Antimicrobial Peptides against Listeria monocytogenes : omic approaches and potential biotechnological applications

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Stincone, Paolo
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Tese
Idioma: eng
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/233095
Resumo: A Listeria monocytogenes representa uma ameaça, especialmente para pessoas com sistema imunológico fraco, crianças e mulheres grávidas. A Nisina é utilizada na indústria alimentar para comparar surtos de bactérias Gram-positivas que podem pôr em risco a saúde dos consumidores. No entanto, a pesquisa de novos compostos antimicrobianos (AMPs) tornou-se fundamental para contrastar a detecção cada vez mais frequente da resistência à nisina por L. monocytogenes. Neste trabalho, Bacillus velezensis P34 produtor de fengicina um lipopeptídeos cíclicos foi estudado como possível alternativa de AMPs para uso contra L. monocytogenes. O genoma completo de B. velezensis P34 foi investigado quanto à presença de aglomerados de genes de compostos antimicrobianos. Os compostos secretados foram identificados como fengicina A e B, e em menores quantidades bacilomicina L, por meio de análise de espectrometria de massas. A análise proteômica foi realizada para estudar o "proteosurfactoma", incluindo a proteína moonlight de L. monocytogenes tratada com uma concentração subletal de nisina, detectando a inibição do processo de virulência, além da promoção do biofilme como estratégia de resistência bacteriana. Um estudo proteômico adicional permitiu pela primeira vez a reação fisiológica em L. monocytogenes tratada com os AMPs secretados por Bacillus velezensis P34. Neste estudo, uma nanoencapsulação em lipossomas foi avaliada como aplicação biotecnológica. Dentre os principais resultados deste último trabalho, foi observada forte desregulação dos transportadores de manganês com intensa regulação de outros transportadores de metais para a homeostase de íons metálicos, além de forte regulação negativa de proteínas relacionadas com os principais fatores de virulência Prfa, σB e virR. Além disso, foi realizado um estudo de comparação proteômica e lipidômica adicional, no qual os AMPs de nisina e fengicina foram considerados nesta pesquisa. A forte regulação negativa de proteínas e a variação quantitativa dos ácidos graxos do lipidoma da membrana sugeriram fortemente a inibição do biofilme quando tratado com uma concentração subletal de lipopeptídeos de fengicina; enquanto um grupo de proteínas de membrana foi investigado por sua ação na manutenção da possível resistência de membrana aos AMPs. Os resultados sugeriram a estrutura multicelular do biofilme como a principal preocupação quando pequenas quantidades de nisina podem ser utilizadas, além de que o estudo da ação de compostos secretados de Bacillus velezensis P34 sobre L. monocytogenes pode representar um importante ponto de partida para estudos mais aprofundados de fengicina para uso contra Gram-bactérias positivas, incluindo cepas multirresistentes.
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Dentre os principais resultados deste último trabalho, foi observada forte desregulação dos transportadores de manganês com intensa regulação de outros transportadores de metais para a homeostase de íons metálicos, além de forte regulação negativa de proteínas relacionadas com os principais fatores de virulência Prfa, σB e virR. Além disso, foi realizado um estudo de comparação proteômica e lipidômica adicional, no qual os AMPs de nisina e fengicina foram considerados nesta pesquisa. A forte regulação negativa de proteínas e a variação quantitativa dos ácidos graxos do lipidoma da membrana sugeriram fortemente a inibição do biofilme quando tratado com uma concentração subletal de lipopeptídeos de fengicina; enquanto um grupo de proteínas de membrana foi investigado por sua ação na manutenção da possível resistência de membrana aos AMPs. Os resultados sugeriram a estrutura multicelular do biofilme como a principal preocupação quando pequenas quantidades de nisina podem ser utilizadas, além de que o estudo da ação de compostos secretados de Bacillus velezensis P34 sobre L. monocytogenes pode representar um importante ponto de partida para estudos mais aprofundados de fengicina para uso contra Gram-bactérias positivas, incluindo cepas multirresistentes.Listeria monocytogenes poses a threat especially to people with weak immune systems, children, and pregnant women. Nisin is employed in food industries to contrast Gram positive bacteria outbreaks, which could endanger the health of consumers. However, the research of new antimicrobial compounds (AMPs) has become pivotal to contrast the always more frequent detection of L. monocytogenes nisin resistance. In this doctoral dissertation, the Bacillus velezensis P34, producer of fengycin cyclic lipopeptides as possible alternative AMPs, to use against L. monocytogenes, was studied. Bacillus velezensis P34 whole genome was investigated because of the presence of antimicrobial compound gene clusters, and the secreted compounds were identified as fengycin A and B and, in smaller quantities, bacillomycin L through mass spectrometric analysis. Proteomics analysis was carried out to study the “proteosurfactome” including moonlight protein of L. monocytogenes treated with a sub-lethal concentration of nisin detecting the inhibition of the virulence process besides the biofilm promotion as a bacterial resistance strategy. An additional proteomic study permitted, for the first time, to detect the physiological reaction on L. monocytogenes treated with the AMPs secreted by Bacillus velezensis P34; in the latter, a biotechnological application, specifically a liposome nanoencapsulation, was evaluated. Among the main results of this latter work, strong deregulation of the manganese transporters was observed with intense regulation of others metals transporters for the metal ions homeostasis, besides a strong downregulation of proteins related with the main virulence factors Prfa, σB and virR Moreover, an additional proteomic and lipidomic comparison study was performed, nisin and fengycin AMPs were considered in the experimental drawing of this latter. The strong downregulation of proteins and, quantitatively, the variation of membrane lipidome fatty acids strongly suggested the inhibition of biofilm when treated with a sub-lethal concentration of fengycin lipopeptides; whereas a group of membrane proteins was investigated for their action on the maintaining of the possible membrane resistance to AMPs. The results suggested the promotion of biofilm multicellular organization as the main concern when sub-lethal concentration of nisin was used, besides to that the L. monocytogenes responses to the CLPs synthesized by Bacillus velezensis P34 may represent an important start for deeper studies involving the antimicrobial action of fengycin to use against Gram-positive bacteria, including multiresistant strains.application/pdfengNisinaListeria monocytogenesAntimicrobianosAntimicrobial Peptides against Listeria monocytogenes : omic approaches and potential biotechnological applicationsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulCentro de Biotecnologia do Estado do Rio Grande do SulPrograma de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularPorto Alegre, BR-RS2021doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001134899.pdf.txt001134899.pdf.txtExtracted Texttext/plain434882http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/233095/2/001134899.pdf.txtf23edcb229335cf21e240b26d910cfa7MD52ORIGINAL001134899.pdfTexto completoapplication/pdf4339959http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/233095/1/001134899.pdfc4147258270696c431bb32b2ecebd543MD5110183/2330952022-01-07 05:32:57.41803oai:www.lume.ufrgs.br:10183/233095Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532022-01-07T07:32:57Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
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