Análise de parentesco em três subpopulações de Ctenomys lami (Rodentia-Ctenomyidae) através de marcadores de microssatélites

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Matte, Eunice Moara
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/13620
Resumo: Ctenomys lami é um roedor fossorial endêmico de uma região da Planície Costeira do Rio Grande do Sul, Brasil, conhecida como Coxilha das Lombas. Pouco se sabe, ainda, sobre a ecologia, comportamento e genética dessa espécie que foi descrita por Freitas (2001), considerando que esses conhecimentos são fundamentais no entendimento dos intrincados padrões evolutivos da mesma e principalmente do gênero do qual faz parte, tendo em vista que é um dos com maior diversidade de espécies entre os mamíferos. Além da importância na resolução de questões evolutivas, conhecimentos gerais sobre a espécie são necessários para o desevolvimento de planos de conservação e preservação. Este trabalho teve como objetivo identificar relações genéticas dentro e entre três possíveis subpopulações de C. lami através da análise do fluxo gênico (Fst, Fis, rst, Nm), de informações gerais como PIC (Conteúdo de Informação Polimórfica), média de alelos por locus, heterozigosidade, deficiência de heterozigotos e das relações de paternidade e parentesco. Para isso foram utilizados 89 indivíduos da população (subpopulação A: n=19; B: n=37; C: n=33) de uma área localizada na região de Itapuã, mais exatamente na borda leste da Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), município de Viamão, RS. Para executar a análise genética foram utilizados marcadores de microssatélites descritos para espécies cogenéricas - Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8 desenvolvidas a partir de C. sociabilis e Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12 de C. haigi por Lacey (1999; 2001). Os resultados identificam que há um grande fluxo gênico, demonstrando assim, que não há uma subdivisão significativa entre as subpopulações sugeridas, mas também demonstram que parece haver uma estruturação incipiente, onde a distância e a baixa mobilidade dos indivíduos têm papel fundamental. A verificação da estrutura populacional através da análise de paternidade e parentesco indicou que a baixa variabilidade dos loci estudados impede uma definição real de paternidade e não oferecem dados suficientes para definir estruturação e comportamento dessa espécie. Sugere-se que essa baixa variabilidade seja resultado de um Efeito Fundador ocorrido recentemente na população.
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spelling Matte, Eunice MoaraFreitas, Thales Renato Ochotorena de2008-08-09T04:11:48Z2006http://hdl.handle.net/10183/13620000640987Ctenomys lami é um roedor fossorial endêmico de uma região da Planície Costeira do Rio Grande do Sul, Brasil, conhecida como Coxilha das Lombas. Pouco se sabe, ainda, sobre a ecologia, comportamento e genética dessa espécie que foi descrita por Freitas (2001), considerando que esses conhecimentos são fundamentais no entendimento dos intrincados padrões evolutivos da mesma e principalmente do gênero do qual faz parte, tendo em vista que é um dos com maior diversidade de espécies entre os mamíferos. Além da importância na resolução de questões evolutivas, conhecimentos gerais sobre a espécie são necessários para o desevolvimento de planos de conservação e preservação. Este trabalho teve como objetivo identificar relações genéticas dentro e entre três possíveis subpopulações de C. lami através da análise do fluxo gênico (Fst, Fis, rst, Nm), de informações gerais como PIC (Conteúdo de Informação Polimórfica), média de alelos por locus, heterozigosidade, deficiência de heterozigotos e das relações de paternidade e parentesco. Para isso foram utilizados 89 indivíduos da população (subpopulação A: n=19; B: n=37; C: n=33) de uma área localizada na região de Itapuã, mais exatamente na borda leste da Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), município de Viamão, RS. Para executar a análise genética foram utilizados marcadores de microssatélites descritos para espécies cogenéricas - Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8 desenvolvidas a partir de C. sociabilis e Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12 de C. haigi por Lacey (1999; 2001). Os resultados identificam que há um grande fluxo gênico, demonstrando assim, que não há uma subdivisão significativa entre as subpopulações sugeridas, mas também demonstram que parece haver uma estruturação incipiente, onde a distância e a baixa mobilidade dos indivíduos têm papel fundamental. A verificação da estrutura populacional através da análise de paternidade e parentesco indicou que a baixa variabilidade dos loci estudados impede uma definição real de paternidade e não oferecem dados suficientes para definir estruturação e comportamento dessa espécie. Sugere-se que essa baixa variabilidade seja resultado de um Efeito Fundador ocorrido recentemente na população.Ctenomys lami was recently described by Freitas (2001) as a fossorial rodent, living only in Coxilha das Lombas, a region of the Coastal Plain of Rio Grande do Sul. The ecology, behavior and genetics of this species are not well known, although such knowledge is essential for understanding the intricate evolution patterns of this species as well as of the genus, which is one with the highest diversity among the mammals. Besides the importance of clarifying the evolution questions, general knowledge about this species is needed for developing conservation strategies. This work has the goal of identifying genetic relationships within and between three possible subpopulations of C. lami through the analysis of (i) genetic flow (Fst, Fis, rst, Nm), (ii) general information like PIC (Polymophic Information Content), allele mean per locus, heterozigosity, heterozygote deficiency and (iii) relatedness among individuals. Eighty-nine individuals from a population (subpopulation A: n=19; B: n=37; C: n=33) were analyzed in the area located in the region known as Itapuã, at the east banks of Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), in Viamão, RS. To execute the genetic analysis, we used microsatellite markers described to cogeneric species (Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12, developed from C. haigi; and Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8, from C. sociabilis) by Lacey (1999; 2001). Results showed that there is high gene flow, and thus the three suggested sub-populations are not significantly divided. However, the population is not structured and the distance and low motility of individuals play an important role in this situation. When verifying the population structure through relatedness analysis, we found that the low variability of the studied loci does not allow a correct definition of paternity, and does not provide enough data to define structure and behavior of this species. We thus suggest that this low variability is an effect of a recent founder effect in this population.application/pdfporCtenomys lamiMicrossatéliteGenética de populaçõesAnálise de parentesco em três subpopulações de Ctenomys lami (Rodentia-Ctenomyidae) através de marcadores de microssatélitesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de BiociênciasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularPorto Alegre, BR-RS2006mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL000640987.pdf000640987.pdfTexto completoapplication/pdf835594http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/13620/1/000640987.pdf0bae96e2b7a794bd68dafb936b76c873MD51TEXT000640987.pdf.txt000640987.pdf.txtExtracted Texttext/plain93546http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/13620/2/000640987.pdf.txtac7764b5dc47e4036d8742fa6f04a3ecMD52THUMBNAIL000640987.pdf.jpg000640987.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1202http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/13620/3/000640987.pdf.jpg307babf3c85b23c99b42f4639aa08b27MD5310183/136202018-10-10 08:21:04.231oai:www.lume.ufrgs.br:10183/13620Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532018-10-10T11:21:04Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
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