Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira
| Autor(a) principal: | |
|---|---|
| Data de Publicação: | 2005 |
| Outros Autores: | , , , , |
| Tipo de documento: | Artigo |
| Idioma: | eng |
| Título da fonte: | Scientia Agrícola (Online) |
| Texto Completo: | https://www.revistas.usp.br/sa/article/view/22031 |
Resumo: | Um mapa genético proporciona o entendimento da organização do genoma e da localização cromossômica de marcadores e genes, e é importante para o mapeamento de locos controladores de características quantitativas (QTL). O objetivo deste estudo foi utilizar uma população brasileira para construir um mapa de ligação do cromossomo 1 da galinha. Oitenta marcadores microssatélites foram testados e 26 marcadores informativos foram genotipados em uma população F2 experimental, desenvolvida em duas gerações de um cruzamento entre uma linha macho de corte e uma linhagem de postura. Foram genotipados um total de 649 indivíduos F2 de sete famílias de irmãos completos com cerca de 95 F2 cada uma. A análise de ligação Multi-locus gerou um mapa do cromossomo 1 com 26 marcadores ordenados. A ordem dos locos foi em geral semelhante àquela de outros mapas de ligação publicados, exceto por duas discrepâncias: 1) a ordem entre os marcadores MCW10 e MCW208 foi invertida no presente mapa quando comparado com o mapa de ligação de Wageningen, 2) Os marcadores ADL234 e LEI68 que foram mapeados na mesma posição nas populações de Compton, East Lansing e Wageningen foram separados por uma distância de 5,9 centimorgans na presente população. O maior número de meioses informativas desta população pode explicar esta diferença. Este mapa é o primeiro passo no esforço de mapear QTL na população brasileira o qual pode também ser usado para complementar a informação do mapa consenso internacional da galinha. |
| id |
USP-18_2fcec8e3407d61b63f3a2cb8507c701e |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:revistas.usp.br:article/22031 |
| network_acronym_str |
USP-18 |
| network_name_str |
Scientia Agrícola (Online) |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira Genetic linkage map of chicken chromosome 1 from a Brazilian resource population microssatélitesfrangomapeamentomicrosatellitespoultrymapping Um mapa genético proporciona o entendimento da organização do genoma e da localização cromossômica de marcadores e genes, e é importante para o mapeamento de locos controladores de características quantitativas (QTL). O objetivo deste estudo foi utilizar uma população brasileira para construir um mapa de ligação do cromossomo 1 da galinha. Oitenta marcadores microssatélites foram testados e 26 marcadores informativos foram genotipados em uma população F2 experimental, desenvolvida em duas gerações de um cruzamento entre uma linha macho de corte e uma linhagem de postura. Foram genotipados um total de 649 indivíduos F2 de sete famílias de irmãos completos com cerca de 95 F2 cada uma. A análise de ligação Multi-locus gerou um mapa do cromossomo 1 com 26 marcadores ordenados. A ordem dos locos foi em geral semelhante àquela de outros mapas de ligação publicados, exceto por duas discrepâncias: 1) a ordem entre os marcadores MCW10 e MCW208 foi invertida no presente mapa quando comparado com o mapa de ligação de Wageningen, 2) Os marcadores ADL234 e LEI68 que foram mapeados na mesma posição nas populações de Compton, East Lansing e Wageningen foram separados por uma distância de 5,9 centimorgans na presente população. O maior número de meioses informativas desta população pode explicar esta diferença. Este mapa é o primeiro passo no esforço de mapear QTL na população brasileira o qual pode também ser usado para complementar a informação do mapa consenso internacional da galinha. A genetic map provides insight into genome organization and chromosomal location of markers and genes, and is important for quantitative trait loci (QTL) mapping. The objective of this study was to use a Brazilian resource population to construct a linkage map for chicken chromosome 1. Eighty microsatellite markers were tested and 26 informative markers were typed in an experimental F2 population developed by two generations of crossbreeding between a broiler sire line and a layer line. A total of 649 F2 individuals from seven full-sib families with about 95 F2 offspring each were genotyped. Multi-locus linkage analysis resulted in a chromosome 1 map of 26 ordered markers. Locus order was in general agreement with other published linkage maps, except for two discrepancies: 1) order of loci MCW10 and MCW208 was reversed in this map relative to the Wageningen linkage map, 2) markers ADL234 and LEI68, that were mapped to the same position in Compton, East Lansing and Wageningen populations, were separated by a distance of 5.9 centimorgans in our population. The higher number of informative meioses from our population could explain these differences. This map is an important first step in our effort to map QTL in the Brazilian chicken resource population, and complements the international consensus map information. Universidade de São Paulo. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz2005-01-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://www.revistas.usp.br/sa/article/view/2203110.1590/S0103-90162005000100003Scientia Agricola; v. 62 n. 1 (2005); 12-17Scientia Agricola; Vol. 62 Núm. 1 (2005); 12-17Scientia Agricola; Vol. 62 No. 1 (2005); 12-171678-992X0103-9016reponame:Scientia Agrícola (Online)instname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPenghttps://www.revistas.usp.br/sa/article/view/22031/24055Copyright (c) 2015 Scientia Agricolainfo:eu-repo/semantics/openAccessNones, KátiaLedur, Mônica CorrêaRuy, Deborah CleaBaron, Erica EliasMoura, Ana Silvia Alves Meira TavaresCoutinho, Luiz Lehmann2015-07-07T16:46:51Zoai:revistas.usp.br:article/22031Revistahttp://revistas.usp.br/sa/indexPUBhttps://old.scielo.br/oai/scielo-oai.phpscientia@usp.br||alleoni@usp.br1678-992X0103-9016opendoar:2015-07-07T16:46:51Scientia Agrícola (Online) - Universidade de São Paulo (USP)false |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira Genetic linkage map of chicken chromosome 1 from a Brazilian resource population |
| title |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira |
| spellingShingle |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira Nones, Kátia microssatélites frango mapeamento microsatellites poultry mapping |
| title_short |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira |
| title_full |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira |
| title_fullStr |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira |
| title_full_unstemmed |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira |
| title_sort |
Mapa genético de ligação do cromossomo 1 da galinha de uma população brasileira |
| author |
Nones, Kátia |
| author_facet |
Nones, Kátia Ledur, Mônica Corrêa Ruy, Deborah Clea Baron, Erica Elias Moura, Ana Silvia Alves Meira Tavares Coutinho, Luiz Lehmann |
| author_role |
author |
| author2 |
Ledur, Mônica Corrêa Ruy, Deborah Clea Baron, Erica Elias Moura, Ana Silvia Alves Meira Tavares Coutinho, Luiz Lehmann |
| author2_role |
author author author author author |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Nones, Kátia Ledur, Mônica Corrêa Ruy, Deborah Clea Baron, Erica Elias Moura, Ana Silvia Alves Meira Tavares Coutinho, Luiz Lehmann |
| dc.subject.por.fl_str_mv |
microssatélites frango mapeamento microsatellites poultry mapping |
| topic |
microssatélites frango mapeamento microsatellites poultry mapping |
| description |
Um mapa genético proporciona o entendimento da organização do genoma e da localização cromossômica de marcadores e genes, e é importante para o mapeamento de locos controladores de características quantitativas (QTL). O objetivo deste estudo foi utilizar uma população brasileira para construir um mapa de ligação do cromossomo 1 da galinha. Oitenta marcadores microssatélites foram testados e 26 marcadores informativos foram genotipados em uma população F2 experimental, desenvolvida em duas gerações de um cruzamento entre uma linha macho de corte e uma linhagem de postura. Foram genotipados um total de 649 indivíduos F2 de sete famílias de irmãos completos com cerca de 95 F2 cada uma. A análise de ligação Multi-locus gerou um mapa do cromossomo 1 com 26 marcadores ordenados. A ordem dos locos foi em geral semelhante àquela de outros mapas de ligação publicados, exceto por duas discrepâncias: 1) a ordem entre os marcadores MCW10 e MCW208 foi invertida no presente mapa quando comparado com o mapa de ligação de Wageningen, 2) Os marcadores ADL234 e LEI68 que foram mapeados na mesma posição nas populações de Compton, East Lansing e Wageningen foram separados por uma distância de 5,9 centimorgans na presente população. O maior número de meioses informativas desta população pode explicar esta diferença. Este mapa é o primeiro passo no esforço de mapear QTL na população brasileira o qual pode também ser usado para complementar a informação do mapa consenso internacional da galinha. |
| publishDate |
2005 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2005-01-01 |
| dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| format |
article |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://www.revistas.usp.br/sa/article/view/22031 10.1590/S0103-90162005000100003 |
| url |
https://www.revistas.usp.br/sa/article/view/22031 |
| identifier_str_mv |
10.1590/S0103-90162005000100003 |
| dc.language.iso.fl_str_mv |
eng |
| language |
eng |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
https://www.revistas.usp.br/sa/article/view/22031/24055 |
| dc.rights.driver.fl_str_mv |
Copyright (c) 2015 Scientia Agricola info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Copyright (c) 2015 Scientia Agricola |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade de São Paulo. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidade de São Paulo. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz |
| dc.source.none.fl_str_mv |
Scientia Agricola; v. 62 n. 1 (2005); 12-17 Scientia Agricola; Vol. 62 Núm. 1 (2005); 12-17 Scientia Agricola; Vol. 62 No. 1 (2005); 12-17 1678-992X 0103-9016 reponame:Scientia Agrícola (Online) instname:Universidade de São Paulo (USP) instacron:USP |
| instname_str |
Universidade de São Paulo (USP) |
| instacron_str |
USP |
| institution |
USP |
| reponame_str |
Scientia Agrícola (Online) |
| collection |
Scientia Agrícola (Online) |
| repository.name.fl_str_mv |
Scientia Agrícola (Online) - Universidade de São Paulo (USP) |
| repository.mail.fl_str_mv |
scientia@usp.br||alleoni@usp.br |
| _version_ |
1800222787359473664 |