Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2018 |
Outros Autores: | , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://dx.doi.org/10.1590/1806-9126-rbef-2018-0068 http://hdl.handle.net/11449/157816 |
Resumo: | Abstract This work aims to introduce students of physics and related areas to the problem of protein folding. Proteins are biological macromolecules of great importance to living things. The understanding of how this macromolecule finds a three-dimensional and functional structure, using the information present in a linear sequence of different amino acids, is a relevant question which involves researchers from different areas of knowledge. This work discusses the importance and the main properties of proteins and presents a brief history of protein folding studies and how these works converge to the Energy Landscape theory. There are described some theoretical and computational models from analytical approaches to the development of the Structure-Based Models for simulations. Here it is also presented and discussed some expected results for each used model. |
id |
UNSP_3e1adff5f45fb15494c186c9c8d0b947 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unesp.br:11449/157816 |
network_acronym_str |
UNSP |
network_name_str |
Repositório Institucional da UNESP |
repository_id_str |
2946 |
spelling |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificadosIntroduction to the Protein Folding Problem: An Approach Using Simplified Computational ModelsProtein FoldingEnergy LandscapeStructure-Based ModelsLattice ModelBiophysicsEnovelamento de proteínasSuperfície de energiaModelos baseados em estruturaModelo de redeBiofísicaAbstract This work aims to introduce students of physics and related areas to the problem of protein folding. Proteins are biological macromolecules of great importance to living things. The understanding of how this macromolecule finds a three-dimensional and functional structure, using the information present in a linear sequence of different amino acids, is a relevant question which involves researchers from different areas of knowledge. This work discusses the importance and the main properties of proteins and presents a brief history of protein folding studies and how these works converge to the Energy Landscape theory. There are described some theoretical and computational models from analytical approaches to the development of the Structure-Based Models for simulations. Here it is also presented and discussed some expected results for each used model.Resumo Este trabalho tem como objetivo introduzir estudantes de física e áreas afins ao problema de enovelamento de proteína. A proteína é uma macromolécula biológica de grande importância para os seres vivos. Entender como esta macromolécula encontra uma configuração tridimensional e funcional, tomando como a priori a informação presente em uma sequência linear de diferentes aminoácidos, é uma questão relevante e envolve pesquisadores de diversas áreas do conhecimento. Neste trabalho, é apresentada uma introdução sobre a importância das proteínas e suas principais características, além de mostrar um breve histórico do estudo de enovelamento de proteínas e como esses trabalhos convergem na construção da teoria de Superfície de Energia. São descritos alguns modelos teóricos e computacionais, desde as primeiras abordagens em modelos analíticos até a construção de modelos baseados em estruturas para simulações. Também são apresentados e discutidos alguns resultados esperados em cada modelo utilizado.Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do BioetanolUniversidade Estadual Paulista Instituto de Biociências Departamento de FísicaRice University Center for Theoretical Biological PhysicsUniversidade Federal do Triângulo Mineiro Instituto de Ciências Exatas Departamento de FísicaUniversidade Estadual Paulista Instituto de Biociências Departamento de FísicaSociedade Brasileira de FísicaCentro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do BioetanolUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Rice University Center for Theoretical Biological PhysicsUniversidade Federal do Triângulo Mineiro Instituto de Ciências Exatas Departamento de FísicaGodoi Contessoto, Vinícius DeOliveira Junior, Antonio Bento DeChahine, JorgeOliveira, Ronaldo Junio DePereira Leite, Vitor Barbanti2018-11-12T17:27:04Z2018-11-12T17:27:04Z2018info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article-application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/1806-9126-rbef-2018-0068Revista Brasileira de Ensino de Física. Sociedade Brasileira de Física, v. 40, n. 4, p. -, 2018.1806-1117http://hdl.handle.net/11449/15781610.1590/1806-9126-rbef-2018-0068S1806-11172018000400407S1806-11172018000400407.pdfSciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporRevista Brasileira de Ensino de Física0,202info:eu-repo/semantics/openAccess2024-01-02T06:16:31Zoai:repositorio.unesp.br:11449/157816Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T21:53:58.034376Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados Introduction to the Protein Folding Problem: An Approach Using Simplified Computational Models |
title |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados |
spellingShingle |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados Godoi Contessoto, Vinícius De Protein Folding Energy Landscape Structure-Based Models Lattice Model Biophysics Enovelamento de proteínas Superfície de energia Modelos baseados em estrutura Modelo de rede Biofísica |
title_short |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados |
title_full |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados |
title_fullStr |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados |
title_full_unstemmed |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados |
title_sort |
Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados |
author |
Godoi Contessoto, Vinícius De |
author_facet |
Godoi Contessoto, Vinícius De Oliveira Junior, Antonio Bento De Chahine, Jorge Oliveira, Ronaldo Junio De Pereira Leite, Vitor Barbanti |
author_role |
author |
author2 |
Oliveira Junior, Antonio Bento De Chahine, Jorge Oliveira, Ronaldo Junio De Pereira Leite, Vitor Barbanti |
author2_role |
author author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol Universidade Estadual Paulista (Unesp) Rice University Center for Theoretical Biological Physics Universidade Federal do Triângulo Mineiro Instituto de Ciências Exatas Departamento de Física |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Godoi Contessoto, Vinícius De Oliveira Junior, Antonio Bento De Chahine, Jorge Oliveira, Ronaldo Junio De Pereira Leite, Vitor Barbanti |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Protein Folding Energy Landscape Structure-Based Models Lattice Model Biophysics Enovelamento de proteínas Superfície de energia Modelos baseados em estrutura Modelo de rede Biofísica |
topic |
Protein Folding Energy Landscape Structure-Based Models Lattice Model Biophysics Enovelamento de proteínas Superfície de energia Modelos baseados em estrutura Modelo de rede Biofísica |
description |
Abstract This work aims to introduce students of physics and related areas to the problem of protein folding. Proteins are biological macromolecules of great importance to living things. The understanding of how this macromolecule finds a three-dimensional and functional structure, using the information present in a linear sequence of different amino acids, is a relevant question which involves researchers from different areas of knowledge. This work discusses the importance and the main properties of proteins and presents a brief history of protein folding studies and how these works converge to the Energy Landscape theory. There are described some theoretical and computational models from analytical approaches to the development of the Structure-Based Models for simulations. Here it is also presented and discussed some expected results for each used model. |
publishDate |
2018 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2018-11-12T17:27:04Z 2018-11-12T17:27:04Z 2018 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://dx.doi.org/10.1590/1806-9126-rbef-2018-0068 Revista Brasileira de Ensino de Física. Sociedade Brasileira de Física, v. 40, n. 4, p. -, 2018. 1806-1117 http://hdl.handle.net/11449/157816 10.1590/1806-9126-rbef-2018-0068 S1806-11172018000400407 S1806-11172018000400407.pdf |
url |
http://dx.doi.org/10.1590/1806-9126-rbef-2018-0068 http://hdl.handle.net/11449/157816 |
identifier_str_mv |
Revista Brasileira de Ensino de Física. Sociedade Brasileira de Física, v. 40, n. 4, p. -, 2018. 1806-1117 10.1590/1806-9126-rbef-2018-0068 S1806-11172018000400407 S1806-11172018000400407.pdf |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.none.fl_str_mv |
Revista Brasileira de Ensino de Física 0,202 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
- application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Sociedade Brasileira de Física |
publisher.none.fl_str_mv |
Sociedade Brasileira de Física |
dc.source.none.fl_str_mv |
SciELO reponame:Repositório Institucional da UNESP instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP) instacron:UNESP |
instname_str |
Universidade Estadual Paulista (UNESP) |
instacron_str |
UNESP |
institution |
UNESP |
reponame_str |
Repositório Institucional da UNESP |
collection |
Repositório Institucional da UNESP |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1808129371222835200 |