Análises citogenômicas comparativas em Ancistrus (Siluriformes: Loricariidae)

• Autor(a) principal: Santos, Gabriel Esbrisse dos
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/238197
• topic: Bioinformática; DNA satélite; RepeatMasker; Bioinformatics; Satellite DNA

Os genomas dos eucariotos são caracterizados por conter grande quantidade de sequências repetitivas altamente dinâmicas, seja no nível cromossômico ou nucleotídico, com vários mecanismos contribuindo para sua duplicação e expansão, modulando o curso da evolução cariotípica em diversos organismos. Entre essas sequências, os DNAs satélites (DNAsat) estão entre os elementos repetitivos mais dinâmicos, normalmente encontrando-se localizados principalmente em regiões cromossômicas pericentroméricas, cromossomos sexuais e cromossomos B. O gênero Ancistrus Kner, 1854, pertence à família Loricariidae e do ponto de vista citogenético é um grupo muito interessante, pois os seus representantes apresentam uma grande variação cariotípica, sendo encontrados indivíduos com 2n = 34 a 2n = 54 cromossomos, além de sistemas cromossômicos sexuais heteromórficos do tipo ZZ/ZW, XX/XY e sistemas múltiplos, que contribuíram para a diversificação cariotípica do gênero. Em Ancistrus, o conhecimento sobre a organização genômica ainda é limitado e não há dados atualizados e completos acerca de DNAsat, apesar de toda a diversificação e diferenciação cromossômica registrada no gênero. Em um trabalho prévio, de iniciação científica, foram realizadas análises citogenômicas de alto rendimento, juntamente com análises de bioinformática, para a caracterização do satelitoma de Ancistrus sp. Foram encontrados 39 satélites, correspondendo a 11,5% do genoma sequenciado, tendo sido esta a primeira caracterização aprofundada do satelitoma da espécie. Neste trabalho foram analisados os dois satélites mais abundantes do genoma de Ancistrus sp., AnSat1-142 e AnSat2-139, através das plataformas RepeatExplorer2, TAREAN e RepeatMasker, para a constatação da presença e do compartilhamento dessas sequências em outras espécies do gênero, Ancistrus multispinis, Ancistrus ranunculus e Ancistrus cryptophthalmus. Através do RepeatMasker, foram estimadas a abundância e a divergência (Kimura-2-parameter – K2P) destes dois satélites nos genomas das espécies de Ancistrus. As análises comparativas poderão auxiliar no entendimento da organização genômica e das relações filogenéticas entre os diversos táxons, além de contribuir para o esclarecimento dos mecanismos evolutivos de sequências repetitivas em diferentes espécies de peixes.