Desvendando o potencial de Escherichia coli enterotoxigênica na modulação da microbiota e da resposta imune no eixo intestino-pulmão em suínos

• Autor(a) principal: Breyer, Gabriela Merker
• Data de Publicação: 2024
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/274680
• topic: Microbioma gastrointestinal; Sistema imunitário; Infecções por Escherichia coli; Escherichia coli enterotoxigênica; Suínos; Microbiota; ETEC; Gut-lung axis; 16S-rDNA; RT-qPCR

A microbiota intestinal de suínos em suas fases iniciais de desenvolvimento, que já sofre em virtude do estresse do desmame e imaturidade do trato gastrointestinal (TGI), se torna ainda mais suscetível à disbiose frente a Escherichia coli enterotoxigênica (ETEC). Devido à interação entre mucosas, o efeito das modificações na microbiota intestinal causadas por este patógeno gastrintestinal pode se estender para o trato respiratório; no entanto, pouco se sabe sobre como a presença de ETEC atua no eixo intestino-pulmão em leitões. Portanto, este trabalho visa elucidar o papel de ETEC na modulação da microbiota intestinal e pulmonar e na expressão gênica de marcadores do sistema imunológico (SI) de suínos portadores de ETEC assintomáticos e diarreicos. Ademais, considerando a dificuldade em se caracterizar a microbiota do trato respiratório, também se propõe um método alternativo para o sequenciamento por amplicon de amostras com baixa densidade microbiana. Foram analisados suínos em diferentes fases de desenvolvimento quanto à presença de ETEC em amostras de fezes, e classificados como carreadores (ETEC+) ou não carreadores (ETEC-). Em seguida, animais selecionados tiveram sua microbiota intestinal e pulmonar caracterizadas por sequenciamento da região V4 do gene 16S-rDNA pela plataforma Illumina MiSeq, e a caracterização do perfil transcricional de genes marcadores do SI por RT-qPCR. A validação do método alternativo foi realizada através de análises de mock community e amostras clínicas sem causar viés nas sequências geradas, permitindo sua aplicação na análise da microbiota pulmonar de leitões. Na microbiota intestinal, houve uma redução na α-diversidade em animais ETEC+, sendo a fase de desenvolvimento dos suínos um importante fator contribuinte para a modulação da composição das comunidades bacterianas neste sítio. A presença de ETEC também favoreceu a disbiose da microbiota do eixo intestino-pulmão e alteração da resposta imune em nível transcricional não apenas no TGI, mas também sistêmico e no trato respiratório dos animais analisados. Os resultados obtidos apontam que patógenos gastrintestinais, mesmo quando latentes, são capazes de modular a saúde dos suínos, ressaltando a importância do monitoramento e controle da disseminação de ETEC nas granjas, e de estudos sobre a dinâmica do eixo intestino-pulmão na área veterinária.