Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Fabri, Fábio Henrique Hingst
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11449/237260
Resumo: O objetivo principal foi avaliar a acurácia de abordagens de cultivo de leite para detectar infecções intramamárias (IIM) na secagem. Uma amostra de 184 vacas de 28 fazendas foi utilizada para tanto. As fazendas foram visitadas em três dias consecutivos antes da secagem (D-2, D-1 e D0) para coleta de amostras de leite para cultivo microbiológico. Amostras compostas foram preparadas em laboratório. A sensibilidade (SE), especificidade (ES) e valores preditivos positivo (VPP) e negativo (VPN) foram estimados para: 1) uma amostra dos quartos coletada em D-2, D-1 ou D0, em relação ao padrão ouro em nível de quarto (isolamento do mesmo patógeno em ≥ 2 das três amostras consecutivas); 2) uma amostra composta, em relação ao padrão-ouro em nível de vaca (≥ 1 quarto infectado por vaca). A prevalência de IIM na secagem foi de 47,36 (quartos) e 60,44% (compostas). Considerando todos os patógenos, a SE das amostras de quarto variou entre 93,62-95,35%. A ES variou entre 86,91-91,24%. A acurácia variou entre os patógenos. A SE para detectar Streptococcus agalactiae e outros cocos catalase-negativos foi alta (> 92,11%), enquanto para detectar Staphylococcus aureus a SE variou entre 88,24-94,44%. Em geral, a ES e o VPN foram elevados. Para amostras compostas, houve perda de acurácia. A SE variou de 50,00% (Corynebacterium bovis) a 76,32% (S. aureus). Amostras de leite (quarto ou compostas) colhidas no D-2 podem ser adequadas para detectar IIM na secagem, mas diferenças na acurácia entre os patógenos devem ser consideradas ao tomar decisões no tratamento da vaca seca.
id UNSP_d66d14d121d09490c305953394fb362b
oai_identifier_str oai:repositorio.unesp.br:11449/237260
network_acronym_str UNSP
network_name_str Repositório Institucional da UNESP
repository_id_str 2946
spelling Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteirasDiagnostic accuracy of different milk sampling strategies for detection of intramammary infections at drying-off of dairy cowsMastiteVaca-secaBovinocultura leiteiraAcurácia diagnósticaCultura microbiológicaO objetivo principal foi avaliar a acurácia de abordagens de cultivo de leite para detectar infecções intramamárias (IIM) na secagem. Uma amostra de 184 vacas de 28 fazendas foi utilizada para tanto. As fazendas foram visitadas em três dias consecutivos antes da secagem (D-2, D-1 e D0) para coleta de amostras de leite para cultivo microbiológico. Amostras compostas foram preparadas em laboratório. A sensibilidade (SE), especificidade (ES) e valores preditivos positivo (VPP) e negativo (VPN) foram estimados para: 1) uma amostra dos quartos coletada em D-2, D-1 ou D0, em relação ao padrão ouro em nível de quarto (isolamento do mesmo patógeno em ≥ 2 das três amostras consecutivas); 2) uma amostra composta, em relação ao padrão-ouro em nível de vaca (≥ 1 quarto infectado por vaca). A prevalência de IIM na secagem foi de 47,36 (quartos) e 60,44% (compostas). Considerando todos os patógenos, a SE das amostras de quarto variou entre 93,62-95,35%. A ES variou entre 86,91-91,24%. A acurácia variou entre os patógenos. A SE para detectar Streptococcus agalactiae e outros cocos catalase-negativos foi alta (> 92,11%), enquanto para detectar Staphylococcus aureus a SE variou entre 88,24-94,44%. Em geral, a ES e o VPN foram elevados. Para amostras compostas, houve perda de acurácia. A SE variou de 50,00% (Corynebacterium bovis) a 76,32% (S. aureus). Amostras de leite (quarto ou compostas) colhidas no D-2 podem ser adequadas para detectar IIM na secagem, mas diferenças na acurácia entre os patógenos devem ser consideradas ao tomar decisões no tratamento da vaca seca.The main objective was to evaluate the accuracy of milk culture approaches to detect intramammary infections (IMI) at drying-off. A sample of 184 cows from 28 farms was used for this purpose. Farms were visited on three consecutive days before drying-off (D-2, D-1 and D0) to collect milk samples for microbiological culture. Composite samples were prepared in the laboratory. Sensitivity (SE), specificity (SP), and positive (PPV) and negative (NPV) predictive values were estimated for: 1) one quarter sample collected on D-2, D-1 or D0, relative to the gold standard in quarter-level (isolation of the same pathogen in ≥ 2 of the three consecutive samples); 2) one composite sample, relative to the gold standard at the cow-level (≥ 1 infected quarter per cow). The prevalence of IMI in drying-off was 47.36 (quarters) and 60.44% (composites). Considering all pathogens, the SE of the quarter samples varied between 93.62-95.35%. The SP ranged between 86.91-91.24%. The accuracy varied among the pathogens. The SE for detecting Streptococcus agalactiae and other catalase-negative cocci was high (> 92.11%), while for detecting Staphylococcus aureus the SE ranged between 88.24-94.44%. In general, SP and NPV were high. For composite samples, there was a loss of accuracy. The SE ranged from 50.00% (Corynebacterium bovis) to 76.32% (S. aureus). Milk samples (quarter or composite) collected at D-2 may be adequate to detect IMI at drying-off, but differences in accuracy between pathogens must be considered when making decisions on dry cow treatment.Universidade Estadual Paulista (Unesp)Pantoja, José Carlos de Figueiredo [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Fabri, Fábio Henrique Hingst2022-10-27T19:27:05Z2022-10-27T19:27:05Z2022-09-06info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11449/23726033004064022P3porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNESPinstname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)instacron:UNESP2024-09-09T17:38:54Zoai:repositorio.unesp.br:11449/237260Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.unesp.br/oai/requestrepositoriounesp@unesp.bropendoar:29462024-09-09T17:38:54Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras
Diagnostic accuracy of different milk sampling strategies for detection of intramammary infections at drying-off of dairy cows
title Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras
spellingShingle Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras
Fabri, Fábio Henrique Hingst
Mastite
Vaca-seca
Bovinocultura leiteira
Acurácia diagnóstica
Cultura microbiológica
title_short Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras
title_full Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras
title_fullStr Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras
title_full_unstemmed Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras
title_sort Acurácia diagnóstica de diferentes estratégias de amostragem de leite para detecção de infecções intramamárias na secagem de vacas leiteiras
author Fabri, Fábio Henrique Hingst
author_facet Fabri, Fábio Henrique Hingst
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Pantoja, José Carlos de Figueiredo [UNESP]
Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.contributor.author.fl_str_mv Fabri, Fábio Henrique Hingst
dc.subject.por.fl_str_mv Mastite
Vaca-seca
Bovinocultura leiteira
Acurácia diagnóstica
Cultura microbiológica
topic Mastite
Vaca-seca
Bovinocultura leiteira
Acurácia diagnóstica
Cultura microbiológica
description O objetivo principal foi avaliar a acurácia de abordagens de cultivo de leite para detectar infecções intramamárias (IIM) na secagem. Uma amostra de 184 vacas de 28 fazendas foi utilizada para tanto. As fazendas foram visitadas em três dias consecutivos antes da secagem (D-2, D-1 e D0) para coleta de amostras de leite para cultivo microbiológico. Amostras compostas foram preparadas em laboratório. A sensibilidade (SE), especificidade (ES) e valores preditivos positivo (VPP) e negativo (VPN) foram estimados para: 1) uma amostra dos quartos coletada em D-2, D-1 ou D0, em relação ao padrão ouro em nível de quarto (isolamento do mesmo patógeno em ≥ 2 das três amostras consecutivas); 2) uma amostra composta, em relação ao padrão-ouro em nível de vaca (≥ 1 quarto infectado por vaca). A prevalência de IIM na secagem foi de 47,36 (quartos) e 60,44% (compostas). Considerando todos os patógenos, a SE das amostras de quarto variou entre 93,62-95,35%. A ES variou entre 86,91-91,24%. A acurácia variou entre os patógenos. A SE para detectar Streptococcus agalactiae e outros cocos catalase-negativos foi alta (> 92,11%), enquanto para detectar Staphylococcus aureus a SE variou entre 88,24-94,44%. Em geral, a ES e o VPN foram elevados. Para amostras compostas, houve perda de acurácia. A SE variou de 50,00% (Corynebacterium bovis) a 76,32% (S. aureus). Amostras de leite (quarto ou compostas) colhidas no D-2 podem ser adequadas para detectar IIM na secagem, mas diferenças na acurácia entre os patógenos devem ser consideradas ao tomar decisões no tratamento da vaca seca.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-10-27T19:27:05Z
2022-10-27T19:27:05Z
2022-09-06
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11449/237260
33004064022P3
url http://hdl.handle.net/11449/237260
identifier_str_mv 33004064022P3
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Estadual Paulista (Unesp)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNESP
instname:Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron:UNESP
instname_str Universidade Estadual Paulista (UNESP)
instacron_str UNESP
institution UNESP
reponame_str Repositório Institucional da UNESP
collection Repositório Institucional da UNESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNESP - Universidade Estadual Paulista (UNESP)
repository.mail.fl_str_mv repositoriounesp@unesp.br
_version_ 1810021327257468928