentais mais utilizados para esses estudos é a submissão de roedores a restrição proteica materna (RPM) durante a gestação e/ou a lactação, sendo descrito nesse modelo baixo peso da prole ao nascimento, alterações metabólicas sistêmicas, além de alterações órgão-específicas, incluindo próstata, sendo reportado atraso no desenvolvimento e aumento da incidência de câncer de próstata (CaP) com o envelhecimento. Os principais mecanismos epigenéticos abrangem a metilação de DNA, modificação pós-transcricional de histonas e RNAs não codificantes. Em destaque a metilação de DNA é uma modificação química herdável que ocorre em regiões promotoras de genes e tem papel significativo na regulação e no silenciamento da expressão gênica. O objetivo desse trabalho foi avaliar o potencial dos mRNAs (GDEs) e proteínas diferencialmente expressas (PDEs) na próstata ventral (PV) de ratos submetidos à RPM, no final do desenvolvimento prostático no DPN 21, integrando-os aos dados de metilação de DNA do The Cancer Genoma Atlas – (PRAD-TCGA) de pacientes com CaP. Na metodologia utilizamos os dados de RNA-Seq (GSE180673) e proteômica gerados pelo nosso grupo de pesquisa da PV de animais submetidos a RPM no DPN 21, e comparamos com os dados globais de metilação de CaP do TCGA-PRAD (499 amostras de CaP e 50 de tecidos normais adjacentes ao tumor) utilizando o pacote TCGAbiolinks. Identificamos as “ilhas CpG” (Probes ID) diferencialmente metiladas (DMGs), depois os relacionamos com os GDEs e PDEs na PV dos animais submetidos à RPM. Em seguida, utilizamos a ferramenta Shiny GO para análise funcional dos processos biológicos. O The Human Protein Atlas (HPA) database foi utilizado para a detecção da imunohistoquímica dos respectivos genes no tecido prostático normal e tumoral. A determinação da expressão gênica foi feita através do RT-qPCR. Nossos resultados demonstraram que a RPM altera os parâmetros epigenéticos durante o início da vida e persiste na vida adulta, destacando o gene Cyp7b1 como um possível biomarcador da origem desenvolvimentista do CaP.
id UNSP_0bce3cbbc53b8380b4e3a2e760abb22f
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/239420
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.DNA methylation as an epigenetic mechanism of modulation of genes and proteins differentially expressed in the ventral prostate of rats submitted to maternal protein restriction and in patients with prostate cancer: translational approach in silicoEpigenéticaDOHaDCâncer de próstata.O conceito de DOHaD (Origens do Desenvolvimento da Saúde e da Doença) busca compreender a correlação entre a ocorrência de doenças metabólicas durante a vida adulta com injúrias sofridas durante o desenvolvimento intrauterino. Um dos modelos experimentais mais utilizados para esses estudos é a submissão de roedores a restrição proteica materna (RPM) durante a gestação e/ou a lactação, sendo descrito nesse modelo baixo peso da prole ao nascimento, alterações metabólicas sistêmicas, além de alterações órgão-específicas, incluindo próstata, sendo reportado atraso no desenvolvimento e aumento da incidência de câncer de próstata (CaP) com o envelhecimento. Os principais mecanismos epigenéticos abrangem a metilação de DNA, modificação pós-transcricional de histonas e RNAs não codificantes. Em destaque a metilação de DNA é uma modificação química herdável que ocorre em regiões promotoras de genes e tem papel significativo na regulação e no silenciamento da expressão gênica. O objetivo desse trabalho foi avaliar o potencial dos mRNAs (GDEs) e proteínas diferencialmente expressas (PDEs) na próstata ventral (PV) de ratos submetidos à RPM, no final do desenvolvimento prostático no DPN 21, integrando-os aos dados de metilação de DNA do The Cancer Genoma Atlas – (PRAD-TCGA) de pacientes com CaP. Na metodologia utilizamos os dados de RNA-Seq (GSE180673) e proteômica gerados pelo nosso grupo de pesquisa da PV de animais submetidos a RPM no DPN 21, e comparamos com os dados globais de metilação de CaP do TCGA-PRAD (499 amostras de CaP e 50 de tecidos normais adjacentes ao tumor) utilizando o pacote TCGAbiolinks. Identificamos as “ilhas CpG” (Probes ID) diferencialmente metiladas (DMGs), depois os relacionamos com os GDEs e PDEs na PV dos animais submetidos à RPM. Em seguida, utilizamos a ferramenta Shiny GO para análise funcional dos processos biológicos. O The Human Protein Atlas (HPA) database foi utilizado para a detecção da imunohistoquímica dos respectivos genes no tecido prostático normal e tumoral. A determinação da expressão gênica foi feita através do RT-qPCR. Nossos resultados demonstraram que a RPM altera os parâmetros epigenéticos durante o início da vida e persiste na vida adulta, destacando o gene Cyp7b1 como um possível biomarcador da origem desenvolvimentista do CaP.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)CNPq: 4098 4/2021Universidade Estadual Paulista (Unesp)Justulin Jr, Luis Antônio [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Sakakibara, Raquel Toshie2023-02-09T13:20:53Z2023-02-09T13:20:53Z2023-02-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/239420porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2024-01-21T06:28:14Zoai:repositorio.unesp.br:11449/239420Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-01-21T06:28:14Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.
DNA methylation as an epigenetic mechanism of modulation of genes and proteins differentially expressed in the ventral prostate of rats submitted to maternal protein restriction and in patients with prostate cancer: translational approach in silico
title Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.
spellingShingle Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.
Sakakibara, Raquel Toshie
Epigenética
DOHaD
Câncer de próstata.
title_short Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.
title_full Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.
title_fullStr Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.
title_full_unstemmed Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.
title_sort Metilação do DNA como mecanismo epigenético da modulação de genes e proteínas diferencialmente expressas na próstata ventral de ratos submetidos à restrição proteica materna e em pacientes com câncer de próstata: abordagem translacional in sílico.
author Sakakibara, Raquel Toshie
author_facet Sakakibara, Raquel Toshie
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Justulin Jr, Luis Antônio [UNESP]
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Sakakibara, Raquel Toshie
dc.subject.por.fl_str_mv Epigenética
DOHaD
Câncer de próstata.
topic Epigenética
DOHaD
Câncer de próstata.
description O conceito de DOHaD (Origens do Desenvolvimento da Saúde e da Doença) busca compreender a correlação entre a ocorrência de doenças metabólicas durante a vida adulta com injúrias sofridas durante o desenvolvimento intrauterino. Um dos modelos experimentais mais utilizados para esses estudos é a submissão de roedores a restrição proteica materna (RPM) durante a gestação e/ou a lactação, sendo descrito nesse modelo baixo peso da prole ao nascimento, alterações metabólicas sistêmicas, além de alterações órgão-específicas, incluindo próstata, sendo reportado atraso no desenvolvimento e aumento da incidência de câncer de próstata (CaP) com o envelhecimento. Os principais mecanismos epigenéticos abrangem a metilação de DNA, modificação pós-transcricional de histonas e RNAs não codificantes. Em destaque a metilação de DNA é uma modificação química herdável que ocorre em regiões promotoras de genes e tem papel significativo na regulação e no silenciamento da expressão gênica. O objetivo desse trabalho foi avaliar o potencial dos mRNAs (GDEs) e proteínas diferencialmente expressas (PDEs) na próstata ventral (PV) de ratos submetidos à RPM, no final do desenvolvimento prostático no DPN 21, integrando-os aos dados de metilação de DNA do The Cancer Genoma Atlas – (PRAD-TCGA) de pacientes com CaP. Na metodologia utilizamos os dados de RNA-Seq (GSE180673) e proteômica gerados pelo nosso grupo de pesquisa da PV de animais submetidos a RPM no DPN 21, e comparamos com os dados globais de metilação de CaP do TCGA-PRAD (499 amostras de CaP e 50 de tecidos normais adjacentes ao tumor) utilizando o pacote TCGAbiolinks. Identificamos as “ilhas CpG” (Probes ID) diferencialmente metiladas (DMGs), depois os relacionamos com os GDEs e PDEs na PV dos animais submetidos à RPM. Em seguida, utilizamos a ferramenta Shiny GO para análise funcional dos processos biológicos. O The Human Protein Atlas (HPA) database foi utilizado para a detecção da imunohistoquímica dos respectivos genes no tecido prostático normal e tumoral. A determinação da expressão gênica foi feita através do RT-qPCR. Nossos resultados demonstraram que a RPM altera os parâmetros epigenéticos durante o início da vida e persiste na vida adulta, destacando o gene Cyp7b1 como um possível biomarcador da origem desenvolvimentista do CaP.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-02-09T13:20:53Z
2023-02-09T13:20:53Z
2023-02-06
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/239420
url http://hdl.handle.net/11449/239420
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1803047391032508416