Isolamento, identificação molecular e produtos naturais de Streptomyces isolados da Antártica

• Autor(a) principal: Borba, Marcela Proença
• Data de Publicação: 2021
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/234781
• topic: Streptomyces; Actinobacteria; Farmacorresistência bacteriana; Anti-infecciosos; Produtos biológicos

Streptomyces é o gênero bacteriano mais promissor na pesquisa de produtos naturais, desde a Era de Ouro das descobertas de antibióticos até recentemente com a perspectiva dos grupos de genes crípticos de biossíntese. Entretanto, apesar do uso internacional do sequenciamento do gene 16S rRNA para identificação de espécies bacterianas, seu uso não discrimina as 750 espécies do gênero Streptomyces. Neste trabalho, o padrão de amplificação gerado por BOX-PCR e REP-PCR de 49 isolados de estreptomicetos de solo antártico foi comparado para avaliar a diversidade presente no grupo e para caracterizar os isolados bacterianos, além da amplificação dos genes 16S rRNA, rpoB, gyrB, recA, trpB e atpD. O primer BOX-A1R apresentou fragmentos mais claros, diferente dos padrões obtidos usando os primers REP 1R e 2R. Duas bases de dados foram utilizadas, GenBank e EzBioCloud, para comparar as sequências dos genes 16S das amostras. O banco de dados GenBank mostrou-se insuficiente para análise dos outros genes, devido à escassez de sequências depositadas. O isolado LMA323St_9 demonstrou ser potencialmente uma nova espécie a ser estudada. Além disso, o uso de genes housekeeping fornece informações filogenéticas robustas para o entendimento das relações dentro do grupo. Ainda, investigou-se os compostos antimicrobianos de 40 isolados, fermentação em microplacas e tubos foram usadas para testagem de 10 meios de cultura distintos e os extratos resultantes foram testados contra bactérias Gram-positivas e Gram negativas, fungos filamentosos e leveduras. Os extratos ativos foram analisados por LC-UV-LRMS e HRMS. Foram encontrados 14 compostos, incluíndo maltofilinas e alteramidas antifúngicas. Um isolado, identificado como LMA323St_43d, apresentou atividade antifúngica mas não foram encontrados compostos correspondentes nas bases de dados avaliadas. Este trabalho traz informações acerca de 49 isolados de Streptomyces com alto potencial antifúngico.