Pesquisa e caracterização de agentes virais em aves antárticas por meio de técnicas moleculares
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10183/214672 |
Resumo: | Apesar de sua distribuição geográfica remota, as aves do continente antártico não estão protegidas dos efeitos de inúmeros patógenos, inclusive dos vírus. No entanto, pouco se sabe sobre tais patógenos, bem como sobre suas potenciais consequências ecológicas para as populações de aves antárticas. Diante disso, o presente estudo propõe-se a investigar a presença de agentes virais em amostras de aves antárticas de três espécies de Sphenisciformes (pinguins), duas de Procellariiformes (petréis), uma de Charadriiformes (mandrião) e uma de Pelecaniformes (cormorão). Para tanto, empregaram-se diferentes técnicas moleculares. Técnicas de PCR e RT-qPCR de amplo espectro foram adotadas para investigar a presença de vírus minimamente relacionados com patógenos virais sabidamente capazes de infectar aves. Dentre eles, o vírus da influenza A pôde ser identificado em duas espécies, uma residente e uma migratória. Com base nos resultados obtidos por meio dessas técnicas moleculares, foi realizado um sequenciamento de alto desempenho para análise do viroma das espécies consideradas mais suscetíveis. Tal abordagem possibilitou entrever possíveis novas variantes tanto de vírus tipicamente infectantes de aves quanto de vírus infectantes de seres humanos, evocando a variabilidade desses vírus como importantes indicadores da dinâmica e da ecologia viral em espécies selvagens. |
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Chiappetta, Catarina MarconDriemeier, David2020-11-05T04:09:04Z2018http://hdl.handle.net/10183/214672001106754Apesar de sua distribuição geográfica remota, as aves do continente antártico não estão protegidas dos efeitos de inúmeros patógenos, inclusive dos vírus. No entanto, pouco se sabe sobre tais patógenos, bem como sobre suas potenciais consequências ecológicas para as populações de aves antárticas. Diante disso, o presente estudo propõe-se a investigar a presença de agentes virais em amostras de aves antárticas de três espécies de Sphenisciformes (pinguins), duas de Procellariiformes (petréis), uma de Charadriiformes (mandrião) e uma de Pelecaniformes (cormorão). Para tanto, empregaram-se diferentes técnicas moleculares. Técnicas de PCR e RT-qPCR de amplo espectro foram adotadas para investigar a presença de vírus minimamente relacionados com patógenos virais sabidamente capazes de infectar aves. Dentre eles, o vírus da influenza A pôde ser identificado em duas espécies, uma residente e uma migratória. Com base nos resultados obtidos por meio dessas técnicas moleculares, foi realizado um sequenciamento de alto desempenho para análise do viroma das espécies consideradas mais suscetíveis. Tal abordagem possibilitou entrever possíveis novas variantes tanto de vírus tipicamente infectantes de aves quanto de vírus infectantes de seres humanos, evocando a variabilidade desses vírus como importantes indicadores da dinâmica e da ecologia viral em espécies selvagens.Despite their remote geographic distribution, birds in Antarctic continent are not beyond the effects of numerous pathogens, including viruses. However, little is known about such pathogens, as well as about their potential ecological consequences for Antarctic bird populations. The present study aims to investigate the presence of viral agents in samples of Antarctic birds, including three species of Sphenisciformes (penguins), two of Procellariiformes (petrels), one of Charadriiformes (skua) and one of Pelecaniformes (cormorant). For that, different molecular techniques were performed. Broad-spectrum PCR and RT-qPCR techniques were used to investigate the presence of important viral pathogens known to infect birds. Among them, influenza A virus could be identified in two species, one resident and one migratory. Based on the results obtained through these molecular techniques, high performance sequencing was performed for virome analysis of the species considered more susceptible. This approach made possible to glimpse both birds and human viruses possibly circulating amid these species, evoking the variability of viruses as important indicator of viral dynamics and ecology in wild species.application/pdfporMetagenômicaVírusAves marinhasAntárticaMetagenomicsViromeVirusSeabirdsAntarcticaPesquisa e caracterização de agentes virais em aves antárticas por meio de técnicas molecularesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulFaculdade de VeterináriaPrograma de Pós-Graduação em Ciências VeterináriasPorto Alegre, BR-RS2018doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001106754.pdf.txt001106754.pdf.txtExtracted Texttext/plain131856http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/214672/2/001106754.pdf.txtb45b406ad0f3f95031933385dc6b4404MD52ORIGINAL001106754.pdfTexto completoapplication/pdf2967412http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/214672/1/001106754.pdffa6193ce309e366b9b0565f8ab591954MD5110183/2146722022-09-17 05:22:22.973oai:www.lume.ufrgs.br:10183/214672Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532022-09-17T08:22:22Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false |
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