Filogenia de Passiflora L. (Passifloraceae) : questões infra-subgenéricas
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2007 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10183/13704 |
Resumo: | O gênero Passiflora L. (Passifloraceae) é composto por mais de 520 espécies, classificadas em quatro subgêneros: Astrophea, Decaloba, Deidamioides e Passiflora. Embora algumas análises filogenéticas tenham sido realizadas nos últimos anos, sua classificação infra-subgenérica permanece em aberto. Com o objetivo de auxiliar na elucidação destas questões e caracterizar novos marcadores filogenéticos para o gênero Passiflora, análises com seqüências do gene plastidial que codifica a maior subunidade da enzima RNA-polimerase de cloroplasto (rpoC1), dos espaçadores internos transcritos do DNA ribossomal nuclear (ITS1 e ITS2) e do íntron b-c do gene nad1 do genoma mitocondrial, foram desenvolvidas para 121 espécies de Passiflora. As análises foram realizadas usando métodos de distância, máxima parcimônia, máxima verossimilhança e inferência bayesiana para cada subgênero em separado e para o conjunto total de dados. A monofilia dos subgêneros Astrophea, Decaloba e Passiflora foi confirmada, embora a monofilia do subgênero Deidamioides permaneça em aberto. Os resultados suportam, ainda, a existência de um quinto subgênero, Tryphostemmatoides. Análises realizadas para cada subgênero em separado demonstraram que esta estratégia é um método eficiente para a análise de marcadores com alta variabilidade entre os grupos, como é o caso dos subgêneros de Passiflora. ITS1 e ITS2 foram os marcadores moleculares mais informativos. Em geral, as superseções, seções e séries dos quatro subgêneros foram não-monofiléticas, sugerindo a necessidade de uma revisão cuidadosa dos caracteres morfológicos tipicamente usados em sua delimitação. |
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Zamberlan, Priscilla MenaFreitas, Loreta Brandão de2008-08-21T04:28:31Z2007http://hdl.handle.net/10183/13704000626430O gênero Passiflora L. (Passifloraceae) é composto por mais de 520 espécies, classificadas em quatro subgêneros: Astrophea, Decaloba, Deidamioides e Passiflora. Embora algumas análises filogenéticas tenham sido realizadas nos últimos anos, sua classificação infra-subgenérica permanece em aberto. Com o objetivo de auxiliar na elucidação destas questões e caracterizar novos marcadores filogenéticos para o gênero Passiflora, análises com seqüências do gene plastidial que codifica a maior subunidade da enzima RNA-polimerase de cloroplasto (rpoC1), dos espaçadores internos transcritos do DNA ribossomal nuclear (ITS1 e ITS2) e do íntron b-c do gene nad1 do genoma mitocondrial, foram desenvolvidas para 121 espécies de Passiflora. As análises foram realizadas usando métodos de distância, máxima parcimônia, máxima verossimilhança e inferência bayesiana para cada subgênero em separado e para o conjunto total de dados. A monofilia dos subgêneros Astrophea, Decaloba e Passiflora foi confirmada, embora a monofilia do subgênero Deidamioides permaneça em aberto. Os resultados suportam, ainda, a existência de um quinto subgênero, Tryphostemmatoides. Análises realizadas para cada subgênero em separado demonstraram que esta estratégia é um método eficiente para a análise de marcadores com alta variabilidade entre os grupos, como é o caso dos subgêneros de Passiflora. ITS1 e ITS2 foram os marcadores moleculares mais informativos. Em geral, as superseções, seções e séries dos quatro subgêneros foram não-monofiléticas, sugerindo a necessidade de uma revisão cuidadosa dos caracteres morfológicos tipicamente usados em sua delimitação.The Passiflora L. (Passifloraceae) genus is composed of more than 520 species, classified in four subgenera: Astrophea, Decaloba, Deidamioides and Passiflora. Although some molecular phylogenetic analyses have been carried out in the last years, its infrasubgeneric classification remains open. With the intent to help to elucidate these issues and to characterize new phylogenetic markers for the Passiflora genus, analyses with sequences of the plastidial gene that codifies the biggest subunit of the RNA-polymerase enzyme of chloroplast (rpoC1), the internal transcribed spacer of nuclear ribosomal DNA (ITS1 and ITS2), and nad1 b-c intron of the mitochondrial genome have been carried out in 121 Passiflora’s species. The analyses have been conduced using distance, parsimony, maximum likelihood, and Bayesian methods for each subgenus separately and for the whole data. The Astrophea, Decaloba and Passiflora subgenera monophyly were confirmed, although the Deidamioides monophyly remains open. The results also support the existence of a fifth subgenus, Tryphostemmatoides. Separated analyses for each subgenus demonstrated to be an efficient method for analysis of markers with high variability between groups, as it is the case of the Passiflora’s subgenera. The ITS1 and ITS2 have been the more informative molecular markers. In general, the supersections, sections and series of the four subgenera were found non-monophyletic, suggesting the need of a careful revision of the morphologic characters typically used for their delimitation.application/pdfporPassiflora l.FilogeniaFilogenia de Passiflora L. (Passifloraceae) : questões infra-subgenéricasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de BiociênciasPrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia MolecularPorto Alegre, BR-RS2007mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT000626430.pdf.txt000626430.pdf.txtExtracted Texttext/plain175089http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/13704/2/000626430.pdf.txt374b5da2c7c2490c67564720c48e0f06MD52ORIGINAL000626430.pdfTexto completoapplication/pdf5869309http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/13704/1/000626430.pdfc923110129cffb8cede0c031b6b795a6MD5110183/137042020-02-28 04:05:48.357093oai:www.lume.ufrgs.br:10183/13704Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://lume.ufrgs.br/handle/10183/2PUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestlume@ufrgs.br||lume@ufrgs.bropendoar:18532020-02-28T07:05:48Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false |
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O gênero Passiflora L. (Passifloraceae) é composto por mais de 520 espécies, classificadas em quatro subgêneros: Astrophea, Decaloba, Deidamioides e Passiflora. Embora algumas análises filogenéticas tenham sido realizadas nos últimos anos, sua classificação infra-subgenérica permanece em aberto. Com o objetivo de auxiliar na elucidação destas questões e caracterizar novos marcadores filogenéticos para o gênero Passiflora, análises com seqüências do gene plastidial que codifica a maior subunidade da enzima RNA-polimerase de cloroplasto (rpoC1), dos espaçadores internos transcritos do DNA ribossomal nuclear (ITS1 e ITS2) e do íntron b-c do gene nad1 do genoma mitocondrial, foram desenvolvidas para 121 espécies de Passiflora. As análises foram realizadas usando métodos de distância, máxima parcimônia, máxima verossimilhança e inferência bayesiana para cada subgênero em separado e para o conjunto total de dados. A monofilia dos subgêneros Astrophea, Decaloba e Passiflora foi confirmada, embora a monofilia do subgênero Deidamioides permaneça em aberto. Os resultados suportam, ainda, a existência de um quinto subgênero, Tryphostemmatoides. Análises realizadas para cada subgênero em separado demonstraram que esta estratégia é um método eficiente para a análise de marcadores com alta variabilidade entre os grupos, como é o caso dos subgêneros de Passiflora. ITS1 e ITS2 foram os marcadores moleculares mais informativos. Em geral, as superseções, seções e séries dos quatro subgêneros foram não-monofiléticas, sugerindo a necessidade de uma revisão cuidadosa dos caracteres morfológicos tipicamente usados em sua delimitação. |
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