Evolução de genes do cluster Hoxd na ordem Cetartiodactyla

• Autor(a) principal: Alexandre, Brenda Godoy
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/272275
• topic: Cetáceos; Cetartiodactyla; Filogenética

A ordem Cetartiodactyla é composta por dois grupos de mamíferos que até recentemente não eram relacionados, Artiodactyla e Cetacea. Evidências morfológicas e moleculares sugerem esses dois grupos possuem um ancestral em comum. Os ancestrais dos cetáceos passaram por uma transição da vida terrestre para a aquática, adquirindo membros anteriores em forma de nadadeiras e posteriores ausentes. Os genes Hox possuem papel central na especificação dessas estruturas corporais. O cluster HoxD foi cooptado na evolução de tetrápodes para a função de regular o crescimento e padronização de membros. Também foi demonstrado que a acumulação e atividade transcricional de elementos transponíveis (TEs) inseridos nos genomas entre o cluster HoxD pode estar associada com a mudança de planos corporais. Assim, temos como objetivo contribuir para o melhor entendimento da história evolutiva em Cetartiodactyla, avaliando as relações entre os complexos de genes no cluster HoxD na evolução dos membros desse grupo. A partir de extrações de DNA de amostras de tecido de espécies ainda não analisadas, como Hippopotamus sp (espécie de artiodáctilo mais próximo aos cetáceos), foi amplificado e sequenciado o gene HoxD12. Foi construído por inferência Bayesiana uma árvore evolutiva a partir dessas sequências junto com sequências de mamíferos disponíveis no genbank, além disso foi analisada as taxas evolutivas em mamíferos e Cetartiodactyla. Também foram analisadas através da plataforma online RepeatMasker, sequências obtidas no banco de dados genbank entre os genes HoxD10 e Evx2 em mamíferos em busca de elementos transponíveis nessa região. Pela plataforma Alibaba foram feitas predições quanto a presença de sítios para fatores de transcrição nos elementos mais encontrados. Foram identificados 32 elementos transponíveis diferentes. Desses elementos, destacou-se os da família SINE/MIR, presentes predominantemente na região intergênica entre Evx2 e HoxD13. E foram encontrados principalmente 3 sítios para fatores de transcrição dentro de elementos MIR. A árvore filogenética correspondeu a dados da literatura, com Hippopotamus sp sendo mais relacionado com Cetacea do que Artiodactyla, além disso Cetacea apresentou maiores taxas evolutivas médias que Artiodactyla, apesar de serem em um menor número de sítios.