Estudo da diversidade e das relações filogenéticas do gênero Astyanax (Characiformes. Characidae) baseado em sequências de DNA
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNESP |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11449/140217 http://www.athena.biblioteca.unesp.br/exlibris/bd/cathedra/16-06-2016/000866307.pdf |
Resumo: | The Characidae family is the most species rich between the order Characiformes. One such species rich genera, with many taxonomic conflicts is Astyanax, which comprises currently 142 species, of which 52 were described in the last ten years. In this study we present an extensive geographic sampling of the genus Astyanax with specimens from South and Central America, covering almost the entire distribution of the genus. In this context, the genus was examined by two approaches, one about the diversity of species and another focusing on the phylogenetic relationships of the group. The diversity study was based on barcode sequences, of which the 5' portion of Cytochrome Oxidase subunit I gene, proposed as standard tool to separate species at the molecular level, thus helping the taxonomic studies and the discovery of new species. The use of different approaches to clustering sequences (ABGD, GMYC and BIN analysis) show a consistency of results obtained with the initial cutoff value of 2%, but GMYC tends to identify a larger number of groups than other analyzes. The results point to the existence of four major groups in the genus, comprising 122 species groups, but in many cases, several species are grouped into a single cluster, making identification by DNA barcode virtually impossible. For the phylogeny analysis of the genus based on multilocus molecular, data shows that Astyanax is polyphyletic and at least four lineages, which are formed by the species complexes A. scabripinnis and A. fasciatus, other by complex A. bimaculatus, a lineage with specimens from Central America and other with species from coastal regions of South America. In addition, some species of Astyanax are related with genera such as Moenkhausia and Jupiaba, known to be morpholgical similar. All Astyanax are present in Clade C, with only exception of A. festae, who was in Clade A, and then we propose its review. Final data from this study point to a very complex ... |
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Estudo da diversidade e das relações filogenéticas do gênero Astyanax (Characiformes. Characidae) baseado em sequências de DNAPeixe - Distribuição geograficaPeixe - IdentificaçãoAstyanax (Peixe)FilogeniaAnálise de DNAAstyanaxFishesThe Characidae family is the most species rich between the order Characiformes. One such species rich genera, with many taxonomic conflicts is Astyanax, which comprises currently 142 species, of which 52 were described in the last ten years. In this study we present an extensive geographic sampling of the genus Astyanax with specimens from South and Central America, covering almost the entire distribution of the genus. In this context, the genus was examined by two approaches, one about the diversity of species and another focusing on the phylogenetic relationships of the group. The diversity study was based on barcode sequences, of which the 5' portion of Cytochrome Oxidase subunit I gene, proposed as standard tool to separate species at the molecular level, thus helping the taxonomic studies and the discovery of new species. The use of different approaches to clustering sequences (ABGD, GMYC and BIN analysis) show a consistency of results obtained with the initial cutoff value of 2%, but GMYC tends to identify a larger number of groups than other analyzes. The results point to the existence of four major groups in the genus, comprising 122 species groups, but in many cases, several species are grouped into a single cluster, making identification by DNA barcode virtually impossible. For the phylogeny analysis of the genus based on multilocus molecular, data shows that Astyanax is polyphyletic and at least four lineages, which are formed by the species complexes A. scabripinnis and A. fasciatus, other by complex A. bimaculatus, a lineage with specimens from Central America and other with species from coastal regions of South America. In addition, some species of Astyanax are related with genera such as Moenkhausia and Jupiaba, known to be morpholgical similar. All Astyanax are present in Clade C, with only exception of A. festae, who was in Clade A, and then we propose its review. Final data from this study point to a very complex ...A família Characidae é a mais especiosa entre os peixes da ordem Characiformes. Um desses especiosos gêneros, com muitos conflitos taxonômicos é Astyanax, o qual é composto por, atualmente, 142 espécies, das quais 52 foram descritas nos últimos dez anos. Nesse estudo apresentamos um extenso trabalho de amostragem geográfica do gênero Astyanax, com exemplares provenientes da América do Sul e Central, cobrindo em sua maioria a distribuição do gênero. Neste contexto foram analisados espécimes do gênero em duas abordagens, uma acerca da diversidade de espécies e outra com foco nas relações filogenéticas do grupo. O estudo de diversidade foi baseado em sequencias barcode, do qual a porção 5' do gene Citocromo Oxidase subunidade I, proposta como capaz de separar espécies em nível molecular, auxiliando assim os estudos taxonômicos e a descoberta de novas espécies. O uso de diferentes abordagens para a clusterização de sequências (análises ABGD, GMYC e BIN) mostram uma consistência dos resultados obtidos com o valor inicial de corte de 2%, mas GMYC tende a identificar um número maior de grupos do que as demais análises. Os resultados apontam para a existência de quatro grandes grupos no gênero, totalizando 122 grupos de espécies, mas, em muitos casos, diversas espécies estão agrupadas em único cluster, tornando a identificação por DNA barcode praticamente impossível. Para a filogenia do gênero a análise baseada em dados moleculares multilocus apontam que Astyanax é polifilético e com pelo menos quatro linhagens, as quais são formadas pelos complexos de espécies A. scabripinnis e A. fasciatus, outro pelo complexo A. bimaculatus, uma linhagem com os exemplares da América Central e outra com espécies de regiões costeiras do leste do Brasil. Além disso, algumas espécies de Astyanax estão relacionadas com gêneros como Moenkhausia e Jupiaba, conhecidamente similares ao gênero em estudo. Todos os Astyanax...Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)FAPESP: 11/00264-2Universidade Estadual Paulista (Unesp)Oliveira, Claudio de [UNESP]Universidade Estadual Paulista (Unesp)Rossini, Bruno César [UNESP]2016-07-01T13:10:21Z2016-07-01T13:10:21Z2015-02-24info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis117 f.application/pdfROSSINI, Bruno César. Estudo da diversidade e das relações filogenéticas do gênero Astyanax (Characiformes. Characidae) baseado em sequências de DNA. 2015. 117 f. 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The Characidae family is the most species rich between the order Characiformes. One such species rich genera, with many taxonomic conflicts is Astyanax, which comprises currently 142 species, of which 52 were described in the last ten years. In this study we present an extensive geographic sampling of the genus Astyanax with specimens from South and Central America, covering almost the entire distribution of the genus. In this context, the genus was examined by two approaches, one about the diversity of species and another focusing on the phylogenetic relationships of the group. The diversity study was based on barcode sequences, of which the 5' portion of Cytochrome Oxidase subunit I gene, proposed as standard tool to separate species at the molecular level, thus helping the taxonomic studies and the discovery of new species. The use of different approaches to clustering sequences (ABGD, GMYC and BIN analysis) show a consistency of results obtained with the initial cutoff value of 2%, but GMYC tends to identify a larger number of groups than other analyzes. The results point to the existence of four major groups in the genus, comprising 122 species groups, but in many cases, several species are grouped into a single cluster, making identification by DNA barcode virtually impossible. For the phylogeny analysis of the genus based on multilocus molecular, data shows that Astyanax is polyphyletic and at least four lineages, which are formed by the species complexes A. scabripinnis and A. fasciatus, other by complex A. bimaculatus, a lineage with specimens from Central America and other with species from coastal regions of South America. In addition, some species of Astyanax are related with genera such as Moenkhausia and Jupiaba, known to be morpholgical similar. All Astyanax are present in Clade C, with only exception of A. festae, who was in Clade A, and then we propose its review. Final data from this study point to a very complex ... |
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