Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Braz, M.a. [UNESP]
Data de Publicação: 2014
Outros Autores: Silva, D.c. [UNESP], Santiago, M.e.b. [UNESP], Garcia, S.d. [UNESP], Nakamura, A.a. [UNESP], Meireles, Marcelo Vasconcelos [UNESP]
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S0102-09352014000100023
http://hdl.handle.net/11449/109518
Resumo: Chlamydophila psittaci is a bacterium that causes respiratory or systemic disease in birds and humans. Owing to the risk of transmission from asymptomatic birds to humans, the objective of this study was to detect the presence of Chlamydophila spp. in asymptomatic birds. Four hundred and three fecal samples or cloacal swabs were collected from domestic, wild or exotic birds. The 403 samples were examined by real time PCR specific for the 16S subunit of rRNA gene using SsoFastEvaGreen®SupermixTM (Bio-Rad) and melting curve analysis. Hemi-nested PCR specific for the OMP-A gene, accomplished in real-time PCR positive samples, was followed by sequencing of the amplified fragments to determine the genotype of C. psittaci. Real-time PCR was positive in 17 (4.21%) samples. Hemi-nested PCR revealed positivity in two samples previously positive by real-time PCR. Sequencing of the fragment amplified by hemi-nested PCR allowed for the identification of genotype A of C. psittaci in one sample. The results of this experiment show that the real-time PCR targeting the 16S rRNA gene followed by melting curve analysis can be used for diagnosis of Chlamydophila sp. in fecal samples of asymptomatic birds. The classification of the Chlamydophila species and the genotype of C. psittaci must be accomplished by PCR targeting the ompA gene and sequencing of the amplified fragments.
id UNSP_bba93dc842a19eb7431684dcac7e5a0e
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/109518
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticasDetection and molecular characterization of Chlamydophila psittaci in asymptomatic birdsavespsitacosediagnóstico molecularzoonosesbirdspsittacosismolecular diagnosticzoonosesChlamydophila psittaci is a bacterium that causes respiratory or systemic disease in birds and humans. Owing to the risk of transmission from asymptomatic birds to humans, the objective of this study was to detect the presence of Chlamydophila spp. in asymptomatic birds. Four hundred and three fecal samples or cloacal swabs were collected from domestic, wild or exotic birds. The 403 samples were examined by real time PCR specific for the 16S subunit of rRNA gene using SsoFastEvaGreen®SupermixTM (Bio-Rad) and melting curve analysis. Hemi-nested PCR specific for the OMP-A gene, accomplished in real-time PCR positive samples, was followed by sequencing of the amplified fragments to determine the genotype of C. psittaci. Real-time PCR was positive in 17 (4.21%) samples. Hemi-nested PCR revealed positivity in two samples previously positive by real-time PCR. Sequencing of the fragment amplified by hemi-nested PCR allowed for the identification of genotype A of C. psittaci in one sample. The results of this experiment show that the real-time PCR targeting the 16S rRNA gene followed by melting curve analysis can be used for diagnosis of Chlamydophila sp. in fecal samples of asymptomatic birds. The classification of the Chlamydophila species and the genotype of C. psittaci must be accomplished by PCR targeting the ompA gene and sequencing of the amplified fragments.Chlamydophila psittaci é uma bactéria que causa doença respiratória ou sistêmica em aves e em seres humanos. Em vista do risco de transmissão para humanos, o objetivo deste estudo foi detectar a presença de Chlamydophila spp. em amostras de fezes ou suabes cloacais de aves assintomáticas. Foram colhidas 403 amostras fecais ou suabes cloacais, provenientes de aves domésticas, selvagens ou exóticas. As amostras foram submetidas à PCR em tempo real para C. psittaci, para amplificação de fragmento parcial do gene da subunidade 16S do rRNA, utilizando o SsoFastTM EvaGreen® Supermix (Bio-Rad) e análise da curva de dissociação. Para determinação do genótipo de C. psittaci, foi usada a hemi-nested PCR visando à amplificação de fragmento parcial do gene OMP-A, realizada nas amostras positivas pela PCR em tempo real, seguida de sequenciamento dos fragmentos amplificados. A PCR em tempo real revelou positividade em 17 (4,21%) amostras. A hemi-nested foi positiva em 2 amostras positivas pela PCR em tempo real. O genótipo A de C. psittaci foi identificado pelo sequenciamento de uma amostra amplificada pela hemi-nested PCR. Os resultados deste experimento demonstram que a PCR em tempo real, visando à amplificação de fragmento parcial da subunidade 16S do rRNA, seguida da análise da curva de dissociação, pode ser utilizada para detecção de DNA de Chlamydophila sp. em amostras fecais de aves assintomáticas. A classificação da espécie de Chlamydophila e do genótipo de C. psittaci deve ser realizada por meio de PCR tendo como alvo o gene ompA e sequenciamento dos fragmentos amplificados.Universidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina VeterináriaUniversidade Estadual Paulista Faculdade de Medicina VeterináriaUniversidade Federal de Minas Gerais (UFMG), Escola de VeterináriaUniversidade Estadual Paulista (Unesp)Braz, M.a. [UNESP]Silva, D.c. [UNESP]Santiago, M.e.b. [UNESP]Garcia, S.d. [UNESP]Nakamura, A.a. [UNESP]Meireles, Marcelo Vasconcelos [UNESP]2014-09-30T18:18:25Z2014-09-30T18:18:25Z2014-02-01info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/article161-167application/pdfhttp://dx.doi.org/10.1590/S0102-09352014000100023Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia. Universidade Federal de Minas Gerais, Escola de Veterinária, v. 66, n. 1, p. 161-167, 2014.0102-0935http://hdl.handle.net/11449/10951810.1590/S0102-09352014000100023S0102-09352014000100023WOS:000333208100023S0102-09352014000100023.pdf231704652558577709035138976152740000-0003-0063-5172SciELOreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESPporArquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia0.2860,248info:eu-repo/semantics/openAccess2024-09-04T18:03:44Zoai:repositorio.unesp.br:11449/109518Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462024-09-04T18:03:44Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas
Detection and molecular characterization of Chlamydophila psittaci in asymptomatic birds
title Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas
spellingShingle Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas
Braz, M.a. [UNESP]
aves
psitacose
diagnóstico molecular
zoonoses
birds
psittacosis
molecular diagnostic
zoonoses
title_short Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas
title_full Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas
title_fullStr Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas
title_full_unstemmed Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas
title_sort Detecção e classificação molecular de Chlamydophila psittaci em amostras fecais de aves assintomáticas
author Braz, M.a. [UNESP]
author_facet Braz, M.a. [UNESP]
Silva, D.c. [UNESP]
Santiago, M.e.b. [UNESP]
Garcia, S.d. [UNESP]
Nakamura, A.a. [UNESP]
Meireles, Marcelo Vasconcelos [UNESP]
author_role author
author2 Silva, D.c. [UNESP]
Santiago, M.e.b. [UNESP]
Garcia, S.d. [UNESP]
Nakamura, A.a. [UNESP]
Meireles, Marcelo Vasconcelos [UNESP]
author2_role author
author
author
author
author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Braz, M.a. [UNESP]
Silva, D.c. [UNESP]
Santiago, M.e.b. [UNESP]
Garcia, S.d. [UNESP]
Nakamura, A.a. [UNESP]
Meireles, Marcelo Vasconcelos [UNESP]
dc.subject.por.fl_str_mv aves
psitacose
diagnóstico molecular
zoonoses
birds
psittacosis
molecular diagnostic
zoonoses
topic aves
psitacose
diagnóstico molecular
zoonoses
birds
psittacosis
molecular diagnostic
zoonoses
description Chlamydophila psittaci is a bacterium that causes respiratory or systemic disease in birds and humans. Owing to the risk of transmission from asymptomatic birds to humans, the objective of this study was to detect the presence of Chlamydophila spp. in asymptomatic birds. Four hundred and three fecal samples or cloacal swabs were collected from domestic, wild or exotic birds. The 403 samples were examined by real time PCR specific for the 16S subunit of rRNA gene using SsoFastEvaGreen®SupermixTM (Bio-Rad) and melting curve analysis. Hemi-nested PCR specific for the OMP-A gene, accomplished in real-time PCR positive samples, was followed by sequencing of the amplified fragments to determine the genotype of C. psittaci. Real-time PCR was positive in 17 (4.21%) samples. Hemi-nested PCR revealed positivity in two samples previously positive by real-time PCR. Sequencing of the fragment amplified by hemi-nested PCR allowed for the identification of genotype A of C. psittaci in one sample. The results of this experiment show that the real-time PCR targeting the 16S rRNA gene followed by melting curve analysis can be used for diagnosis of Chlamydophila sp. in fecal samples of asymptomatic birds. The classification of the Chlamydophila species and the genotype of C. psittaci must be accomplished by PCR targeting the ompA gene and sequencing of the amplified fragments.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-09-30T18:18:25Z
2014-09-30T18:18:25Z
2014-02-01
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://dx.doi.org/10.1590/S0102-09352014000100023
Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia. Universidade Federal de Minas Gerais, Escola de Veterinária, v. 66, n. 1, p. 161-167, 2014.
0102-0935
http://hdl.handle.net/11449/109518
10.1590/S0102-09352014000100023
S0102-09352014000100023
WOS:000333208100023
S0102-09352014000100023.pdf
2317046525585777
0903513897615274
0000-0003-0063-5172
url http://dx.doi.org/10.1590/S0102-09352014000100023
http://hdl.handle.net/11449/109518
identifier_str_mv Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia. Universidade Federal de Minas Gerais, Escola de Veterinária, v. 66, n. 1, p. 161-167, 2014.
0102-0935
10.1590/S0102-09352014000100023
S0102-09352014000100023
WOS:000333208100023
S0102-09352014000100023.pdf
2317046525585777
0903513897615274
0000-0003-0063-5172
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia
0.286
0,248
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 161-167
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), Escola de Veterinária
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG), Escola de Veterinária
dc.source.none.fl_str_mv SciELO
reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1810021377164443648