Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Martins, Ana Carolina
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/254320
Resumo: A proteólise mediada pelas calpaínas foi proposta como modulador da patogênese da ataxia espinocerebelar tipo 3 (SCA3/MJD), um distúrbio devido à expansão repetida CAG (CAGexp) no gene ATXN3. A calpaína-2 (CAPN2) promove a translocação do ataxina-3 mutante para o núcleo e sua agregação. A calpastatina (CAST) é um inibidor endógeno da calpaína. Nosso objetivo foi investigar se os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) rs17599 no CAPN2 e rs27852 e rs1559085 no CAST modulam a idade de início (AO - do inglês, age at onset) e a progressão da doença em indivíduos sintomáticos SCA3/MJD. A idade de início residual (RAO) - AO observada menos a AO prevista com base no CAGexp - foi usada para evitar o efeito relacionado ao CAGexp. A progressão da doença foi medida em um subgrupo pelas pontuações anuais do Neurological Examination Score for Ataxia Spinocerebellar (NESSCA). Trezentos e seis indivíduos com SCA3/MJD foram incluídos. Seis homozigotos GGrs1559085 (de 6 famílias) iniciaram a doença mais tarde que os outros indivíduos - sua média (DP) de RAO foi de +4,32 (3,65) versus -1,39 (7,99) anos (p = 0,01). Um haplótipo com SNPs no CAST foi construído: portadores e não-portadores de Crs27852/Grs1559085 apresentavam RAOs de 0,34 (7,90) e -1,74 (7,93) anos (p = 0,065). Não foram observadas diferenças significativas entre as pontuações longitudinais do NESSCA de 16 portadores e 58 não-portadores de Crs27852/Grs1559085. Concluímos que o alelo Grs1559085 no CAST está relacionado a variações na AO de indivíduos sintomáticos SCA3/MJD, independentemente dos efeitos do CAGexp. O efeito Grs1559085 foi significativo no modelo recessivo, mas não podemos descartar um efeito gradiente relacionado à codominância.
id URGS_944984e4ee95e70e8011f090a103ce7d
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/254320
network_acronym_str URGS
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
repository_id_str 1853
spelling Martins, Ana CarolinaJardim, Laura Bannach2023-02-07T05:02:46Z2020http://hdl.handle.net/10183/254320001155659A proteólise mediada pelas calpaínas foi proposta como modulador da patogênese da ataxia espinocerebelar tipo 3 (SCA3/MJD), um distúrbio devido à expansão repetida CAG (CAGexp) no gene ATXN3. A calpaína-2 (CAPN2) promove a translocação do ataxina-3 mutante para o núcleo e sua agregação. A calpastatina (CAST) é um inibidor endógeno da calpaína. Nosso objetivo foi investigar se os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) rs17599 no CAPN2 e rs27852 e rs1559085 no CAST modulam a idade de início (AO - do inglês, age at onset) e a progressão da doença em indivíduos sintomáticos SCA3/MJD. A idade de início residual (RAO) - AO observada menos a AO prevista com base no CAGexp - foi usada para evitar o efeito relacionado ao CAGexp. A progressão da doença foi medida em um subgrupo pelas pontuações anuais do Neurological Examination Score for Ataxia Spinocerebellar (NESSCA). Trezentos e seis indivíduos com SCA3/MJD foram incluídos. Seis homozigotos GGrs1559085 (de 6 famílias) iniciaram a doença mais tarde que os outros indivíduos - sua média (DP) de RAO foi de +4,32 (3,65) versus -1,39 (7,99) anos (p = 0,01). Um haplótipo com SNPs no CAST foi construído: portadores e não-portadores de Crs27852/Grs1559085 apresentavam RAOs de 0,34 (7,90) e -1,74 (7,93) anos (p = 0,065). Não foram observadas diferenças significativas entre as pontuações longitudinais do NESSCA de 16 portadores e 58 não-portadores de Crs27852/Grs1559085. Concluímos que o alelo Grs1559085 no CAST está relacionado a variações na AO de indivíduos sintomáticos SCA3/MJD, independentemente dos efeitos do CAGexp. O efeito Grs1559085 foi significativo no modelo recessivo, mas não podemos descartar um efeito gradiente relacionado à codominância.Calpain-mediated proteolysis has been proposed to modulate the pathogenesis of spinocerebellar ataxia type 3 (SCA3/MJD), a disorder due to a CAG repeat expansion (CAGexp) at ATXN3. Calpain-2 (CAPN2) promotes translocation of the mutant ataxin-3 to the nucleus and aggregation. Calpastatin (CAST) is an endogenous calpain inhibitor. We aimed to investigated if single nucleotide polymorphisms (SNPs) rs17599 at CAPN2, and rs27852 and rs1559085 at CAST modulate the age at onset (AO) and disease progression in SCA3/MJD symptomatic subjects. The residual age at onset (RAO) - the observed AO minus the predicted AO based on the CAGexp - was used to avoid confounder effect related to CAGexp. Disease progression was measured in a subgroup by annual scores of the Neurological Examination Score for Spinocerebellar Ataxia (NESSCA). Three hundred and six SCA3/MJD individuals were included. Grs1559085 was a minor allele. Six GGrs1559085 homozygotes (from 6 families) started the disease later than the other subjects – their mean (SD) RAO were +4.32 (3.65) versus -1.39 (7.99) years (p=0,01). A haplotype with SNPs at CAST was built: carriers and non carriers of Crs27852/Grs1559085 had RAOs of 0.34 (7.90) and -1.74 (7.93) years (p=0.065). No significant differences were seen between longitudinal NESSCA scores of 16 carriers and 58 non-carriers of Crs27852/Grs1559085 . We concluded that G s1559085 allele at CAST is related to variations in the AO of symptomatic SCA3/MJD subjects, independent from the effects of the CAGexp. G s1559085 effect was significant in the recessive model, but we cannot discard a gradient effect related to codominance.application/pdfporAtaxias espinocerebelaresDoença de Machado-JosephCalpaínaInvestigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Josephinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de BiociênciasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularPorto Alegre, BR-RS2020mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001155659.pdf.txt001155659.pdf.txtExtracted Texttext/plain92676http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/254320/2/001155659.pdf.txt64b32da132d66500276a71f91382e647MD52ORIGINAL001155659.pdfTexto completoapplication/pdf1297996http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/254320/1/001155659.pdf7cf36486654f7ea5dbaab859f999f1f8MD5110183/2543202023-02-08 06:03:45.03129oai:www.lume.ufrgs.br:10183/254320Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532023-02-08T08:03:45Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph
title Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph
spellingShingle Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph
Martins, Ana Carolina
Ataxias espinocerebelares
Doença de Machado-Joseph
Calpaína
title_short Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph
title_full Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph
title_fullStr Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph
title_full_unstemmed Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph
title_sort Investigação de variantes em genes da via de clivagem da ataxina-3 como fatores modificadores de fenótipo na Doença de Machado Joseph
author Martins, Ana Carolina
author_facet Martins, Ana Carolina
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Martins, Ana Carolina
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Jardim, Laura Bannach
contributor_str_mv Jardim, Laura Bannach
dc.subject.por.fl_str_mv Ataxias espinocerebelares
Doença de Machado-Joseph
Calpaína
topic Ataxias espinocerebelares
Doença de Machado-Joseph
Calpaína
description A proteólise mediada pelas calpaínas foi proposta como modulador da patogênese da ataxia espinocerebelar tipo 3 (SCA3/MJD), um distúrbio devido à expansão repetida CAG (CAGexp) no gene ATXN3. A calpaína-2 (CAPN2) promove a translocação do ataxina-3 mutante para o núcleo e sua agregação. A calpastatina (CAST) é um inibidor endógeno da calpaína. Nosso objetivo foi investigar se os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) rs17599 no CAPN2 e rs27852 e rs1559085 no CAST modulam a idade de início (AO - do inglês, age at onset) e a progressão da doença em indivíduos sintomáticos SCA3/MJD. A idade de início residual (RAO) - AO observada menos a AO prevista com base no CAGexp - foi usada para evitar o efeito relacionado ao CAGexp. A progressão da doença foi medida em um subgrupo pelas pontuações anuais do Neurological Examination Score for Ataxia Spinocerebellar (NESSCA). Trezentos e seis indivíduos com SCA3/MJD foram incluídos. Seis homozigotos GGrs1559085 (de 6 famílias) iniciaram a doença mais tarde que os outros indivíduos - sua média (DP) de RAO foi de +4,32 (3,65) versus -1,39 (7,99) anos (p = 0,01). Um haplótipo com SNPs no CAST foi construído: portadores e não-portadores de Crs27852/Grs1559085 apresentavam RAOs de 0,34 (7,90) e -1,74 (7,93) anos (p = 0,065). Não foram observadas diferenças significativas entre as pontuações longitudinais do NESSCA de 16 portadores e 58 não-portadores de Crs27852/Grs1559085. Concluímos que o alelo Grs1559085 no CAST está relacionado a variações na AO de indivíduos sintomáticos SCA3/MJD, independentemente dos efeitos do CAGexp. O efeito Grs1559085 foi significativo no modelo recessivo, mas não podemos descartar um efeito gradiente relacionado à codominância.
publishDate 2020
dc.date.issued.fl_str_mv 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-02-07T05:02:46Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/254320
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 001155659
url http://hdl.handle.net/10183/254320
identifier_str_mv 001155659
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/254320/2/001155659.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/254320/1/001155659.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 64b32da132d66500276a71f91382e647
7cf36486654f7ea5dbaab859f999f1f8
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv lume@ufrgs.br||lume@ufrgs.br
_version_ 1800309209950060544