InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2020 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca de teses e dissertações da Universidade de Passo Fundo (BDTD UPF) |
Texto Completo: | http://tede.upf.br:8080/jspui/handle/tede/1956 |
Resumo: | The manual task of counting and identifying small insects, such as aphids and parasitoids, captured in color-type field traps is exhausting, time-consuming, and non-scalable. This activity involves the separation of the elements of interest and requires the use of magnifiers or microscopes. Recent advances in artificial intelligence, image processing, and high-performance computing have enabled the development of efficient computer vision solutions to monitor pests and identify diseases in plants. With this in mind, this work presents InsectCV, a system for the automatic counting and identification of insects in images generated by the scanning of samples captured in traps. For the development of this solution, we used a 209 grayscale images dataset containing 17,908 labeled insects, a convolutional neural network Mask R-CNN to generate the model, and the development of three web services. During the training of the model, we applied the transfer learning technique and the data augmentation. We defined two new parameters to adjust the false-positive ratio by class. We used images of insects obtained from traps exposed in Coxilha and Passo Fundo, RS, Brazil in 2019 and 2020 wheat crops. In comparison to the manual counting, we verified coefficients determination close to 1 (R2 = 0:87 for aphids and R2 = 0:92 for parasitoids), proving the ability of the model to identify the fluctuation of population levels for these insects. Therefore, InsectCV can be used to detect action thresholds in alert systems for integrated pest management. |
id |
UPF-1_6393239f9785ee575ea3fc86d46bb66a |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:tede.upf.br:tede/1956 |
network_acronym_str |
UPF-1 |
network_name_str |
Biblioteca de teses e dissertações da Universidade de Passo Fundo (BDTD UPF) |
repository_id_str |
|
spelling |
Rieder, Rafael95320598068http://lattes.cnpq.br/301049709437749700001347080http://lattes.cnpq.br/2203361164630380De Cesaro Júnior, Telmo2021-02-19T21:29:04Z2020-12-21DE CESARO Júnior, Telmo. InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais. 2020. 78 f. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de Passo Fundo, Passo Fundo, RS, 2020.http://tede.upf.br:8080/jspui/handle/tede/1956The manual task of counting and identifying small insects, such as aphids and parasitoids, captured in color-type field traps is exhausting, time-consuming, and non-scalable. This activity involves the separation of the elements of interest and requires the use of magnifiers or microscopes. Recent advances in artificial intelligence, image processing, and high-performance computing have enabled the development of efficient computer vision solutions to monitor pests and identify diseases in plants. With this in mind, this work presents InsectCV, a system for the automatic counting and identification of insects in images generated by the scanning of samples captured in traps. For the development of this solution, we used a 209 grayscale images dataset containing 17,908 labeled insects, a convolutional neural network Mask R-CNN to generate the model, and the development of three web services. During the training of the model, we applied the transfer learning technique and the data augmentation. We defined two new parameters to adjust the false-positive ratio by class. We used images of insects obtained from traps exposed in Coxilha and Passo Fundo, RS, Brazil in 2019 and 2020 wheat crops. In comparison to the manual counting, we verified coefficients determination close to 1 (R2 = 0:87 for aphids and R2 = 0:92 for parasitoids), proving the ability of the model to identify the fluctuation of population levels for these insects. Therefore, InsectCV can be used to detect action thresholds in alert systems for integrated pest management.A tarefa manual de contagem e identificação de pequenos insetos, como afídeos e parasitoides, capturados em armadilhas de campo do tipo cor é exaustiva, demorada e não escalável. Essa atividade envolve a separação dos elementos de interesse e requer a utilização de lupas e/ou microscópios. Recentes avanços em inteligência artificial, processamento de imagens e computação de alto desempenho têm viabilizado o desenvolvimento de soluções de visão computacional eficientes para monitorar pragas e identificar doenças em plantas. Nesse sentido, este trabalho apresenta o InsectCV, um sistema para a contagem e identificação automática de insetos em imagens geradas pela digitalização de amostras capturadas em armadilhas. Para o desenvolvimento dessa solução, utilizou-se um conjunto de 209 imagens em escala de cinza contendo 17.908 insetos rotulados, a rede neural convolucional profunda Mask R-CNN para a geração do modelo e a implementação de três serviços web. No treinamento do modelo foi aplicada a técnica de transferência de aprendizado e aumento de dados. Foram definidos dois novos parâmetros para ajustar a relação de falsos positivos por classe. Para a validação do modelo foram utilizadas imagens de insetos obtidas a partir de armadilhas expostas em Coxilha e Passo Fundo, RS, Brasil nas safras de trigo de 2019 e 2020. Em comparação com a contagem manual, os coeficientes de determinação foram próximos a 1 (R 2 = 0,87 para afídeos e R 2 = 0,92 para parasitoides), indicando a capacidade do modelo em identificar a flutuação dos níveis populacionais para esses insetos. Sendo assim, o InsectCV pode ser utilizado para detectar limiares de ação em sistemas de alerta para manejo integrado de pragas.Submitted by Aline Rezende (alinerezende@upf.br) on 2021-02-19T21:29:04Z No. of bitstreams: 1 2020TelmoDeCesaroJunior.pdf: 5991081 bytes, checksum: 4b32d8d00286c44dfcbab6d5d5993c0f (MD5)Made available in DSpace on 2021-02-19T21:29:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2020TelmoDeCesaroJunior.pdf: 5991081 bytes, checksum: 4b32d8d00286c44dfcbab6d5d5993c0f (MD5) Previous issue date: 2020-12-21application/pdfporUniversidade de Passo FundoPrograma de Pós-Graduação em Computação AplicadaUPFBrasilInstituto de Ciências Exatas e Geociências – ICEGInformática na agriculturaPragas agrícolas - ControleCIENCIA DA COMPUTACAO::SISTEMAS DE COMPUTACAOInsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitaisInsectCV: a system for detecting insects in digital imagesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis-70926567600265482650050060061067264934210586263671711205811204509info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca de teses e dissertações da Universidade de Passo Fundo (BDTD UPF)instname:Universidade de Passo Fundo (UPF)instacron:UPFORIGINAL2020TelmoDeCesaroJunior.pdf2020TelmoDeCesaroJunior.pdfapplication/pdf5991081http://tede.upf.br:8080/jspui/bitstream/tede/1956/2/2020TelmoDeCesaroJunior.pdf4b32d8d00286c44dfcbab6d5d5993c0fMD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82165http://tede.upf.br:8080/jspui/bitstream/tede/1956/1/license.txtbd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468MD51tede/19562021-11-23 12:48:55.805oai:tede.upf.br: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Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://tede.upf.br/oai/requestbiblio@upf.br || bio@upf.br || cas@upf.br || car@upf.br || lve@upf.br || sar@upf.br || sol@upf.br || upfmundi@upf.br || jucelei@upf.bropendoar:2021-11-23T14:48:55Biblioteca de teses e dissertações da Universidade de Passo Fundo (BDTD UPF) - Universidade de Passo Fundo (UPF)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais |
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
InsectCV: a system for detecting insects in digital images |
title |
InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais |
spellingShingle |
InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais De Cesaro Júnior, Telmo Informática na agricultura Pragas agrícolas - Controle CIENCIA DA COMPUTACAO::SISTEMAS DE COMPUTACAO |
title_short |
InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais |
title_full |
InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais |
title_fullStr |
InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais |
title_full_unstemmed |
InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais |
title_sort |
InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais |
author |
De Cesaro Júnior, Telmo |
author_facet |
De Cesaro Júnior, Telmo |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Rieder, Rafael |
dc.contributor.advisor1ID.fl_str_mv |
95320598068 |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/3010497094377497 |
dc.contributor.authorID.fl_str_mv |
00001347080 |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/2203361164630380 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
De Cesaro Júnior, Telmo |
contributor_str_mv |
Rieder, Rafael |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Informática na agricultura Pragas agrícolas - Controle |
topic |
Informática na agricultura Pragas agrícolas - Controle CIENCIA DA COMPUTACAO::SISTEMAS DE COMPUTACAO |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CIENCIA DA COMPUTACAO::SISTEMAS DE COMPUTACAO |
description |
The manual task of counting and identifying small insects, such as aphids and parasitoids, captured in color-type field traps is exhausting, time-consuming, and non-scalable. This activity involves the separation of the elements of interest and requires the use of magnifiers or microscopes. Recent advances in artificial intelligence, image processing, and high-performance computing have enabled the development of efficient computer vision solutions to monitor pests and identify diseases in plants. With this in mind, this work presents InsectCV, a system for the automatic counting and identification of insects in images generated by the scanning of samples captured in traps. For the development of this solution, we used a 209 grayscale images dataset containing 17,908 labeled insects, a convolutional neural network Mask R-CNN to generate the model, and the development of three web services. During the training of the model, we applied the transfer learning technique and the data augmentation. We defined two new parameters to adjust the false-positive ratio by class. We used images of insects obtained from traps exposed in Coxilha and Passo Fundo, RS, Brazil in 2019 and 2020 wheat crops. In comparison to the manual counting, we verified coefficients determination close to 1 (R2 = 0:87 for aphids and R2 = 0:92 for parasitoids), proving the ability of the model to identify the fluctuation of population levels for these insects. Therefore, InsectCV can be used to detect action thresholds in alert systems for integrated pest management. |
publishDate |
2020 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2020-12-21 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2021-02-19T21:29:04Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
DE CESARO Júnior, Telmo. InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais. 2020. 78 f. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de Passo Fundo, Passo Fundo, RS, 2020. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://tede.upf.br:8080/jspui/handle/tede/1956 |
identifier_str_mv |
DE CESARO Júnior, Telmo. InsectCV: um sistema para detecção de insetos em imagens digitais. 2020. 78 f. Dissertação (Mestrado em Computação Aplicada) - Universidade de Passo Fundo, Passo Fundo, RS, 2020. |
url |
http://tede.upf.br:8080/jspui/handle/tede/1956 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.program.fl_str_mv |
-709265676002654826 |
dc.relation.confidence.fl_str_mv |
500 500 600 |
dc.relation.department.fl_str_mv |
6106726493421058626 |
dc.relation.cnpq.fl_str_mv |
3671711205811204509 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade de Passo Fundo |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Computação Aplicada |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UPF |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Instituto de Ciências Exatas e Geociências – ICEG |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade de Passo Fundo |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca de teses e dissertações da Universidade de Passo Fundo (BDTD UPF) instname:Universidade de Passo Fundo (UPF) instacron:UPF |
instname_str |
Universidade de Passo Fundo (UPF) |
instacron_str |
UPF |
institution |
UPF |
reponame_str |
Biblioteca de teses e dissertações da Universidade de Passo Fundo (BDTD UPF) |
collection |
Biblioteca de teses e dissertações da Universidade de Passo Fundo (BDTD UPF) |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://tede.upf.br:8080/jspui/bitstream/tede/1956/2/2020TelmoDeCesaroJunior.pdf http://tede.upf.br:8080/jspui/bitstream/tede/1956/1/license.txt |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
4b32d8d00286c44dfcbab6d5d5993c0f bd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca de teses e dissertações da Universidade de Passo Fundo (BDTD UPF) - Universidade de Passo Fundo (UPF) |
repository.mail.fl_str_mv |
biblio@upf.br || bio@upf.br || cas@upf.br || car@upf.br || lve@upf.br || sar@upf.br || sol@upf.br || upfmundi@upf.br || jucelei@upf.br |
_version_ |
1809092296533082112 |