Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Camargo, Vinicius da Silva
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/152687
Resumo: Este trabalho teve como objetivos determinar a ocorrência e realizar a caracterização molecular de Cryptosporidium spp. e comparar três métodos de detecção deste protozoário em amostras fecais de canários (Serinus canaria) criados em cativeiro nas regiões Sul e Sudeste do Brasil. Um total de 498 amostras foi purificado por centrífugo-flutuação em solução de Sheather. A detecção de Cryptosporidium spp. foi realizada utilizando três métodos de diagnóstico: análise microscópica pela coloração negativa com verde malaquita, nested PCR (gene 18S rRNA), seguida de sequenciamento dos fragmentos amplificados, e PCR em duplex em tempo real (gene 18S rRNA) específica para detecção de Cryptosporidium galli e Cryptosporidium genótipo III de aves. A positividade para Cryptosporidium spp. (total de amostras positivas em pelo menos um método de diagnóstico) obtida pela análise microscópica, nested PCR e PCR duplex em tempo real foi de 13,3% (66/498). As taxas de positividade para Cryptosporidium spp. foram 2,0% (10/498) e 4,6% (23/498) por microscopia e nested PCR, respectivamente. O sequenciamento de 20 amostras amplificadas pela nested PCR identificou C. galli (3,0%;15/498), Cryptosporidium genótipo I de aves (0,8%; 4/498) e Cryptosporidium avium (0,2%; 1/498). A PCR duplex em tempo real revelou positividade de 7,8% (39/498) para C. galli e 2,4% (12/498) para Cryptosporidium genótipo III de aves. A análise microscópica diferiu significativamente da nested PCR para detecção de Cryptosporidium spp. A PCR duplex em tempo real apresentou maior sensibilidade que a nested PCR/sequenciamento para detectar as espécies/genótipos gástricos de Cryptosporidium.
id UNSP_70a8ac6afc4a750c80079118a9744f09
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/152687
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnósticoDetection and characterization of cryptosporidium spp. In canaries (serinus canaria) kept in captivity using different diagnosis methodsCriptosporidioseavesReação em cadeia da polimeraseEpidemiologiaBirdscryptosporidiosisPolymerase chain reactionepidemiologyEste trabalho teve como objetivos determinar a ocorrência e realizar a caracterização molecular de Cryptosporidium spp. e comparar três métodos de detecção deste protozoário em amostras fecais de canários (Serinus canaria) criados em cativeiro nas regiões Sul e Sudeste do Brasil. Um total de 498 amostras foi purificado por centrífugo-flutuação em solução de Sheather. A detecção de Cryptosporidium spp. foi realizada utilizando três métodos de diagnóstico: análise microscópica pela coloração negativa com verde malaquita, nested PCR (gene 18S rRNA), seguida de sequenciamento dos fragmentos amplificados, e PCR em duplex em tempo real (gene 18S rRNA) específica para detecção de Cryptosporidium galli e Cryptosporidium genótipo III de aves. A positividade para Cryptosporidium spp. (total de amostras positivas em pelo menos um método de diagnóstico) obtida pela análise microscópica, nested PCR e PCR duplex em tempo real foi de 13,3% (66/498). As taxas de positividade para Cryptosporidium spp. foram 2,0% (10/498) e 4,6% (23/498) por microscopia e nested PCR, respectivamente. O sequenciamento de 20 amostras amplificadas pela nested PCR identificou C. galli (3,0%;15/498), Cryptosporidium genótipo I de aves (0,8%; 4/498) e Cryptosporidium avium (0,2%; 1/498). A PCR duplex em tempo real revelou positividade de 7,8% (39/498) para C. galli e 2,4% (12/498) para Cryptosporidium genótipo III de aves. A análise microscópica diferiu significativamente da nested PCR para detecção de Cryptosporidium spp. A PCR duplex em tempo real apresentou maior sensibilidade que a nested PCR/sequenciamento para detectar as espécies/genótipos gástricos de Cryptosporidium.This study used several diagnostic methods to examine the occurrence of and molecularly characterize Cryptosporidium spp. in captive canaries (Serinus canaria) in southern and southeastern Brazil. A total of 498 samples were purified by centrifugal-flotation using Sheather's solution. Cryptosporidium spp. diagnosis was performed using three diagnostic methods: malachite green negative staining, nested PCR targeting the 18S rRNA gene, followed by sequencing the amplified fragments, and duplex real-time PCR targeting the 18S rRNA specific to detect Cryptosporidium galli and Cryptosporidium avian genotype III. The overall positivity for Cryptosporidium spp. (total samples positive in at least one protocol) from the microscopic analysis, nested PCR and duplex real-time PCR protocol results was 13.3% (66/498). The positivity rates were 2.0% (10/498) and 4.6% (23/498) for Cryptosporidium spp. by microscopy and nested PCR, respectively. Sequencing of 20 samples amplified by nested PCR identified C. galli (3.0%; 15/498), Cryptosporidium avian genotype I (0.8%; 4/498) and Cryptosporidium avium (0.2%; 1/498). Duplex real-time PCR revealed a positivity of 7.8% (39/498) for C. galli and 2.4% (12/498) for avian genotype III. Malachite green negative staining differed significantly from nested PCR in detecting Cryptosporidium spp.. Duplex real-time PCR was more sensitive than nested PCR/sequencing for detecting gastric Cryptosporidium in canaries.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 15/26334-8Universidade Estadual Paulista (Unesp)Meireles, Marcelo VasconcelosNakamura, Alex AkiraUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Camargo, Vinicius da Silva2018-02-07T13:04:54Z2018-02-07T13:04:54Z2017-12-15info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/15268700089664233004021075P80903513897615274por182029info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2024-01-29T06:24:27Zoai:repositorio.unesp.br:11449/152687Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-06T00:11:30.063502Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico
Detection and characterization of cryptosporidium spp. In canaries (serinus canaria) kept in captivity using different diagnosis methods
title Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico
spellingShingle Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico
Camargo, Vinicius da Silva
Criptosporidiose
aves
Reação em cadeia da polimerase
Epidemiologia
Birds
cryptosporidiosis
Polymerase chain reaction
epidemiology
title_short Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico
title_full Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico
title_fullStr Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico
title_full_unstemmed Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico
title_sort Detecção e caracterização molecular de cryptosporidium spp. em canários (serinus canaria) mantidos em cativeiro por meio de diferentes métodos de diagnóstico
author Camargo, Vinicius da Silva
author_facet Camargo, Vinicius da Silva
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Meireles, Marcelo Vasconcelos
Nakamura, Alex Akira
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Camargo, Vinicius da Silva
dc.subject.por.fl_str_mv Criptosporidiose
aves
Reação em cadeia da polimerase
Epidemiologia
Birds
cryptosporidiosis
Polymerase chain reaction
epidemiology
topic Criptosporidiose
aves
Reação em cadeia da polimerase
Epidemiologia
Birds
cryptosporidiosis
Polymerase chain reaction
epidemiology
description Este trabalho teve como objetivos determinar a ocorrência e realizar a caracterização molecular de Cryptosporidium spp. e comparar três métodos de detecção deste protozoário em amostras fecais de canários (Serinus canaria) criados em cativeiro nas regiões Sul e Sudeste do Brasil. Um total de 498 amostras foi purificado por centrífugo-flutuação em solução de Sheather. A detecção de Cryptosporidium spp. foi realizada utilizando três métodos de diagnóstico: análise microscópica pela coloração negativa com verde malaquita, nested PCR (gene 18S rRNA), seguida de sequenciamento dos fragmentos amplificados, e PCR em duplex em tempo real (gene 18S rRNA) específica para detecção de Cryptosporidium galli e Cryptosporidium genótipo III de aves. A positividade para Cryptosporidium spp. (total de amostras positivas em pelo menos um método de diagnóstico) obtida pela análise microscópica, nested PCR e PCR duplex em tempo real foi de 13,3% (66/498). As taxas de positividade para Cryptosporidium spp. foram 2,0% (10/498) e 4,6% (23/498) por microscopia e nested PCR, respectivamente. O sequenciamento de 20 amostras amplificadas pela nested PCR identificou C. galli (3,0%;15/498), Cryptosporidium genótipo I de aves (0,8%; 4/498) e Cryptosporidium avium (0,2%; 1/498). A PCR duplex em tempo real revelou positividade de 7,8% (39/498) para C. galli e 2,4% (12/498) para Cryptosporidium genótipo III de aves. A análise microscópica diferiu significativamente da nested PCR para detecção de Cryptosporidium spp. A PCR duplex em tempo real apresentou maior sensibilidade que a nested PCR/sequenciamento para detectar as espécies/genótipos gástricos de Cryptosporidium.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-12-15
2018-02-07T13:04:54Z
2018-02-07T13:04:54Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/152687
000896642
33004021075P8
0903513897615274
url http://hdl.handle.net/11449/152687
identifier_str_mv 000896642
33004021075P8
0903513897615274
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv 182029
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808129593356320768