Mapeamento físico dos genes ribosomais 18S e 5S em peixes do gênero Trichomycterus (Teleostei, Trichomycteridae)
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2011 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11449/120299 |
Resumo: | The present study aimed to cytogenetic analysis and structural and molecular level of four fish species of the genus Trichomycterus: T. diabolus, T. iheringi, T. zonatus and T. cf. mimonha collected in different river basins in Brazil. Techniques were used for classical cytogenetic (Giemsa, Silver nitrate impregnation, C-banding) and molecular with the chromosomal location of genes for 18S and 5S rDNA. All individuals examined had a diploid number 54 chromosomes and karyotype consisting of types of metacentric, submetacentric and subtelocentric. The constitutive heterochromatin identified by C-banding was observed in two small blocks in the karyotype of T. diabolus and large blocks of centromeric several pairs in chromosomal karyotypes of T. iheringi, T. zonatus and T. cf. mimonha. The Silver nitrate impregnation and hybridization with 18S rDNA probe revealed the existence of only a couple carryng nucleolar organizing regions (NORs) on the species T. diabolus, T. iheringi and T. cf mimonha, and two pairs carrying 18S rDNA in T. zonatus. The 5S rDNA was observed in interstitial position 6 of the pair in T. iheringi, the synteny with the two pair in 18S rDNA of T.diabolus in pericentromeric position of and two pairs submetacentric, one being also a case of synteny with the 18S rDNA in T. zonatus and T. cf. mimonha, this rDNA was located in the pairs 3, 18 and 25, and synteny in the 18S rDNA pair 18. Although representatives of these four species Trichomycterus present diploid number and karyotypic formula preserved, three is specific about the distribuition patterns of heterochromatin and location of rDNA sequences, indicating that chromosomal differentiation events in this group of fish are acting directly on these genomic portions |
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Mapeamento físico dos genes ribosomais 18S e 5S em peixes do gênero Trichomycterus (Teleostei, Trichomycteridae)PeixeTeleosteosHeterocromatinaEvolução (Biologia)Citogenética animalThe present study aimed to cytogenetic analysis and structural and molecular level of four fish species of the genus Trichomycterus: T. diabolus, T. iheringi, T. zonatus and T. cf. mimonha collected in different river basins in Brazil. Techniques were used for classical cytogenetic (Giemsa, Silver nitrate impregnation, C-banding) and molecular with the chromosomal location of genes for 18S and 5S rDNA. All individuals examined had a diploid number 54 chromosomes and karyotype consisting of types of metacentric, submetacentric and subtelocentric. The constitutive heterochromatin identified by C-banding was observed in two small blocks in the karyotype of T. diabolus and large blocks of centromeric several pairs in chromosomal karyotypes of T. iheringi, T. zonatus and T. cf. mimonha. The Silver nitrate impregnation and hybridization with 18S rDNA probe revealed the existence of only a couple carryng nucleolar organizing regions (NORs) on the species T. diabolus, T. iheringi and T. cf mimonha, and two pairs carrying 18S rDNA in T. zonatus. The 5S rDNA was observed in interstitial position 6 of the pair in T. iheringi, the synteny with the two pair in 18S rDNA of T.diabolus in pericentromeric position of and two pairs submetacentric, one being also a case of synteny with the 18S rDNA in T. zonatus and T. cf. mimonha, this rDNA was located in the pairs 3, 18 and 25, and synteny in the 18S rDNA pair 18. Although representatives of these four species Trichomycterus present diploid number and karyotypic formula preserved, three is specific about the distribuition patterns of heterochromatin and location of rDNA sequences, indicating that chromosomal differentiation events in this group of fish are acting directly on these genomic portionsO presente trabalho teve por objetivo a análise citogenética em nível estrutural e molecular de quatro espécies de peixes do gênero Trichomycterus: T. diabolus, T. iheringi, T. zonatus e T. cf. mimonha, coletados em diferentes bacias hidrográficas do Brasil. Foram utilizadas técnicas citogenéticas clássicas (Giemsa, impregnação por nitrato de Prata e Bandamento C) e moleculares, com a localização cromossômica dos genes de DNAr 18S e 5S. Todos os indivíduos analisados apresentaram número diplóide de 54 cromossomos e cariótipo constituído por cromossomos dos tipos metacêntricos, submetacêntricos e subtelocêntricos. A heterocromatina constitutiva, identificada pelo bandamento C, foi observada em pequenos blocos em dois pares cromossômicos no cariótipo de T. diabolus e em grandes blocos centroméricos em vários pares cromossômicos nos cariótipos de T. iheringi, T. zonatus e T. cf. mimonha. A impregnação pelo nitrato de Prata e a hibridação com a sonda de DNAr 18S evidenciaram a existência de apenas um par portador de regiões organizadoras de nucléolo (RONs) nas espécies em T. diabolus, T. iheringi e T. cf. mimonha, e de dois pares portadores de DNAr 18S em T. zonatus. O DNAr 5S foi observado em posição intersticial do par 6 em T. iheringi, em sintenia com ao DNAr 18S no par dois de T. diabolus, em posição pericentromérica de dois pares submetacêntricos, sendo um deles em sintenia com o DNAr 18S em T. zonatus e em T. cf. mimonha, este DNAr foi localizado nos pares 3, 18 e 25, sendo sintênico ao DNAr 18S no par 18. Apesar dos representantes destas quatro espécies de Trichocycterus apresentarem número diplóide e fórmula cariotípica conservados, observa-se padrões específicos quanto a distribuição da heterocromatina e localização das sequências de DNAr, indicando que eventos de diferenciação cromossômica neste grupo de peixes estejam atuando diretamente sobre estas porções genômicasUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Foresti, Fausto [UNESP]Alves, José Carlos Pansanato [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Oliveira, Maria Lígia Marques de [UNESP]2015-03-23T15:25:42Z2015-03-23T15:25:42Z2011info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisapplication/pdfOLIVEIRA, Maria Lígia Marques de. Mapeamento físico dos genes ribosomais 18S e 5S em peixes do gênero Trichomycterus (Teleostei, Trichomycteridae). 2011. 1 CD-ROM. Trabalho de conclusão de curso (bacharelado - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Botucatu, 2011.http://hdl.handle.net/11449/120299000705839oliveira_mlm_tcc_botib.pdf0804793944846367Alephreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporinfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-10-19T06:07:56Zoai:repositorio.unesp.br:11449/120299Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462024-08-05T15:21:26.689768Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false |
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The present study aimed to cytogenetic analysis and structural and molecular level of four fish species of the genus Trichomycterus: T. diabolus, T. iheringi, T. zonatus and T. cf. mimonha collected in different river basins in Brazil. Techniques were used for classical cytogenetic (Giemsa, Silver nitrate impregnation, C-banding) and molecular with the chromosomal location of genes for 18S and 5S rDNA. All individuals examined had a diploid number 54 chromosomes and karyotype consisting of types of metacentric, submetacentric and subtelocentric. The constitutive heterochromatin identified by C-banding was observed in two small blocks in the karyotype of T. diabolus and large blocks of centromeric several pairs in chromosomal karyotypes of T. iheringi, T. zonatus and T. cf. mimonha. The Silver nitrate impregnation and hybridization with 18S rDNA probe revealed the existence of only a couple carryng nucleolar organizing regions (NORs) on the species T. diabolus, T. iheringi and T. cf mimonha, and two pairs carrying 18S rDNA in T. zonatus. The 5S rDNA was observed in interstitial position 6 of the pair in T. iheringi, the synteny with the two pair in 18S rDNA of T.diabolus in pericentromeric position of and two pairs submetacentric, one being also a case of synteny with the 18S rDNA in T. zonatus and T. cf. mimonha, this rDNA was located in the pairs 3, 18 and 25, and synteny in the 18S rDNA pair 18. Although representatives of these four species Trichomycterus present diploid number and karyotypic formula preserved, three is specific about the distribuition patterns of heterochromatin and location of rDNA sequences, indicating that chromosomal differentiation events in this group of fish are acting directly on these genomic portions |
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