Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Alleoni, Natália
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/216546
Resumo: O Brasil é o maior produtor de laranjas doce do mundo, e a citricultura constitui uma das atividades agrícolas mais importantes para nosso país. A citricultura é ameaçada pelo cancro cítrico, uma doença infecciosa e sem cura, que acomete todas as variedades de citros de importância comercial. O agente etiológico desta doença é a bactéria Gram-negativa Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri), que se encontra presente e em caráter endêmico no estado de São Paulo, o maior produtor de laranjas doce do mundo. Este estado foi declarado área de mitigação de risco (SMR), com o uso de sprays regulares de formulações a base de cobre. Tais medidas, embora eficazes, são paliativas, pois a resistência ao cobre já foi documentada em X. citri, além do fato de ser este um metal bio-cumulativo e tóxico. Assim o objetivo foi verificar variações fenotípicas e/ou genotípicas em isolados de X. citri de áreas diferentes. Foram obtidos 390 isolados de Xanthomonas citri subsp. citri e foram testadas 89 para susceptibilidade a cobre. Os isolados foram classificados em: 79 como sensíveis (CuS), 8 tolerantes (CuT) e 1 como mais tolerantes (CuT+); não foram obtidos isolados resistentes ao cobre. Com exceção dos controles, nenhuma das linhagens testadas apresentaram amplificação para os genes copLAB e copABCD, indicando ausência dos plasmídeos de resistência. Ainda, as linhagens foram testadas quanto a sua susceptibilidade aos antibióticos comerciais: ácido nalidíxico, canamicina, rifampicina e cloranfenicol. Estas não apresentaram crescimento nas concentrações de canamicina e rifampicina capazes de inibir a linhagem CuS X. citri 306 - usada como controle neste teste - porém, mostraram-se resistentes a clorafenicol crescendo em todas as concentrações testadas. O ácido nalidíxico foi capaz de inibir o crescimento de todas as linhagens, com execeção a CuT+ CAJ 45 que apresentou crescimento na concentração mais baixa (7,5 μg/mL). Das linhagens testadas, apenas 3 (CAJ 28, CAJ 73 e AM 52) apresentaram alterações na motilidade, crescendo similarmente ao controle CuS X. citri 306, já os demais isolados apresentaram crescimento semelhante aos controles CuR, indicando que uma maior tolerância não altera a motilidade. No teste de biofilme apenas o isolado CuT+ CAJ 45 apresentou uma redução significativa na formação de biofilme, contrariando o esperado que uma linhagem mais tolerante produz mais biofilme.
id UNSP_4d1f42ff9dbb7a8b894b6dd9fe24cc33
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/216546
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítricoGenetic and phenotypic profiles of Xanthomonas citri isolated from orchards with different incidences of citrus cankerMicroorganismos fitopatogênicosBiologia molecularCobrePhytopathogenic microorganismsMolecular biologyCopperO Brasil é o maior produtor de laranjas doce do mundo, e a citricultura constitui uma das atividades agrícolas mais importantes para nosso país. A citricultura é ameaçada pelo cancro cítrico, uma doença infecciosa e sem cura, que acomete todas as variedades de citros de importância comercial. O agente etiológico desta doença é a bactéria Gram-negativa Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri), que se encontra presente e em caráter endêmico no estado de São Paulo, o maior produtor de laranjas doce do mundo. Este estado foi declarado área de mitigação de risco (SMR), com o uso de sprays regulares de formulações a base de cobre. Tais medidas, embora eficazes, são paliativas, pois a resistência ao cobre já foi documentada em X. citri, além do fato de ser este um metal bio-cumulativo e tóxico. Assim o objetivo foi verificar variações fenotípicas e/ou genotípicas em isolados de X. citri de áreas diferentes. Foram obtidos 390 isolados de Xanthomonas citri subsp. citri e foram testadas 89 para susceptibilidade a cobre. Os isolados foram classificados em: 79 como sensíveis (CuS), 8 tolerantes (CuT) e 1 como mais tolerantes (CuT+); não foram obtidos isolados resistentes ao cobre. Com exceção dos controles, nenhuma das linhagens testadas apresentaram amplificação para os genes copLAB e copABCD, indicando ausência dos plasmídeos de resistência. Ainda, as linhagens foram testadas quanto a sua susceptibilidade aos antibióticos comerciais: ácido nalidíxico, canamicina, rifampicina e cloranfenicol. Estas não apresentaram crescimento nas concentrações de canamicina e rifampicina capazes de inibir a linhagem CuS X. citri 306 - usada como controle neste teste - porém, mostraram-se resistentes a clorafenicol crescendo em todas as concentrações testadas. O ácido nalidíxico foi capaz de inibir o crescimento de todas as linhagens, com execeção a CuT+ CAJ 45 que apresentou crescimento na concentração mais baixa (7,5 μg/mL). Das linhagens testadas, apenas 3 (CAJ 28, CAJ 73 e AM 52) apresentaram alterações na motilidade, crescendo similarmente ao controle CuS X. citri 306, já os demais isolados apresentaram crescimento semelhante aos controles CuR, indicando que uma maior tolerância não altera a motilidade. No teste de biofilme apenas o isolado CuT+ CAJ 45 apresentou uma redução significativa na formação de biofilme, contrariando o esperado que uma linhagem mais tolerante produz mais biofilme.Brazil is the largest sweet orange producer in the world, and citriculture represents an important economic activity in the country. The sector is threatened by citrus canker, an infectious and incurable disease that affects all commercially important citrus varieties. The causing agent of this disease is the Gram-negative bacteria Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri), which is present and endemic in the state of São Paulo. São Paulo was declared an area of risk mitigation (SMR), with the use of regular sprays of copper formulations. Such measures, although effective, seem palliative, as copper resistance has already been documented in X. citri, in addition to the fact that this is a bio-accumulative and toxic metal. Thus, the objective was to verify phenotypic and/or genotypic variations in X. citri isolates from different areas. 390 isolates of Xanthomonas citri subsp. citri were obtained and 89 were tested for their copper susceptibility. The isolates were then classified accordingly, as: 79 as sensitive (CuS), 8 tolerant (CuT) and 1 as more tolerant (CuT+), no isolates resistant to copper were obtained. With the exception of the positive controls, none of the isolates tested amplified bands for the genes copLAB and copABCD, remarking the absence of resistance plasmids. Furthermore, the isolates were tested for their susceptibility to commercial antibiotics: nalidixic acid, kanamycin, rifampicin and chloramphenicol. The isolates did not grow under concentrations of kanamycin and rifampicin capable of inhibiting the CuS X. citri 306 strain - used as a control in this test - however, they were resistant to chloramphenicol, growing on all tested concentrations. Nalidixic acid was able to inhibit the growth of all isolates, with the exception of CuT+ CAJ 45, which showed growth at the lowest concentration (7.5 μg/mL). Of the strains tested, only 3 (CAJ 28, CAJ 73 and AM 52) showed changes in motility, growing similarly to the CuS X. citri 306 control, while the other isolates showed similar growth to the CuR controls, indicating that a greater tolerance does not change motility. In the biofilm test, the isolate CuT+ CAJ 45 showed a significant reduction in biofilm formation, contrary to the expected that a more tolerant strain produces more biofilm.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 18/24953-0Universidade Estadual Paulista (Unesp)Ferreira, Henrique [UNESP]Zamuner, Caio Felipe CavicchiaUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Alleoni, Natália2022-02-11T16:42:14Z2022-02-11T16:42:14Z2022-01-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/216546porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2023-11-07T06:10:26Zoai:repositorio.unesp.br:11449/216546Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T17:04:35.826868Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico
Genetic and phenotypic profiles of Xanthomonas citri isolated from orchards with different incidences of citrus canker
title Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico
spellingShingle Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico
Alleoni, Natália
Microorganismos fitopatogênicos
Biologia molecular
Cobre
Phytopathogenic microorganisms
Molecular biology
Copper
title_short Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico
title_full Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico
title_fullStr Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico
title_full_unstemmed Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico
title_sort Perfil genético e fenotípico de linhagens Xanthomonas citri isoladas de pomares com diferentes incidências de cancro cítrico
author Alleoni, Natália
author_facet Alleoni, Natália
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Ferreira, Henrique [UNESP]
Zamuner, Caio Felipe Cavicchia
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Alleoni, Natália
dc.subject.por.fl_str_mv Microorganismos fitopatogênicos
Biologia molecular
Cobre
Phytopathogenic microorganisms
Molecular biology
Copper
topic Microorganismos fitopatogênicos
Biologia molecular
Cobre
Phytopathogenic microorganisms
Molecular biology
Copper
description O Brasil é o maior produtor de laranjas doce do mundo, e a citricultura constitui uma das atividades agrícolas mais importantes para nosso país. A citricultura é ameaçada pelo cancro cítrico, uma doença infecciosa e sem cura, que acomete todas as variedades de citros de importância comercial. O agente etiológico desta doença é a bactéria Gram-negativa Xanthomonas citri subsp. citri (X. citri), que se encontra presente e em caráter endêmico no estado de São Paulo, o maior produtor de laranjas doce do mundo. Este estado foi declarado área de mitigação de risco (SMR), com o uso de sprays regulares de formulações a base de cobre. Tais medidas, embora eficazes, são paliativas, pois a resistência ao cobre já foi documentada em X. citri, além do fato de ser este um metal bio-cumulativo e tóxico. Assim o objetivo foi verificar variações fenotípicas e/ou genotípicas em isolados de X. citri de áreas diferentes. Foram obtidos 390 isolados de Xanthomonas citri subsp. citri e foram testadas 89 para susceptibilidade a cobre. Os isolados foram classificados em: 79 como sensíveis (CuS), 8 tolerantes (CuT) e 1 como mais tolerantes (CuT+); não foram obtidos isolados resistentes ao cobre. Com exceção dos controles, nenhuma das linhagens testadas apresentaram amplificação para os genes copLAB e copABCD, indicando ausência dos plasmídeos de resistência. Ainda, as linhagens foram testadas quanto a sua susceptibilidade aos antibióticos comerciais: ácido nalidíxico, canamicina, rifampicina e cloranfenicol. Estas não apresentaram crescimento nas concentrações de canamicina e rifampicina capazes de inibir a linhagem CuS X. citri 306 - usada como controle neste teste - porém, mostraram-se resistentes a clorafenicol crescendo em todas as concentrações testadas. O ácido nalidíxico foi capaz de inibir o crescimento de todas as linhagens, com execeção a CuT+ CAJ 45 que apresentou crescimento na concentração mais baixa (7,5 μg/mL). Das linhagens testadas, apenas 3 (CAJ 28, CAJ 73 e AM 52) apresentaram alterações na motilidade, crescendo similarmente ao controle CuS X. citri 306, já os demais isolados apresentaram crescimento semelhante aos controles CuR, indicando que uma maior tolerância não altera a motilidade. No teste de biofilme apenas o isolado CuT+ CAJ 45 apresentou uma redução significativa na formação de biofilme, contrariando o esperado que uma linhagem mais tolerante produz mais biofilme.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-02-11T16:42:14Z
2022-02-11T16:42:14Z
2022-01-19
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/216546
url http://hdl.handle.net/11449/216546
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808128751343501312