Abordagem in-sílico para seleção de miRNAs relacionados a carne de Tilápia para fins de melhoramento genético.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Nogueira, Ravi Augustus
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/194153
Resumo: O melhoramento genético proporciona aumento na produtividade em diversas áreas, devido a seleção convencional e a organismos geneticamente modificados (OGMs). A maioria dos animais melhorados e linhagens de peixes “melhoradas” tem origem por “seleção convencional” o que é mais dispendioso, tanto em tempo como financeiro. Usando ferramentas de bioinformática (gprofiler, Weka, R entre outros) e banco de dados (Ensembl, KEGG, NCBI), foram realizadas análises de dados de transcriptoma provenientes da tilápia do nilo (Oreochromis niloticus), usando o sistema operacional Linux. Dentre mais de 15.000 miRNAs provenientes dos dados analisados, foi selecionado um miRNA, sendo ele o miR-214-3p atuante em 3 vias metabólicas de interesse no presente trabalho, ao mesmo tempo: mTOR/Akt, via Hippo e Ubiquitin Ligase todas relacionadas ao crescimento e desenvolvimento muscular.
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spelling Abordagem in-sílico para seleção de miRNAs relacionados a carne de Tilápia para fins de melhoramento genético.in-silico approach for miRNA selection related to Tilapia meat for genetic improvement.miRNATilapiaOreochromis NiloticusTranscriptomamicroRNAMicro RNATranscriptomesO melhoramento genético proporciona aumento na produtividade em diversas áreas, devido a seleção convencional e a organismos geneticamente modificados (OGMs). A maioria dos animais melhorados e linhagens de peixes “melhoradas” tem origem por “seleção convencional” o que é mais dispendioso, tanto em tempo como financeiro. Usando ferramentas de bioinformática (gprofiler, Weka, R entre outros) e banco de dados (Ensembl, KEGG, NCBI), foram realizadas análises de dados de transcriptoma provenientes da tilápia do nilo (Oreochromis niloticus), usando o sistema operacional Linux. Dentre mais de 15.000 miRNAs provenientes dos dados analisados, foi selecionado um miRNA, sendo ele o miR-214-3p atuante em 3 vias metabólicas de interesse no presente trabalho, ao mesmo tempo: mTOR/Akt, via Hippo e Ubiquitin Ligase todas relacionadas ao crescimento e desenvolvimento muscular.The genetic improvement due to conventional selection and genetically modified organisms (OGMs) generates an increase in productivity on several areas. Most of the “improved” animals and fish lineages originate from “conventional selection”, which is costlier: both in time and financially. Using tools from Bioinformatics (g:Profiler, Weka, R, amongst others) and various data banks (Ensembl, KEGG, NCBI), data analyses of transcriptome from Nile tilapia (Oreochromis niloticus) using the Linux operational system. Amongst more than 15,000 miRNAs a miRNA was selected, being the miR-214-3p active being active on 3 pathways of interest in the present work: mTOR/Akt, Hippo and Ubiquitin Ligase, all related to muscle development and growth.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)CAPES: 001Universidade Estadual Paulista (Unesp)Lemke, Ney [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Nogueira, Ravi Augustus2020-10-22T13:00:06Z2020-10-22T13:00:06Z2020-03-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/19415333004064080P37977035910952141porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2023-10-22T06:06:13Zoai:repositorio.unesp.br:11449/194153Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T15:35:21.475222Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
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