Genetic basis of reproductive performance and antibody response in pigs during a porcine reproductive and respiratory syndrome outbreak

• Autor(a) principal: Hickmann, Felipe Mathias Weber
• Data de Publicação: 2020
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: eng
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/247638
• topic: Suíno; Reprodução animal; Resposta imunológica; PRRS; Swine; Genomics; S/P ratio; Reproduction; Antibody response

A produção total de anticorpos (Sample-to-Positive ratio; S/P ratio) vem sendo proposta como uma característica indicadora para melhorar o desempenho reprodutivo de porcas infectadas com o vírus da PRRS (PRRSV). Os objetivos deste trabalho foram avaliar a base genética do desempenho reprodutivo de matrizes suínas durante um surto de PRRS e a sua relação com o sistema imune. Amostras de sangue foram coletadas de 1231 porcas de raça pura (690 Duroc e 541 Landrace) após um surto de PRRS para a realização do teste ELISA e posterior genotipagem. Essas matrizes tiveram dados de desempenho reprodutivo coletados durante o surto da doença em relação ao número de leitões nascidos vivos (NBA), natimortos (NSB), mumificados (NM), nascidos mortos (NBD; NSB + NM), total de nascidos (TNB; NBA + NBD) e desmamados (NW), sendo genotipadas para 29799 marcadores do tipo SNPs. As estimativas de herdabilidade e os estudos de associação genômica ampla (GWAS) foram realizados para S/P ratio e características reprodutivas para cada raça separadamente. As estimativas de herdabilidade (±erro padrão) de S/P ratio durante o surto de PRRS foram moderadas, com 0,35±0,08 para Duroc e 0,34±0,09 para Landrace. Para S/P ratio, o GWAS identificou um importante locus de característica quantitativa (QTL) no cromossomo (chr) 7 [24-25 megabases (Mb)], explicando 15% da variação genética (VG) e outro no chr 8 (25 Mb) explicando 2,4% VG para Duroc. O GWAS também identificou dois QTLs no chr 7 (23-24 Mb; 108-109 Mb) explicando, respectivamente, 31% e 2.2% VG para Landrace. As estimativas de herdabilidade para as características reprodutivas foram, de modo geral, baixas nas duas raças. Correlações genéticas favoráveis foram observadas entre S/P ratio e NBA (0.61±0.34) e NBD (-0.33±0.32) em porcas da raça Landrace durante o surto da doença. Poucos QTL foram identificados para características reprodutivas em porcas das raças Duroc e Landrace. Acurácias de Predição Genômica (APG) foram medianas a altas para S/P ratio em SNPAll, SNPMHC e SNPRest para a predição dentro da raça. No entanto, APG foram baixas para características reprodutivas. Os resultados indicam que as características reprodutivas apresentam baixa herdabilidade durante o surto de PRRS, com poucos QTL identificados. Estes resultados validam a utilização de S/P ratio como uma característica indicadora, herdável e geneticamente correlacionada com características reprodutivas de interesse durante um surto de PRRS.