Piratas de água doce : testando histórias de captura de rio em peixes através de dados genéticos

• Autor(a) principal: Souza, Mateus Santos de
• Data de Publicação: 2020
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: eng
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/233040
• topic: Ictiologia; Genética de populações; Cnesterodon decemmaculatus

Os peixes de água doce constituem um grupo diversificado de organismos que abrange cerca de um quarto do total de espécies de vertebrados. Interessantemente, essa grande diversidade ocorre em uma fração pequena do volume de água habitável do planeta. Uma das causas desse fenômeno é o isolamento provocado pela fragmentação dos ambientes de água doce em drenagens isoladas entre si, o qual propicia diferenciação genética entre populações habitando diferentes bacias, possivelmente culminando em especiação alopátrica. No entanto, diversos estudos filogeográficos reportam casos de similaridade genética entre populações de diferentes bacias. Fenômenos climático ou geológicos, como as capturas de rio, são normalmente invocados para explicar esse padrão. Na captura de rio, a proximidade genética entre indivíduos de diferentes bacias é explicada através de um contato secundário entre populações previamente isoladas. No entanto, a manutenção de polimorfismos ancestrais pode ser tão plausível quanto um contato secundário, mas essas hipóteses raramente são testadas explicitamente através de um método estatístico. O objetivo do presente estudo foi avaliar o desempenho da metodologia de Computação Bayesiana Aproximada (ABC) para testar, com base em dados genéticos empíricos e simulados, cenários explícitos de contato secundário causado por capturas de rio contra cenários de polimorfismo compartilhado em peixes de água doce. Inicialmente, foram avaliadas as conclusões de um estudo da literatura sobre os padrões de estrutura genética entre bacias hidrográficas observados em Cnesterodon decemmaculatus (Cyprinodontiformes: Poeciliidae) sugeridos como possíveis casos de captura de rio. Posteriormente, foi realizado um estudo de simulação, a fim de avaliar o desempenho da metodologia ABC em distinguir entre cenários em diferentes condições, variando desde o uso de diferentes marcadores moleculares e estratégias de amostragem até diferentes parâmetros demográficos. Para o estudo com C. decemmaculatus, os resultados demonstraram que o mtDNA tem potencial para distinguir entre os cenários, tornando possível a escolha do cenário mais provável na maior parte dos casos avaliados - embora esse marcador apresente algumas limitações, especialmente quando a divergência entre as populações é recente. A partir do estudo de simulações, foi verificado que o uso de milhares de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) independentes é uma opção altamente recomendável quando comparado ao uso de um ou poucos lócus, ainda que sua análise na perspectiva de ABC demande um maior trabalho computacional. Porém, a identificação de cenários de contato secundário com divergência recente e/ou com baixo número de migrantes é desafiadora, mesmo com o uso de SNPs.