Prevalência da excreção e caracterização molecular do poliomavírus humano JC em amostras de urina de pacientes com aids sem leucoencefalopatia multifocal pro-gressiva

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Centrone, Cristiane de Campos [UNESP]
Data de Publicação: 2009
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/118631
Resumo: The human poliomavirus is the etiologic agente of Progressive multifocal leukoencephalopathy (PML), a disease characterized by focal lesions not expansives of the central nervous system that develops in imunocompromissed patients, specially people with aids. The main aim of the study was to evalute the prevalence of the JCV excretion in urine samples of patients with aids, without PML, to compare two JCV DNA detection techniques through of two diferents genomic regions and to evaluate the genotypic characterization of the positive samples. A total of 75 samples were colected in the Instituto de Infectologia Emílio Ribas, in Sao Paulo, Brazil, between may and november, 2009. To detect the JC virus it was made the DNA extraction and then the polimerase chain reaction (PCR). Firstly a fragment of 215 bp was amplified, which corresponds to the codifying gene of the strutural protein of de JC vírus capsid VP1. All the samples were later submitted to another PCR that uses a pair of primers complementaries to the early region of the JCV (T antigen) amplifying a fragment of 173 bp. Followed by the digestion of the amplified product with the restriction enzime BamH1, resulting in two smaller fragments (120 bp and 53 bp). The JC vírus was detected in 53 samples, for both techniques (70,7% for VP1 PCR, and the restriction enzime BamH1), 34/46 were men (73,9%) and 19/29 were women (65,5%). The JCV excretion was higher in individuals that were over 46 years old. Regarding the seven genotypes described in the literature, the ones that were more prevalent among the JC positive patients were 3B and 3A with 10 samples each (21,0%), the 2B with 9 samples (19,0%) and genotype 6, with six samples (13,0%). As in the brown patients as the white ones, the most prevalent genotype was 3B. In the present study it was observed a high prevalence of JCV DNA (70,7%) and the genotype 3 (43,0%)... (Complete abstract click electronic access below)
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Firstly a fragment of 215 bp was amplified, which corresponds to the codifying gene of the strutural protein of de JC vírus capsid VP1. All the samples were later submitted to another PCR that uses a pair of primers complementaries to the early region of the JCV (T antigen) amplifying a fragment of 173 bp. Followed by the digestion of the amplified product with the restriction enzime BamH1, resulting in two smaller fragments (120 bp and 53 bp). The JC vírus was detected in 53 samples, for both techniques (70,7% for VP1 PCR, and the restriction enzime BamH1), 34/46 were men (73,9%) and 19/29 were women (65,5%). The JCV excretion was higher in individuals that were over 46 years old. Regarding the seven genotypes described in the literature, the ones that were more prevalent among the JC positive patients were 3B and 3A with 10 samples each (21,0%), the 2B with 9 samples (19,0%) and genotype 6, with six samples (13,0%). As in the brown patients as the white ones, the most prevalent genotype was 3B. In the present study it was observed a high prevalence of JCV DNA (70,7%) and the genotype 3 (43,0%)... (Complete abstract click electronic access below)O poliomavírus humano JC (VJC) é o agente etiológico da leucoencefalopatia multifocal progressiva (LEMP), uma doença caracterizada por lesões focais não expansivas do sistema nervoso central que atinge pacientes imunocomprometidos, especialmente pessoas com aids. O objetivo principal do estudo foi determinar a prevalência da excreção do VJC em amostras de urina de pacientes com aids, sem LEMP, comparar duas técnicas de detecção do DNA do vírus JC através de duas diferentes regiões genômicas e determinar a caracterização genotípica das amostras positivas. Um total de 75 amostras foram colhidas no Instituto de Infectologia Emílio Ribas, em São Paulo, Brasil, entre maio e novembro de 2009. Para a detecção do vírus JC foi realizada a extração do DNA das amostras e posterior reação em cadeia por polimerase (PCR). Inicialmente amplificou-se um fragmento de 215pb, o qual corresponde ao gene codificador da proteína estrutural VP1 do capsídeo do vírus JC. Todas as amostras foram posteriormente submetidas à outra PCR que utiliza um par de primers complementar à região precoce do VJC (antígeno T) amplificando um fragmento de 173pb. Seguiu-se a digestão do produto amplificado com enzima de restrição Bam H1, resultando em dois fragmentos menores (120pb e 53pb). O vírus JC foi detectado em 53 amostras, igualmente para ambas as técnicas (70,7% para PCR da VP1 e enzima Bam H1), sendo 34/46 homens (73,9%) e 19/29 mulheres (65,5%). A excreção do VJC foi maior nos indivíduos acima de 46 anos. Dos 7 genótipos descritos na literatura, os que mais prevaleceram entre os pacientes JC positivos foram o 3B e o 3A em 10 amostras ambos (21,0%), o 2B em 9 amostras (19,0%) e o tipo 6 em 6 amostras (13,0%). Tanto nos pacientes pardos como nos pacientes brancos, o genótipo que prevaleceu foi o 3B. No presente estudo verificou-se uma alta prevalência... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)Universidade Estadual Paulista (Unesp)Pannuti, Claudio Sergio [UNESP]FinK, Maria Cristina Domingues da Silva [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Centrone, Cristiane de Campos [UNESP]2015-03-23T15:11:58Z2015-03-23T15:11:58Z2009info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfCENTRONE, Cristiane de Campos. Prevalência da excreção e caracterização molecular do poliomavírus humano JC em amostras de urina de pacientes com aids sem leucoencefalopatia multifocal pro-gressiva. 2009. 1 CD-ROM. Trabalho de conclusão de curso (bacharelado - Ciências Biológicas – Modalidade Médica) - Universidade Estadual Paulista, Instituto de Biociências de Botucatu, 2009.http://hdl.handle.net/11449/118631000637278centrone_cc_tcc_botib.pdfAlephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporinfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-12-05T06:22:08Zoai:repositorio.unesp.br:11449/118631Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T19:35:04.487516Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
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