Resistência in vitro aos antimicrobianos e microbiota bucal e de leito ungueal de gatos diagnosticadas por sequenciamento genético em larga escala e espectrometria de massas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Portilho, Fábio Vinícius Ramos
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: https://hdl.handle.net/11449/251650
Resumo: The close contact between cats and humans increases the risk of transmission of pathogens through bites and scratches, due to the complexity of microorganisms in feline oral and nail microbiota. The present study investigated the microorganisms of bacterial and fungal origin in the oral cavity and claws of 100 apparently healthy cats using conventional and selective microbiological culture approaches, next-generation sequencing (NGS), and mass spectrometry (MALDI-TOF MS), as well as the in vitro susceptibility pattern of bacterial isolates to antimicrobials. In total, 671 bacteria and 33 yeasts were identified by MALDI-TOF MS. Neisseria animaloris (37/343=10.8%), Staphylococcus felis (29/343=8.5%), and Pasteurella multocida (24/343=7%) were the most prevalent bacteria in oral cavity samples (n=343), while the main yeast (n=19) was Candida albicans (13/19=68.4%). Staphylococcus pettenkoferi (44/328=13.4%), Staphylococcus felis (21/328=6.4%), and Staphylococcus simulans (19/328=5.8%) were the most frequent bacteria identified in claws samples (n=328), while Rhodotorula mucilaginosa (8/14=57.2%) was the most common yeast (n=14). NGS predominantly identified the genera Moraxella, Neisseria, Pasteurella, and Fusobacterium in oral cavity samples, and enterobacteria and staphylococci in nail bed samples, in addition to the less frequent identification of the genera Capnocytophaga and Bartonella, which have been identified in human infections. Levofloxacin, marbofloxacin, and amoxicillin/clavulanic acid were the most effective drugs against the main groups of bacteria identified. Multidrug resistance was observed in 17% (114/671) bacterial isolates, in addition to three staphylococci carrying the methicillin resistance gene (mecA). We highlight a high complexity of microorganisms in oral/claws microbiota of cats, the zoonotic risks of aggression caused by bites and scratches from domestic cats, as well as the high resistance of the isolates to conventional antimicrobials.
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spelling Resistência in vitro aos antimicrobianos e microbiota bucal e de leito ungueal de gatos diagnosticadas por sequenciamento genético em larga escala e espectrometria de massasIn vitro antimicrobial resistance and oral/nail bed microbiota of cats diagnosed by next-generation sequencing and mass spectrometry16S rRNARegião subunguealCavidade oralMALDI-TOF MSMecAMicrobiomaThe close contact between cats and humans increases the risk of transmission of pathogens through bites and scratches, due to the complexity of microorganisms in feline oral and nail microbiota. The present study investigated the microorganisms of bacterial and fungal origin in the oral cavity and claws of 100 apparently healthy cats using conventional and selective microbiological culture approaches, next-generation sequencing (NGS), and mass spectrometry (MALDI-TOF MS), as well as the in vitro susceptibility pattern of bacterial isolates to antimicrobials. In total, 671 bacteria and 33 yeasts were identified by MALDI-TOF MS. Neisseria animaloris (37/343=10.8%), Staphylococcus felis (29/343=8.5%), and Pasteurella multocida (24/343=7%) were the most prevalent bacteria in oral cavity samples (n=343), while the main yeast (n=19) was Candida albicans (13/19=68.4%). Staphylococcus pettenkoferi (44/328=13.4%), Staphylococcus felis (21/328=6.4%), and Staphylococcus simulans (19/328=5.8%) were the most frequent bacteria identified in claws samples (n=328), while Rhodotorula mucilaginosa (8/14=57.2%) was the most common yeast (n=14). NGS predominantly identified the genera Moraxella, Neisseria, Pasteurella, and Fusobacterium in oral cavity samples, and enterobacteria and staphylococci in nail bed samples, in addition to the less frequent identification of the genera Capnocytophaga and Bartonella, which have been identified in human infections. Levofloxacin, marbofloxacin, and amoxicillin/clavulanic acid were the most effective drugs against the main groups of bacteria identified. Multidrug resistance was observed in 17% (114/671) bacterial isolates, in addition to three staphylococci carrying the methicillin resistance gene (mecA). We highlight a high complexity of microorganisms in oral/claws microbiota of cats, the zoonotic risks of aggression caused by bites and scratches from domestic cats, as well as the high resistance of the isolates to conventional antimicrobials.O estreitamento do contato entre gatos e humanos aumenta o risco de transmissão de patógenos, incluindo por mordeduras e arranhaduras, devido à complexidade de micro-organismos presentes nas microbiotas orais e ungueais dos felinos. Neste contexto, o presente estudo investigou micro-organismos de origem bacteriana e fúngica na cavidade oral e leito ungueal de 100 gatos aparentemente hígidos utilizando técnicas convencionais e seletivas de cultivo microbiológico, sequenciamento genético em larga escala (NGS) e espectrometria de massas (MALDI-TOF MS), bem como avaliou o perfil de sensibilidade/resistência in vitro dos isolados bacterianos aos antimicrobianos. No total, 671 bactérias e 33 leveduras foram identificadas por MALDI-TOF MS. As bactérias mais frequentes na cavidade oral (n=343) foram Neisseria animaloris (37/343=10,8%), Staphylococcus felis (29/343=8,5%) e Pasteurella multocida (24/343=7%), enquanto a principal levedura (n=19) foi Candida albicans (13/19=68,4%). No leito ungueal (n=328), predominaram Staphylococcus pettenkoferi (44/328=13,4%), Staphylococcus felis (21/328=6,4%) e Staphylococcus simulans (19/328=5,8%), enquanto Rhodotorula mucilaginosa (8/14=57,2%) foi a levedura mais frequente (n=14). O NGS identificou predominantemente os gêneros Moraxella, Neisseria, Pasteurella e Fusobacterium nas amostras de cavidade oral, e enterobactérias e estafilococos nas amostras de leito ungueal, além da identificação em menor frequência de espécies dos gêneros Capnocytophaga e Bartonella, relacionadas a infecções em humanos. Levofloxacino, marbofloxacino e amoxicilina/ácido clavulânico foram os fármacos mais eficazes para os principais grupos de bactérias identificados. A multirresistência aos antimicrobianos foi observada em 17% (114/671) dos isolados, além de três estafilococos carreadores do gene de resistência à meticilina (mecA). Infere-se a elevada complexidade de micro-organismos nas microbiotas bucal e ungueal, o potencial zoonótico das agressões por mordeduras e arranhaduras dos felinos domésticos e a elevada resistência dos isolados aos antimicrobianos convencionais.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 20/09162-7CAPES: 001Universidade Estadual Paulista (Unesp)Ribeiro, Márcio Garcia [UNESP]Portilho, Fábio Vinícius Ramos2023-12-04T17:12:06Z2023-12-04T17:12:06Z2023-11-22info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfPortilho, F.V.R. Resistência in vitro aos antimicrobianos e microbiota bucal e de leito ungueal de gatos diagnosticadas por sequenciamento genético em larga escala e espectrometria de massas. Tese de Doutorado. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Unesp, Botucatu, 2023.https://hdl.handle.net/11449/251650porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2023-12-21T06:18:44Zoai:repositorio.unesp.br:11449/251650Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestopendoar:29462023-12-21T06:18:44Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
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