Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2009 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE |
Texto Completo: | http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6462 |
Resumo: | Heliconias are the most cultivated flowers in tropical floriculture of the Brazil northeast, due to its characteristics like beauty, exotic, exuberant colors and rusticity, but its yield has being affected by Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense. The present study had how objective to determine the genetic diversity existing between the isolates of F. oxysporum f. sp. cubense collected in heliconia and banana through the ITS region of rDNA using ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis), markers like RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). In the ARDRA analysis products amplified by ITS1 and ITS4 primers were digested by restriction enzymes Hae III, Xho I, Hind III and Eco IV by 37ºC. But only enzyme Hae III showed to be efficient a molecular marker, to analysis genetic diversity of F. oxysporum f. sp. cubense to RAPD marker was realized the Polymerase Chain Reaction (PCR) using tenoligonucleotides follow arbitrary up, only seven oligonucleotides generated a total 44 bands polymorphic with fragments varying from 100 pb to 700 pb. The two techniques used in the study genetic diversity showed high genetic variability of fungal, don’t related to with geographical region where were colleted the isolates. |
id |
URPE_32eef69b3908abb12f8e4af4477fa1f6 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:tede2:tede2/6462 |
network_acronym_str |
URPE |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE |
repository_id_str |
|
spelling |
RESENDE, Luciane VilelaCASTRO, Neilza ReisCÂMARA, Marcos Paz SaraivaCOÊLHO, Rildo Sartori BarbosaLIMA, Cristiano Souzahttp://lattes.cnpq.br/4664708257591783SILVA, Denise de Santana2017-02-20T13:53:01Z2009-01-23SILVA, Denise de Santana. Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD. 2009. 71 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife.http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6462Heliconias are the most cultivated flowers in tropical floriculture of the Brazil northeast, due to its characteristics like beauty, exotic, exuberant colors and rusticity, but its yield has being affected by Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense. The present study had how objective to determine the genetic diversity existing between the isolates of F. oxysporum f. sp. cubense collected in heliconia and banana through the ITS region of rDNA using ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis), markers like RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). In the ARDRA analysis products amplified by ITS1 and ITS4 primers were digested by restriction enzymes Hae III, Xho I, Hind III and Eco IV by 37ºC. But only enzyme Hae III showed to be efficient a molecular marker, to analysis genetic diversity of F. oxysporum f. sp. cubense to RAPD marker was realized the Polymerase Chain Reaction (PCR) using tenoligonucleotides follow arbitrary up, only seven oligonucleotides generated a total 44 bands polymorphic with fragments varying from 100 pb to 700 pb. The two techniques used in the study genetic diversity showed high genetic variability of fungal, don’t related to with geographical region where were colleted the isolates.As helicônias são as flores mais cultivadas dentro da floricultura tropical no Nordeste brasileiro, devido a características como beleza, exoticidade, cores exuberantes e rusticidade, porém a produção de várias espécies vem sendo afetada pela murcha de fusário, causada pelo fungo de Fusarium oxysporum f. sp. cubense. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar a diversidade genética existente entre os isolados de F.oxysporum f. sp. cubense, coletados em helicônias e bananeiras através da análise da região ITS do rDNA utilizando ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis) e marcadores do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Para a amplificação da região do rDNA, foram utilizados os primers ITS1 e ITS4 que foram digeridos pelas enzimas de restrição Hae III, Xho I, Hind III e Eco IV a 37ºC. Porém apenas a enzima Hae III, neste trabalho mostrou ser um marcador molecular eficiente,utilizada na técnica de ARDRA para estudos de diversidade genética dos isolados. Para o marcador RAPD realizou-se a Polymerase Chain Reaction (PCR) utilizando-se dez oligonucleotídeos de seqüência arbitrária, onde apenas sete oligonucleotídeos geraram um total de 44 bandas polimórficas com fragmentos que variaram de 100pb a 700pb. As duas técnicas utilizadas no estudo de diversidade genética evidenciaram alta variabilidade genética do fungo, não relacionada com as regiões geográficas onde foram coletados os isolados.Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-20T13:53:01Z No. of bitstreams: 1 Denise de Santana Silva.pdf: 550225 bytes, checksum: ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 (MD5)Made available in DSpace on 2017-02-20T13:53:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Denise de Santana Silva.pdf: 550225 bytes, checksum: ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 (MD5) Previous issue date: 2009-01-23Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPqapplication/pdfporUniversidade Federal Rural de PernambucoPrograma de Pós-Graduação em FitopatologiaUFRPEBrasilDepartamento de AgronomiaDiversidade genéticaFusarium oxysporumMurcha-de-fusárioFITOSSANIDADE::FITOPATOLOGIADiversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPDinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesis1343367238723626701600600600600-6800553879972229205-6207026424523013504-2555911436985713659info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPEinstname:Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)instacron:UFRPELICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82165http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/bitstream/tede2/6462/1/license.txtbd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468MD51ORIGINALDenise de Santana Silva.pdfDenise de Santana Silva.pdfapplication/pdf550225http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/bitstream/tede2/6462/2/Denise+de+Santana+Silva.pdfad8bfba40464a81bb730c91685eba898MD52tede2/64622023-10-18 09:48:40.037oai:tede2: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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede/PUBhttp://www.tede2.ufrpe.br:8080/oai/requestbdtd@ufrpe.br ||bdtd@ufrpe.bropendoar:2024-05-28T12:34:22.319639Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE - Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE)false |
dc.title.por.fl_str_mv |
Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD |
title |
Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD |
spellingShingle |
Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD SILVA, Denise de Santana Diversidade genética Fusarium oxysporum Murcha-de-fusário FITOSSANIDADE::FITOPATOLOGIA |
title_short |
Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD |
title_full |
Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD |
title_fullStr |
Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD |
title_full_unstemmed |
Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD |
title_sort |
Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD |
author |
SILVA, Denise de Santana |
author_facet |
SILVA, Denise de Santana |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
RESENDE, Luciane Vilela |
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv |
CASTRO, Neilza Reis |
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv |
CÂMARA, Marcos Paz Saraiva |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
COÊLHO, Rildo Sartori Barbosa |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
LIMA, Cristiano Souza |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/4664708257591783 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
SILVA, Denise de Santana |
contributor_str_mv |
RESENDE, Luciane Vilela CASTRO, Neilza Reis CÂMARA, Marcos Paz Saraiva COÊLHO, Rildo Sartori Barbosa LIMA, Cristiano Souza |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Diversidade genética Fusarium oxysporum Murcha-de-fusário |
topic |
Diversidade genética Fusarium oxysporum Murcha-de-fusário FITOSSANIDADE::FITOPATOLOGIA |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
FITOSSANIDADE::FITOPATOLOGIA |
description |
Heliconias are the most cultivated flowers in tropical floriculture of the Brazil northeast, due to its characteristics like beauty, exotic, exuberant colors and rusticity, but its yield has being affected by Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense. The present study had how objective to determine the genetic diversity existing between the isolates of F. oxysporum f. sp. cubense collected in heliconia and banana through the ITS region of rDNA using ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis), markers like RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). In the ARDRA analysis products amplified by ITS1 and ITS4 primers were digested by restriction enzymes Hae III, Xho I, Hind III and Eco IV by 37ºC. But only enzyme Hae III showed to be efficient a molecular marker, to analysis genetic diversity of F. oxysporum f. sp. cubense to RAPD marker was realized the Polymerase Chain Reaction (PCR) using tenoligonucleotides follow arbitrary up, only seven oligonucleotides generated a total 44 bands polymorphic with fragments varying from 100 pb to 700 pb. The two techniques used in the study genetic diversity showed high genetic variability of fungal, don’t related to with geographical region where were colleted the isolates. |
publishDate |
2009 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2009-01-23 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2017-02-20T13:53:01Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
SILVA, Denise de Santana. Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD. 2009. 71 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6462 |
identifier_str_mv |
SILVA, Denise de Santana. Diversidade genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense em helicônia utilizando ARDRA e RAPD. 2009. 71 f. Dissertação (Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia) - Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife. |
url |
http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6462 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.program.fl_str_mv |
1343367238723626701 |
dc.relation.confidence.fl_str_mv |
600 600 600 600 |
dc.relation.department.fl_str_mv |
-6800553879972229205 |
dc.relation.cnpq.fl_str_mv |
-6207026424523013504 |
dc.relation.sponsorship.fl_str_mv |
-2555911436985713659 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal Rural de Pernambuco |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFRPE |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
dc.publisher.department.fl_str_mv |
Departamento de Agronomia |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal Rural de Pernambuco |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE instname:Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) instacron:UFRPE |
instname_str |
Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) |
instacron_str |
UFRPE |
institution |
UFRPE |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/bitstream/tede2/6462/1/license.txt http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/bitstream/tede2/6462/2/Denise+de+Santana+Silva.pdf |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
bd3efa91386c1718a7f26a329fdcb468 ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE - Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) |
repository.mail.fl_str_mv |
bdtd@ufrpe.br ||bdtd@ufrpe.br |
_version_ |
1810102238158258176 |