Molecular characterization of bacterial populations of different soils

• Autor(a) principal: Pereira, Rodrigo Matheus [UNESP]
• Data de Publicação: 2006
• Outros Autores: Silveira, Érico Leandro da [UNESP], Scaquitto, Denilson César [UNESP], Pedrinho, Eliamar Aparecida Nascimbém [UNESP], Val-Moraes, Silvana Pompéia [UNESP], Wickert, Ester [UNESP], Carareto-Alves, Lúcia Maria [UNESP], Lemos, Eliana Gertrudes de Macedo [UNESP]
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: eng
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNESP
• Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/S1517-83822006000400007; http://hdl.handle.net/11449/4098
• topic: Metagenome; microbial diversity; 16S rRNA; Metagenôma; diversidade microbiana; rRNA 16S

Até o momento poucos estudos foram realizados no Brasil a respeito da diversidade de comunidades bacterianas no solo. Com o objetivo de caracterizar as populações bacterianas presentes no solo através da análise do gene 16S rRNA, foram analisados dois solos: um caracterizado pelo uso intensivo, principalmente para a produção de tomate, feijão e milho (CS); e outro sob floresta (FS), não modificado pelo homem, ambos do município de Guaíra, no estado de São Paulo, Brasil. Usando oligonucleotídeos específicos, de genes 16S rRNA do DNA metagenomico de ambos os solos foram amplificados por PCR, amplicons foram clonados e 139 clones de duas bibliotecas foram seqüenciados. O uso da técnica de 16S rRNA, gerou a identificação de diferentes populações de bactérias de solo pertencentes aos filos Acidobacteria Actinobacteria Bacteroidetes Firmicutes Proteobacteria Verrucomicrobia, Archaea, além das não classificadas. Diferenças entre as bibliotecas FS e CS foram observadas no tamanho dos filos. Um grande número de filos e, consequentemente, uma grande diversidade bacteriana foi observada no solo sob floresta. Estes dados foram confirmados pela análise de diversidade genética realizada. A caracterização de comunidades do solo apresentada neste trabalho contribuiu fornecendo dados para estudos posteriores sobre a dinâmica das populações bacterianas em solos de diferentes condições no Brasil.