Técnicas multivariadas na determinação da diversidade genética em gergelim usando marcadores RAPD

• Autor(a) principal: Arriel, Nair Helena Castro
• Data de Publicação: 2006
• Outros Autores: Di Mauro, Antônio Orlando [UNESP], Di Mauro, Sônia Marli Zingaretti [UNESP], Bakke, Olaf Andreas, Unêda-Trevisoli, Sandra Helena [UNESP], Costa, Marcelo Marchi [UNESP], Capeloto, Andréa [UNESP], Corrado, Amanda Roberta [UNESP]
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
• Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2006000500012; http://hdl.handle.net/11449/27385
• topic: Sesamum indicum; clustering analyses; principal coordinates; Sesamum indicum; Análise de agrupamento; coordenadas principais

O objetivo deste trabalho foi comparar diferentes técnicas multivariadas na caracterização de 35 genótipos de gergelim mediante 769 marcadores RAPD. As distâncias genéticas foram obtidas pelo complemento aritmético do coeficiente de Jaccard e agrupadas pelos métodos hierárquicos do vizinho mais próximo, do vizinho mais distante, das médias aritméticas não ponderadas (UPGMA), do método de otimização de Tocher e análises de coordenadas principais. O agrupamento dos genótipos foi alterado em função dos diferentes métodos usados. Adotando-se a mesma distância genética (0,36) como valor de corte, diferenciaram-se quatro grupos no método do vizinho mais próximo, 13 para o vizinho mais distante, 11 no UPGMA e quatro no Tocher. Entre os métodos hierárquicos, o UPGMA apresentou o melhor ajuste das distâncias originais e estimadas (CCC = 0,89). As análises das coordenadas principais confirmaram a baixa diversidade existente entre os genótipos. A maior divergência ocorreu entre as cultivares Seridó 1 e Arawaca 4, e a menor, entre os genótipos VCR-101 e GP-3314. As três primeiras coordenadas principais contabilizaram 35,13% do total da variabilidade, e 18 autovalores foram necessários para explicar 81% da variação genética. Os métodos UPGMA, de otimização de Tocher, e as análises de coordenadas principais são complementares na formação dos grupos.