Estudos de variabilidade genética em lotes cultivados de tambaqui (Colossoma macropomum) na América do Sul

• Autor(a) principal: Gómez Agudelo, John Fredy
• Data de Publicação: 2020
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/192749
• topic: Melhoramento genético; Variabilidade genética; Gargalo genético; Marcadores moleculares

RESUMO John F.G. Agudelo. Estudos de variabilidade genética em lotes cultivados de tambaqui (Colossoma macropomum) na América do Sul. 2020. Dissertação de mestrado – Centro de Aquicultura da Universidade Estadual Paulista, CAUNESP, Jaboticabal, 2020. Atualmente, os estoques de peixes têm sofrido altos níveis de sobreexplotação pela pesca e estão ameaçados de extinção devido às alterações dos habitats naturais. Portanto, a produção de pescado oriunda de uma aquicultura sustentável certamente poderá auxiliar a suprir a demanda de proteína animal. Programas de melhoramento genético podem garantir a maximização do desempenho produtivo nos sistemas de cultivo, pois são capazes de otimizar o rendimento da produção da espécie-alvo. Entretanto, é fundamental que se realize primeiramente estudos de variabilidade genética por meio de marcadores moleculares, de maneira a evitar o gargalo genético e depressão endogâmica. Para esta finalidade, SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) são considerados os marcadores moleculares mais apropriados, uma vez que constituem o polimorfismo mais abundante em qualquer organismo. O tambaqui (Colossoma macropomum) é um dos peixes de maior valor comercial e de potencial para a piscicultura da América do Sul, portanto, uma espécie-alvo para programas de melhoramento genético. O presente trabalho teve como objetivo analisar a variabilidade genética de estoques de tambaqui na América do Sul, utilizando marcadores SNPs obtidos por sequenciamento de nova geração. Inicialmente, foram sequenciados cerca de 350 reprodutores de tambaqui, sendo oriundos de pisciculturas de diferentes localidades: Sul e Norte do Brasil, Colômbia, Peru; e uma população selvagem (rio Amazonas) e a população base do núcleo de melhoramento do CAUNESP (Jaboticabal, SP). A estratégia de sequenciamento/genotipagem dos SNPs foi por meio da técnica ddRAD-seq (Double-digest RAD-sequencing). Após os filtros de qualidade, foram selecionados cerca de 1.440 SNPs de 220 amostras de tambaqui para os estudos de genômica populacional. Os valores de Ho variaram de 0.081 a 0.248; enquanto de He foram de 0.206 a 0.270. Os resultados da análise hierárquica de variância molecular (AMOVA) mostraram que a maior proporção da variância esteve presente dentro das populações (75.2%). Uma baixa diferenciação genética entre todas as populações foi detectada por análises de Fst global sobre os loci de SNPs (Fst = 0,05). A análise de estruturação genética identificou dois agrupamentos genéticos nas populações comerciais de tambaqui da América do Sul. Estudos genéticos enfocando um maior conhecimento do genoma dos estoques cultivados de tambaqui são considerados essenciais para aquicultura, principalmente no sentido de fornecer subsídios para o desenvolvimento de programas de manejo e melhoramento desta espécie.